More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4213 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  100 
 
 		 245 aa  493  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  63.48 
 
 		 236 aa  302  4.0000000000000003e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  63.48 
 
 		 245 aa  301  5.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  58.44 
 
 		 244 aa  300  1e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  63.04 
 
 		 240 aa  297  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  60.26 
 
 		 235 aa  296  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  63.04 
 
 		 251 aa  295  5e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  63.91 
 
 		 240 aa  294  8e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  60.91 
 
 		 244 aa  294  9e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  60.91 
 
 		 244 aa  293  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  61.7 
 
 		 236 aa  293  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  62.76 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  61.74 
 
 		 248 aa  288  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  61.86 
 
 		 241 aa  288  6e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  61.74 
 
 		 238 aa  287  9e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  60.43 
 
 		 235 aa  287  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  59.57 
 
 		 235 aa  285  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  57.79 
 
 		 251 aa  283  1.0000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  56.96 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  60 
 
 		 254 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  60.87 
 
 		 238 aa  282  4.0000000000000003e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  58.26 
 
 		 238 aa  280  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  57.26 
 
 		 243 aa  279  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 245 aa  277  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  56.9 
 
 		 240 aa  271  7e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  57.89 
 
 		 245 aa  270  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  59.13 
 
 		 253 aa  270  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  57.39 
 
 		 253 aa  267  1e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  56.09 
 
 		 248 aa  265  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  56.09 
 
 		 234 aa  265  7e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  56.09 
 
 		 234 aa  265  7e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  53.68 
 
 		 236 aa  264  1e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  53.72 
 
 		 244 aa  262  4e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  61.5 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  53.95 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  53.91 
 
 		 234 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  50.87 
 
 		 236 aa  247  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  51.32 
 
 		 236 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  47.41 
 
 		 233 aa  242  5e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  49.33 
 
 		 233 aa  241  1e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  48.88 
 
 		 236 aa  238  9e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  49.77 
 
 		 239 aa  237  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  49.78 
 
 		 233 aa  236  3e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  49.34 
 
 		 234 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  49.33 
 
 		 233 aa  235  5.0000000000000005e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  47.53 
 
 		 234 aa  234  9e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  47.98 
 
 		 233 aa  232  5e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  47.98 
 
 		 233 aa  232  5e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  44.4 
 
 		 234 aa  231  7.000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  46.09 
 
 		 232 aa  231  7.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  47.39 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.43 
 
 		 233 aa  226  3e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  44.4 
 
 		 233 aa  226  3e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  45.26 
 
 		 233 aa  225  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  50.94 
 
 		 233 aa  222  4.9999999999999996e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  47.09 
 
 		 233 aa  221  6e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  44.35 
 
 		 233 aa  221  9e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  46.19 
 
 		 233 aa  221  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  44.98 
 
 		 232 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  51.14 
 
 		 247 aa  216  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  44.59 
 
 		 235 aa  217  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.91 
 
 		 233 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.86 
 
 		 236 aa  214  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  50.46 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  47.39 
 
 		 236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  43.42 
 
 		 232 aa  209  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  51.43 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  50.23 
 
 		 277 aa  204  8e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  49.55 
 
 		 239 aa  204  8e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  46.82 
 
 		 228 aa  204  9e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  47.6 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  46.98 
 
 		 243 aa  203  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  40.52 
 
 		 345 aa  203  2e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.94 
 
 		 280 aa  202  3e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  41.63 
 
 		 604 aa  202  4e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  49.77 
 
 		 255 aa  201  8e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  49.77 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  47.56 
 
 		 455 aa  198  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  45.91 
 
 		 228 aa  198  6e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  46.82 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  46.51 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  48.86 
 
 		 445 aa  196  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  47.16 
 
 		 255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.64 
 
 		 274 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  43.44 
 
 		 240 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  49.32 
 
 		 266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0133  ABC Transporter  39.58 
 
 		 300 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  45.06 
 
 		 263 aa  195  5.000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  41.26 
 
 		 230 aa  195  5.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  50.23 
 
 		 264 aa  194  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  44.93 
 
 		 230 aa  194  9e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  46.12 
 
 		 248 aa  194  9e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  46.12 
 
 		 248 aa  194  9e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  45.05 
 
 		 225 aa  194  9e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  48.84 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  47.06 
 
 		 217 aa  194  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  45.34 
 
 		 268 aa  193  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  46.72 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  48.34 
 
 		 253 aa  194  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  47.91 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>