More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4336 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4336  ABC transporter related  100 
 
 		 268 aa  524  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0968  ABC transporter related  73.08 
 
 		 254 aa  330  1e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0806647  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  54.72 
 
 		 236 aa  204  8e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  45.41 
 
 		 233 aa  202  5e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  48.91 
 
 		 254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  47.79 
 
 		 243 aa  199  6e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  52.29 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  49.13 
 
 		 240 aa  196  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  40.93 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  52.97 
 
 		 248 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  50 
 
 		 240 aa  196  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  49.57 
 
 		 251 aa  195  8.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  53.3 
 
 		 236 aa  195  8.000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  48.24 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  46.75 
 
 		 236 aa  194  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  47.84 
 
 		 244 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  40.84 
 
 		 319 aa  192  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  44.35 
 
 		 234 aa  193  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  43.04 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  50.46 
 
 		 236 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  46.23 
 
 		 235 aa  192  4e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  52.58 
 
 		 238 aa  191  7e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  45 
 
 		 225 aa  191  8e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0437  ABC transporter related protein  47.58 
 
 		 229 aa  191  8e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0456  ABC transporter related  47.58 
 
 		 229 aa  191  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  48.64 
 
 		 235 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  49.15 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  44.55 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  49.15 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  51.43 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  46.95 
 
 		 244 aa  190  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  47.5 
 
 		 240 aa  189  5e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  44 
 
 		 239 aa  189  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 238 aa  189  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  46.64 
 
 		 643 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  46.15 
 
 		 245 aa  188  7e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  44.9 
 
 		 248 aa  188  7e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  43.98 
 
 		 234 aa  188  8e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  44.84 
 
 		 656 aa  188  9e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  44.78 
 
 		 654 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  48.15 
 
 		 236 aa  188  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  50.7 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  43.17 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  49.57 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  50.47 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  46.22 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  44.84 
 
 		 657 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  47.88 
 
 		 238 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  49.09 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  44.44 
 
 		 666 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  49.09 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  45.45 
 
 		 661 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  47.3 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  48.87 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  43.78 
 
 		 220 aa  186  5e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  47.11 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  45.12 
 
 		 233 aa  185  6e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  43.18 
 
 		 286 aa  185  6e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  41.53 
 
 		 644 aa  185  7e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  45.69 
 
 		 245 aa  185  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0217  ABC transporter related protein  48.17 
 
 		 234 aa  185  8e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.941766  normal  0.16938 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1657  ABC transporter related  46.49 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.49 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.85 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.52 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  44.89 
 
 		 671 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3176  ABC transporter related  51.15 
 
 		 269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0415179 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  43.72 
 
 		 653 aa  183  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  45.71 
 
 		 455 aa  182  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 		 234 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  45.5 
 
 		 654 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  41.86 
 
 		 228 aa  183  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  43.3 
 
 		 663 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  47.34 
 
 		 239 aa  183  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  41.74 
 
 		 241 aa  183  3e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  47.96 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  43.09 
 
 		 650 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  42.41 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  45.74 
 
 		 228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  44.39 
 
 		 657 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2196  ABC transporter related  45.98 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.439888  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  42.86 
 
 		 663 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  46.43 
 
 		 248 aa  182  6e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  43.06 
 
 		 227 aa  182  6e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  45.25 
 
 		 235 aa  182  6e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  44.55 
 
 		 234 aa  182  7e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  39.47 
 
 		 241 aa  182  7e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  45.09 
 
 		 238 aa  182  7e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  43.16 
 
 		 244 aa  181  9.000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  45.71 
 
 		 445 aa  181  9.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  47.19 
 
 		 244 aa  181  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  44.34 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 		 345 aa  181  1e-44  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4838  ABC transporter related  43.18 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  42.47 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  46.09 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  46.19 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>