More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0194 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1821  ABC transporter-related protein  63.96 
 
 
223 aa  304  6e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.373636  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  62.11 
 
 
228 aa  298  6e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  62.1 
 
 
227 aa  286  1e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0270  ABC transporter related  61.16 
 
 
228 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0756  ABC transporter related  60 
 
 
226 aa  284  9e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.688421  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1647  ABC transporter related  59.11 
 
 
226 aa  282  4.0000000000000003e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.204823  hitchhiker  0.000330012 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1252  ABC transporter related  59.55 
 
 
234 aa  276  1e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.252759 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  55.61 
 
 
224 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  58.82 
 
 
222 aa  268  4e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1025  ABC transporter related  56.62 
 
 
223 aa  262  4e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490239  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0060  ABC transporter related  56.16 
 
 
232 aa  259  2e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  54.42 
 
 
230 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  52 
 
 
225 aa  238  6.999999999999999e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  54.05 
 
 
228 aa  237  9e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  50.67 
 
 
241 aa  236  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  54.05 
 
 
225 aa  236  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  51.36 
 
 
228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  52.91 
 
 
240 aa  233  3e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  50 
 
 
230 aa  231  5e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  49.77 
 
 
226 aa  230  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  53.15 
 
 
225 aa  229  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  51.11 
 
 
241 aa  228  6e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  52.07 
 
 
236 aa  228  8e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  54.38 
 
 
222 aa  227  9e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  51.6 
 
 
240 aa  227  9e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  46.46 
 
 
653 aa  227  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  50.68 
 
 
246 aa  227  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  47.58 
 
 
232 aa  226  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  50 
 
 
230 aa  226  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  51.36 
 
 
234 aa  226  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  49.33 
 
 
241 aa  226  3e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  52.27 
 
 
235 aa  226  3e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  47.14 
 
 
239 aa  225  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  49.55 
 
 
241 aa  224  6e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  51.36 
 
 
234 aa  224  7e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  49.34 
 
 
241 aa  224  9e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 
228 aa  223  1e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  49.55 
 
 
241 aa  224  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  47.75 
 
 
642 aa  223  1e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  47.73 
 
 
264 aa  223  2e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  51.34 
 
 
266 aa  223  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  50.91 
 
 
234 aa  223  2e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  50.23 
 
 
291 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  51.61 
 
 
244 aa  222  3e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  51.14 
 
 
242 aa  222  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  49.1 
 
 
249 aa  222  4e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  49.1 
 
 
640 aa  222  4e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  49.1 
 
 
241 aa  221  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  48.66 
 
 
253 aa  221  6e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 
226 aa  221  7e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  49.55 
 
 
230 aa  221  8e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  48.66 
 
 
253 aa  221  8e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  50 
 
 
248 aa  221  9e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  49.09 
 
 
228 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  50.67 
 
 
256 aa  220  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  50 
 
 
241 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  48.64 
 
 
228 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  51.35 
 
 
235 aa  220  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  50.45 
 
 
238 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2453  ABC transporter related  49.78 
 
 
676 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  50.68 
 
 
234 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  50.68 
 
 
234 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  49.11 
 
 
253 aa  219  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  52.29 
 
 
255 aa  219  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  48.88 
 
 
236 aa  219  3e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  48.4 
 
 
260 aa  219  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  49.78 
 
 
226 aa  219  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  50.67 
 
 
226 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  49.56 
 
 
653 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  49.32 
 
 
238 aa  218  5e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 
226 aa  218  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 
226 aa  218  6e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  50.22 
 
 
226 aa  218  6e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 
226 aa  218  6e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 
226 aa  218  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  50.22 
 
 
226 aa  218  6e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.66 
 
 
647 aa  218  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1893  ABC transporter related  51.75 
 
 
238 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472097  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  51.1 
 
 
252 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  50.22 
 
 
233 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  49.55 
 
 
233 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  49.78 
 
 
226 aa  217  8.999999999999998e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  50.23 
 
 
238 aa  217  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  49.78 
 
 
226 aa  217  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  47.75 
 
 
642 aa  217  1e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  47.14 
 
 
644 aa  217  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  50.22 
 
 
653 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  49.11 
 
 
233 aa  216  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  49.55 
 
 
236 aa  216  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  49.33 
 
 
226 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1707  ABC transporter related  50.88 
 
 
238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  49.77 
 
 
252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  46.7 
 
 
233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  46.4 
 
 
230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  47.75 
 
 
224 aa  215  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  47.75 
 
 
224 aa  215  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3917  ABC transporter related  50.67 
 
 
232 aa  215  5e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2115  ABC transporter related  48.65 
 
 
647 aa  214  7e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  49.78 
 
 
668 aa  214  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>