More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0324 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  100 
 
 
235 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  69.26 
 
 
245 aa  340  1e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  70.82 
 
 
240 aa  334  5.999999999999999e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  72.22 
 
 
236 aa  331  6e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  67.24 
 
 
238 aa  319  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  66.09 
 
 
251 aa  318  5e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  66.09 
 
 
244 aa  316  2e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  67.24 
 
 
254 aa  315  5e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  67.83 
 
 
248 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  67.83 
 
 
244 aa  310  1e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  65.37 
 
 
248 aa  309  2.9999999999999997e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  67.39 
 
 
244 aa  308  4e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  63.95 
 
 
234 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  64.94 
 
 
251 aa  306  3e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 
240 aa  304  8.000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  68.86 
 
 
236 aa  304  9.000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  68.24 
 
 
241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  65.25 
 
 
238 aa  301  6.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  64.5 
 
 
238 aa  299  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  63.4 
 
 
235 aa  299  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  62.22 
 
 
245 aa  295  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  62.23 
 
 
244 aa  295  6e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  62.23 
 
 
234 aa  294  7e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  62.23 
 
 
234 aa  294  7e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  61.04 
 
 
244 aa  293  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  61.9 
 
 
245 aa  294  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  62.5 
 
 
243 aa  291  5e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  62.34 
 
 
253 aa  289  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  61.9 
 
 
253 aa  287  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  62.13 
 
 
240 aa  286  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  62.34 
 
 
245 aa  284  8e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  58.72 
 
 
235 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  57.27 
 
 
236 aa  283  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  61.37 
 
 
234 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  63.11 
 
 
241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  65.65 
 
 
250 aa  279  3e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  57.14 
 
 
236 aa  266  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  55.66 
 
 
239 aa  251  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  52.97 
 
 
236 aa  246  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  51.08 
 
 
234 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  49.14 
 
 
233 aa  241  9e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  51.27 
 
 
236 aa  239  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
233 aa  235  4e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
233 aa  235  4e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.86 
 
 
233 aa  234  7e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  48.28 
 
 
234 aa  234  8e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  50.43 
 
 
233 aa  232  3e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  47.64 
 
 
234 aa  231  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  50.22 
 
 
234 aa  227  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  46.98 
 
 
233 aa  226  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  48.71 
 
 
233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  50.43 
 
 
233 aa  224  7e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  48.28 
 
 
235 aa  223  2e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  46.55 
 
 
233 aa  223  3e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  46.98 
 
 
236 aa  222  4.9999999999999996e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  47.62 
 
 
232 aa  221  7e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  44.4 
 
 
233 aa  220  9.999999999999999e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  47.23 
 
 
233 aa  217  1e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  47.77 
 
 
233 aa  217  1e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 
233 aa  214  8e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  45.45 
 
 
232 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  44.59 
 
 
232 aa  210  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  42.31 
 
 
604 aa  209  3e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.65 
 
 
233 aa  207  9e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.87 
 
 
236 aa  205  4e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  48.18 
 
 
247 aa  205  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  50.46 
 
 
243 aa  202  3e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  46.82 
 
 
255 aa  202  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  49.33 
 
 
222 aa  201  6e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  48.52 
 
 
707 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  50.23 
 
 
277 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  40.34 
 
 
345 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  46.82 
 
 
225 aa  199  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  48.92 
 
 
234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  44.05 
 
 
230 aa  198  7e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  43.88 
 
 
252 aa  198  7e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  48.65 
 
 
230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  50 
 
 
230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  42.42 
 
 
240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  46.19 
 
 
252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  44.12 
 
 
240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  48.65 
 
 
288 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  45.22 
 
 
232 aa  196  3e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  42.92 
 
 
225 aa  196  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  46.67 
 
 
232 aa  196  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  44.25 
 
 
248 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  47.3 
 
 
244 aa  195  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  46.19 
 
 
256 aa  195  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  45.37 
 
 
241 aa  194  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  48.6 
 
 
255 aa  194  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  44.1 
 
 
228 aa  194  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  42.98 
 
 
237 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  42.74 
 
 
235 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  48.7 
 
 
250 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  44.21 
 
 
230 aa  194  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  46.82 
 
 
239 aa  193  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  48.6 
 
 
255 aa  193  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  42.98 
 
 
251 aa  193  2e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  43.3 
 
 
238 aa  193  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  45.76 
 
 
234 aa  193  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>