More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2210 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  100 
 
 		 234 aa  460  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  93.16 
 
 		 234 aa  410  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2188  ABC transporter, ATP-binding protein  70.43 
 
 		 232 aa  290  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  62.44 
 
 		 235 aa  271  5.000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3044  ABC transporter related  64.13 
 
 		 239 aa  258  8e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2431  ABC transporter related  64.29 
 
 		 246 aa  256  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823093  decreased coverage  0.000192607 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  62.84 
 
 		 229 aa  254  9e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  57.33 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  56.16 
 
 		 237 aa  249  4e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1273  ABC transporter, ATPase subunit  60.09 
 
 		 229 aa  241  7.999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1311  ABC transporter related  62.39 
 
 		 243 aa  236  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.355082  normal  0.912591 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  48.91 
 
 		 228 aa  217  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  50.75 
 
 		 231 aa  214  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  50.67 
 
 		 228 aa  211  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  45.22 
 
 		 233 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1913  ABC transporter related  50.45 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.598774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  47.81 
 
 		 245 aa  209  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  46.4 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  50 
 
 		 235 aa  205  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 221 aa  205  6e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  49.1 
 
 		 239 aa  204  7e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  49.12 
 
 		 234 aa  204  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  48.92 
 
 		 235 aa  204  8e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6161  ABC transporter related  50.67 
 
 		 237 aa  204  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.455478  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  45.09 
 
 		 234 aa  204  9e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  48.39 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  48.39 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0335  ABC transporter related  48.89 
 
 		 248 aa  203  1e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000938347 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  48.46 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  46.67 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  45.74 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  43.89 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  47.32 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  49.77 
 
 		 238 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  47.71 
 
 		 243 aa  202  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1445  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.51 
 
 		 247 aa  202  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5219  ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 237 aa  202  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  46.12 
 
 		 234 aa  201  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1018  ABC transporter related  49.11 
 
 		 228 aa  201  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0550  ABC transporter related  47.71 
 
 		 224 aa  201  6e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0929666  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  45.91 
 
 		 229 aa  201  6e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1657  ABC transporter related  47 
 
 		 258 aa  201  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.75 
 
 		 236 aa  201  8e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02303  putative Lipoprotein releasing system ATP-binding component of ABC transporter  47.96 
 
 		 232 aa  201  8e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00446  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  50 
 
 		 228 aa  201  9e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3115  ABC transporter related protein  50 
 
 		 228 aa  201  9e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  46.76 
 
 		 229 aa  201  9e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00451  hypothetical protein  50 
 
 		 228 aa  201  9e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0573  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50 
 
 		 228 aa  201  9e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  47.3 
 
 		 251 aa  201  9e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50 
 
 		 228 aa  201  9e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1906  ABC transporter related  50.22 
 
 		 233 aa  201  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3121  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50 
 
 		 228 aa  201  9e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114112 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0430  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50 
 
 		 228 aa  201  9e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.811195  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0599  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50 
 
 		 228 aa  201  9e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.962067 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  47.71 
 
 		 240 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 249 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0544  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50 
 
 		 228 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  43.78 
 
 		 220 aa  201  9.999999999999999e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  43.5 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.51 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1836  ABC transporter related  49.78 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.175217 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  48.02 
 
 		 235 aa  200  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 240 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 240 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  51.16 
 
 		 236 aa  200  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0165  heme exporter protein CcmA  46.61 
 
 		 221 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1695  ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 227 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  46.05 
 
 		 228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  48.02 
 
 		 248 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  46.36 
 
 		 233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1356  ABC transporter related  50.22 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0383519  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2730  ABC transporter related  47.56 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  47.58 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  47.98 
 
 		 238 aa  199  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  43.5 
 
 		 388 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2803  ABC transporter related  45.95 
 
 		 232 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0893633  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  47.44 
 
 		 233 aa  198  6e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  46.05 
 
 		 234 aa  198  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  50.24 
 
 		 254 aa  198  7e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  43.81 
 
 		 250 aa  198  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  43.91 
 
 		 230 aa  198  7e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2566  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 247 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0799342  normal  0.05105 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  50.23 
 
 		 240 aa  197  7.999999999999999e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  46.36 
 
 		 242 aa  197  7.999999999999999e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  45.09 
 
 		 230 aa  197  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0222  ABC transporter related  45.05 
 
 		 232 aa  197  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  42.79 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  49.55 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  49.08 
 
 		 244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1567  ABC lipoprotein efflux pump, ATPase subunit  47.06 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  43.44 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  46.75 
 
 		 244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  48.91 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  44.75 
 
 		 222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  46.67 
 
 		 253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  46.22 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0303  ABC transporter related  45.5 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0537962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>