More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3711 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  100 
 
 
235 aa  474  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  84.23 
 
 
234 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  82.38 
 
 
230 aa  374  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0222  ABC transporter related  83.33 
 
 
232 aa  370  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0230  ABC transporter related  82.89 
 
 
232 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000298 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3402  ABC efflux pump, ATPase subunit  83.33 
 
 
232 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0029159  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0284  ABC transporter related  82.46 
 
 
232 aa  363  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  hitchhiker  0.00000395766 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0303  ABC transporter related  82.02 
 
 
232 aa  361  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0537962  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2803  ABC transporter related  81.58 
 
 
232 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0893633  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0206  ABC transporter related  84.07 
 
 
232 aa  353  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  unclonable  0.000000000007713 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  74.67 
 
 
230 aa  333  1e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  70.09 
 
 
231 aa  329  3e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  68.26 
 
 
231 aa  322  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  68.58 
 
 
231 aa  321  5e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  70.14 
 
 
228 aa  321  7e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  68.61 
 
 
229 aa  317  7.999999999999999e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  68.16 
 
 
229 aa  315  3e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  63.04 
 
 
235 aa  295  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  62.77 
 
 
268 aa  291  6e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  60.63 
 
 
229 aa  280  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  55.31 
 
 
235 aa  276  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  58.37 
 
 
240 aa  274  8e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  57.01 
 
 
231 aa  274  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  59.73 
 
 
229 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  57.78 
 
 
232 aa  272  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2260  ABC transporter related  56.05 
 
 
232 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549292  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1620  ABC transporter, ATPase subunit  55.11 
 
 
241 aa  258  7e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  52.73 
 
 
225 aa  254  8e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2582  ABC transporter related  55.56 
 
 
234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  52.53 
 
 
239 aa  228  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  48.02 
 
 
242 aa  226  2e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  51.15 
 
 
222 aa  224  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  46.43 
 
 
237 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  48.92 
 
 
237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  45.7 
 
 
230 aa  217  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  44.98 
 
 
240 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  45.37 
 
 
235 aa  215  4e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2391  ABC transporter related  49.09 
 
 
253 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  45.33 
 
 
226 aa  214  8e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  45.33 
 
 
226 aa  214  8e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  45.33 
 
 
226 aa  214  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  45.33 
 
 
226 aa  214  8e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  45.33 
 
 
226 aa  214  8e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  45.25 
 
 
238 aa  214  9e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  45.33 
 
 
226 aa  214  9e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  46.19 
 
 
230 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  45.33 
 
 
226 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  45.33 
 
 
226 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  45.09 
 
 
233 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  44.75 
 
 
246 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  45.21 
 
 
220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  44.89 
 
 
226 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  44.89 
 
 
226 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  47 
 
 
229 aa  212  4.9999999999999996e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  44.1 
 
 
248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  46.36 
 
 
266 aa  211  5.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  44.89 
 
 
226 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  45.21 
 
 
240 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  40.89 
 
 
293 aa  211  9e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  45.09 
 
 
239 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 
236 aa  210  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  45.3 
 
 
653 aa  210  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0118  ABC transporter, ATP-binding protein  43.29 
 
 
256 aa  210  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  45.91 
 
 
221 aa  209  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0119  ABC transporter  43.29 
 
 
256 aa  209  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.393598  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  46.19 
 
 
255 aa  210  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  44.44 
 
 
226 aa  209  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  45.95 
 
 
240 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  45.95 
 
 
240 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  43.3 
 
 
224 aa  208  6e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  47.5 
 
 
229 aa  207  8e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  45.79 
 
 
228 aa  207  8e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  46.43 
 
 
241 aa  207  8e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  44.34 
 
 
230 aa  207  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  45.29 
 
 
226 aa  207  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  44.59 
 
 
241 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  46.12 
 
 
228 aa  207  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
224 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3285  ABC transporter related  47.96 
 
 
249 aa  206  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  43.3 
 
 
249 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  46.61 
 
 
237 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  44.34 
 
 
225 aa  206  2e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  46.61 
 
 
237 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
224 aa  206  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
224 aa  206  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
224 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  44.8 
 
 
239 aa  206  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  44.2 
 
 
232 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  48.4 
 
 
253 aa  206  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  46.46 
 
 
258 aa  206  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  45.5 
 
 
240 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  44.69 
 
 
653 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  42.86 
 
 
224 aa  206  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  44.29 
 
 
234 aa  205  4e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  44.14 
 
 
388 aa  206  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.88 
 
 
648 aa  205  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
246 aa  205  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3939  ABC transporter, ATPase subunit  46.15 
 
 
236 aa  205  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.920707  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  43.89 
 
 
235 aa  206  4e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  44.29 
 
 
234 aa  205  4e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>