More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2302 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  100 
 
 		 243 aa  492  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  74.68 
 
 		 238 aa  352  2e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  73.82 
 
 		 240 aa  352  4e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  73.16 
 
 		 254 aa  337  8e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  68.85 
 
 		 245 aa  322  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  69.49 
 
 		 253 aa  319  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  66.23 
 
 		 244 aa  311  6.999999999999999e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  62.66 
 
 		 244 aa  308  2.9999999999999997e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  64.81 
 
 		 238 aa  308  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  63.64 
 
 		 253 aa  308  4e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  65.37 
 
 		 251 aa  307  9e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  64.66 
 
 		 248 aa  304  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  66.67 
 
 		 240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  64.66 
 
 		 244 aa  301  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  62.34 
 
 		 248 aa  301  8.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  64.22 
 
 		 244 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  64.66 
 
 		 251 aa  295  4e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  61.9 
 
 		 234 aa  295  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  66.24 
 
 		 240 aa  294  9e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  62.77 
 
 		 238 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  62.5 
 
 		 235 aa  291  5e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  61.04 
 
 		 244 aa  289  3e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  62.23 
 
 		 245 aa  289  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  60.49 
 
 		 241 aa  288  5.0000000000000004e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  62.34 
 
 		 245 aa  288  7e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  64.02 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  61.47 
 
 		 234 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  65.37 
 
 		 236 aa  286  2e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  59.05 
 
 		 236 aa  283  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  60.78 
 
 		 235 aa  281  6.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  58.87 
 
 		 234 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  58.87 
 
 		 234 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  59.13 
 
 		 245 aa  276  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  59.05 
 
 		 235 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  60.78 
 
 		 236 aa  270  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  59.67 
 
 		 250 aa  262  4e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  54.04 
 
 		 236 aa  260  1e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  53.25 
 
 		 236 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  50.87 
 
 		 233 aa  255  4e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  52.17 
 
 		 236 aa  252  4.0000000000000004e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  53.81 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  53.81 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  50.43 
 
 		 239 aa  244  6e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  49.57 
 
 		 234 aa  243  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  51.95 
 
 		 234 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  48.7 
 
 		 233 aa  238  5.999999999999999e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  50.64 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  48.71 
 
 		 234 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  49.11 
 
 		 233 aa  235  5.0000000000000005e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  46.98 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  49.13 
 
 		 233 aa  233  3e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  48.88 
 
 		 234 aa  233  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  47.83 
 
 		 233 aa  232  5e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  52.02 
 
 		 233 aa  231  1e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  44.78 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  47.39 
 
 		 232 aa  225  6e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  47.39 
 
 		 233 aa  224  7e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  46.78 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  50.67 
 
 		 233 aa  223  3e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  48.92 
 
 		 236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.73 
 
 		 236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  49.78 
 
 		 233 aa  218  6e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  47.11 
 
 		 230 aa  215  5e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  44.44 
 
 		 233 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.48 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  48.64 
 
 		 243 aa  206  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  46.61 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  45.91 
 
 		 229 aa  201  9e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  44.69 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  47.71 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  46.33 
 
 		 227 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4336  ABC transporter related  47.79 
 
 		 268 aa  199  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  45 
 
 		 229 aa  198  6e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  45.45 
 
 		 229 aa  197  9e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  46.9 
 
 		 232 aa  197  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  38.46 
 
 		 604 aa  195  6e-49  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  43.78 
 
 		 226 aa  195  6e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  47.49 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  41.98 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  45.02 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  46.79 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  45.91 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  46.61 
 
 		 222 aa  193  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  47.47 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  47.03 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  49.32 
 
 		 248 aa  192  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  48.91 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  39.06 
 
 		 345 aa  192  4e-48  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  45.95 
 
 		 293 aa  192  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  46.08 
 
 		 229 aa  192  4e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  44.78 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0335  ABC transporter related  44.92 
 
 		 248 aa  191  7e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000938347 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  47.53 
 
 		 224 aa  191  7e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1252  ABC transporter related  46.32 
 
 		 234 aa  191  8e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.252759 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0456  ABC transporter related  46.58 
 
 		 229 aa  191  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  47.03 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  46.4 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  43.48 
 
 		 231 aa  189  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0437  ABC transporter related protein  45.66 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  42.67 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>