More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0179 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0179  AbrB family transcriptional regulator  100 
 
 
328 aa  662    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4355  AbrB family transcriptional regulator  94.51 
 
 
329 aa  603  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0277  ABC transporter related protein  65.82 
 
 
334 aa  422  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  54.76 
 
 
563 aa  310  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  53.07 
 
 
565 aa  306  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4171  ABC transporter related  54.64 
 
 
339 aa  292  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0956  ABC transporter related protein  48.41 
 
 
346 aa  279  4e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.121187  hitchhiker  0.00122332 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1768  ABC transporter related  49.48 
 
 
315 aa  275  7e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2804  ABC transporter related protein  52.14 
 
 
366 aa  272  5.000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.403241  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26110  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  49.82 
 
 
340 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.157431  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1556  ABC transporter related  48.01 
 
 
317 aa  236  3e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.798364  normal  0.757355 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0791  ABC transporter related  42.19 
 
 
311 aa  216  4e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  45.95 
 
 
235 aa  211  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  48.64 
 
 
252 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  48.95 
 
 
230 aa  210  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  48.2 
 
 
220 aa  209  4e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  45.98 
 
 
246 aa  207  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  47.35 
 
 
238 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  44.59 
 
 
237 aa  206  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  44.78 
 
 
230 aa  207  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  42.86 
 
 
238 aa  207  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  48.64 
 
 
225 aa  206  6e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0772  ABC transporter related  47.01 
 
 
238 aa  205  9e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  46.9 
 
 
250 aa  205  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  49.32 
 
 
234 aa  204  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  49.32 
 
 
234 aa  204  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  45.91 
 
 
248 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  45.91 
 
 
248 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  47.81 
 
 
253 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1473  ABC-transporter ATP binding protein  46.12 
 
 
233 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3144  ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 
233 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3258  ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 
233 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.219344  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  45.37 
 
 
232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2086  ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 
233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  47.81 
 
 
253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2377  ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 
233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1113  ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 
233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1392  ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 
233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  46.22 
 
 
233 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2345  ABC transporter, ATP-binding protein  45.69 
 
 
233 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  44.55 
 
 
229 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  45.25 
 
 
234 aa  198  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.82 
 
 
236 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  44.55 
 
 
242 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.98 
 
 
233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  42.98 
 
 
233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.98 
 
 
233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  47.75 
 
 
239 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  42.98 
 
 
233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.98 
 
 
233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  45.98 
 
 
237 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.98 
 
 
233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.98 
 
 
233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  45.61 
 
 
228 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  46.81 
 
 
236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.98 
 
 
233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.98 
 
 
233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  44.25 
 
 
225 aa  197  3e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.98 
 
 
233 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.98 
 
 
233 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  44.84 
 
 
241 aa  196  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.98 
 
 
233 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.98 
 
 
233 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.98 
 
 
233 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  44.44 
 
 
239 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  45.21 
 
 
230 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  42.24 
 
 
242 aa  196  5.000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  44.05 
 
 
232 aa  196  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  45.7 
 
 
240 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  43.64 
 
 
224 aa  196  6e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  45.7 
 
 
240 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  46.58 
 
 
224 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  45.16 
 
 
287 aa  195  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1047  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  43.23 
 
 
233 aa  195  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  46.61 
 
 
248 aa  194  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0939  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.23 
 
 
233 aa  195  1e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2730  ABC transporter related  48 
 
 
225 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  42.99 
 
 
228 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  47.27 
 
 
239 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  46.12 
 
 
237 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  45 
 
 
252 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  44.2 
 
 
242 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  44.69 
 
 
277 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  44.83 
 
 
228 aa  194  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  41.59 
 
 
226 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  45.21 
 
 
226 aa  194  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  46.45 
 
 
235 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  42.98 
 
 
229 aa  194  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  43.95 
 
 
233 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  44 
 
 
252 aa  193  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  43.18 
 
 
230 aa  193  4e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  43.35 
 
 
256 aa  193  4e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  43.18 
 
 
229 aa  192  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.44 
 
 
236 aa  192  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  46.36 
 
 
225 aa  192  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0335  ABC transporter related  46.44 
 
 
248 aa  192  5e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000938347 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  41.59 
 
 
226 aa  192  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  45 
 
 
254 aa  192  6e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2827  ABC transporter related  44.1 
 
 
243 aa  192  6e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  44.64 
 
 
222 aa  192  6e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>