More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1693 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  100 
 
 		 232 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.63 
 
 		 236 aa  264  1e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  53.45 
 
 		 236 aa  261  6e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  52.59 
 
 		 232 aa  258  6e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  53.04 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  51.52 
 
 		 234 aa  254  6e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  52.16 
 
 		 232 aa  254  7e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  48.71 
 
 		 236 aa  250  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  49.57 
 
 		 251 aa  245  4e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  49.35 
 
 		 234 aa  244  8e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.43 
 
 		 233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  50 
 
 		 233 aa  241  1e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  49.35 
 
 		 253 aa  238  5e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  50.43 
 
 		 233 aa  238  5e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  50.43 
 
 		 233 aa  238  5e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  48.48 
 
 		 233 aa  238  5.999999999999999e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  49.78 
 
 		 239 aa  238  8e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  49.14 
 
 		 248 aa  237  9e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  50 
 
 		 244 aa  237  1e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  51.29 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  50.64 
 
 		 243 aa  237  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  49.57 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  49.12 
 
 		 238 aa  235  5.0000000000000005e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  46.55 
 
 		 245 aa  234  6e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  50 
 
 		 254 aa  234  6e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  48.92 
 
 		 235 aa  234  6e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.62 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  46.96 
 
 		 233 aa  231  5e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  49.13 
 
 		 233 aa  231  6e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  46.09 
 
 		 245 aa  231  8.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  48.48 
 
 		 244 aa  230  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  48.7 
 
 		 233 aa  230  2e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  47.64 
 
 		 345 aa  229  2e-59  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  45.89 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  48.48 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  48.48 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  49.57 
 
 		 244 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  49.57 
 
 		 244 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  49.78 
 
 		 238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  49.33 
 
 		 245 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  44.87 
 
 		 604 aa  224  1e-57  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  46.75 
 
 		 236 aa  223  1e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  49.12 
 
 		 253 aa  223  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  48.18 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  47.19 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  48.18 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  48.44 
 
 		 236 aa  222  4e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  47.62 
 
 		 235 aa  221  6e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  47.62 
 
 		 234 aa  221  7e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  49.55 
 
 		 240 aa  221  7e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  46.32 
 
 		 234 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  47.41 
 
 		 240 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  47.11 
 
 		 236 aa  220  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  48.7 
 
 		 248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  44.83 
 
 		 233 aa  218  5e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  45.45 
 
 		 251 aa  216  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  45.69 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  50.22 
 
 		 241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  45.78 
 
 		 241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  46.22 
 
 		 235 aa  213  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  45.65 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  46.49 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  50 
 
 		 245 aa  212  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  44.83 
 
 		 244 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  44.4 
 
 		 236 aa  209  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0133  ABC Transporter  44.44 
 
 		 300 aa  208  5e-53  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  47.03 
 
 		 232 aa  207  8e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  44.64 
 
 		 234 aa  205  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  48.23 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  42.92 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  43.44 
 
 		 229 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  44.65 
 
 		 243 aa  197  9e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  42.15 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf119  ABC transporter ATP-binding protein  42.01 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  45.16 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  43.89 
 
 		 230 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  47.53 
 
 		 230 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  43.5 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  43.64 
 
 		 235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1311  ABC transporter related  46.08 
 
 		 243 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.355082  normal  0.912591 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2803  ABC transporter related  42.6 
 
 		 232 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0893633  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  42.47 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  41.63 
 
 		 242 aa  195  4.0000000000000005e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  45.21 
 
 		 229 aa  195  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0303  ABC transporter related  42.6 
 
 		 232 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0537962  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0222  ABC transporter related  41.63 
 
 		 232 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  43.5 
 
 		 231 aa  195  6e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0230  ABC transporter related  41.63 
 
 		 232 aa  194  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000298 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0284  ABC transporter related  41.63 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  hitchhiker  0.00000395766 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3402  ABC efflux pump, ATPase subunit  41.63 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0029159  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  44.55 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  42.6 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  43.05 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  43.32 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0206  ABC transporter related  42.15 
 
 		 232 aa  192  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  unclonable  0.000000000007713 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  47.03 
 
 		 225 aa  192  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  47.03 
 
 		 225 aa  192  5e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  43.78 
 
 		 258 aa  191  7e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  41.23 
 
 		 233 aa  191  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 224 aa  189  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>