More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1792 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 234 aa  470  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  85.9 
 
 		 230 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  84.23 
 
 		 235 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2803  ABC transporter related  83.11 
 
 		 232 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0893633  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0230  ABC transporter related  81.58 
 
 		 232 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000298 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0222  ABC transporter related  81.58 
 
 		 232 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0303  ABC transporter related  82.67 
 
 		 232 aa  354  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0537962  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0284  ABC transporter related  82.22 
 
 		 232 aa  354  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  hitchhiker  0.00000395766 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3402  ABC efflux pump, ATPase subunit  82.67 
 
 		 232 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0029159  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0206  ABC transporter related  81.82 
 
 		 232 aa  342  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  unclonable  0.000000000007713 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  72.07 
 
 		 231 aa  341  5e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  72.65 
 
 		 231 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  74.89 
 
 		 230 aa  334  7e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  70.27 
 
 		 231 aa  329  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  71.49 
 
 		 228 aa  328  4e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  68.58 
 
 		 229 aa  323  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  68.58 
 
 		 229 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  65.32 
 
 		 235 aa  301  6.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  63.88 
 
 		 268 aa  295  4e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  62.22 
 
 		 229 aa  291  6e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  56.77 
 
 		 235 aa  279  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  60.36 
 
 		 240 aa  278  6e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  59.64 
 
 		 229 aa  277  9e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  57.53 
 
 		 231 aa  269  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  58.59 
 
 		 232 aa  270  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1620  ABC transporter, ATPase subunit  57.66 
 
 		 241 aa  261  6.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  53.6 
 
 		 225 aa  260  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2260  ABC transporter related  53.81 
 
 		 232 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2582  ABC transporter related  55 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  52.04 
 
 		 239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  48.67 
 
 		 230 aa  229  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 222 aa  226  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  48.88 
 
 		 242 aa  226  2e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  47.03 
 
 		 240 aa  226  3e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  49.09 
 
 		 221 aa  224  8e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  49.09 
 
 		 226 aa  224  8e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  49.09 
 
 		 226 aa  224  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  49.09 
 
 		 226 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  49.09 
 
 		 226 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  49.09 
 
 		 226 aa  224  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  49.09 
 
 		 226 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  49.09 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  49.09 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  48.39 
 
 		 229 aa  221  6e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  45.74 
 
 		 246 aa  221  6e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  48.18 
 
 		 226 aa  221  8e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  45.91 
 
 		 220 aa  221  9e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  48.64 
 
 		 226 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  48.18 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  46.54 
 
 		 237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  48.64 
 
 		 226 aa  219  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  47 
 
 		 226 aa  218  7e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  47.03 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  46.82 
 
 		 230 aa  216  4e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  46.08 
 
 		 228 aa  214  7e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  45.29 
 
 		 238 aa  214  9e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  47.32 
 
 		 255 aa  214  9e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  45.37 
 
 		 240 aa  213  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  46.61 
 
 		 239 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  46.61 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  45.66 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  46.43 
 
 		 288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  45.09 
 
 		 232 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  47.66 
 
 		 228 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  44.64 
 
 		 239 aa  212  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  45.05 
 
 		 238 aa  212  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  47.49 
 
 		 266 aa  212  4.9999999999999996e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  45.21 
 
 		 224 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  45.21 
 
 		 224 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  45.21 
 
 		 224 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  44.75 
 
 		 224 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  47.71 
 
 		 241 aa  211  5.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  45.41 
 
 		 230 aa  211  7.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  47.22 
 
 		 241 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  46.58 
 
 		 242 aa  211  7.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2391  ABC transporter related  48.42 
 
 		 253 aa  211  9e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  47.73 
 
 		 248 aa  210  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  42.79 
 
 		 240 aa  210  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0366  ABC-type transport system, ATPase component PhnL  46.82 
 
 		 245 aa  210  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  44.05 
 
 		 225 aa  209  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  44.29 
 
 		 224 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  44.75 
 
 		 232 aa  210  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  44.05 
 
 		 225 aa  209  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  47.3 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  46.67 
 
 		 653 aa  209  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  45.25 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  46.49 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  45.18 
 
 		 388 aa  209  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  45 
 
 		 248 aa  208  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  42.6 
 
 		 225 aa  208  4e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  48.4 
 
 		 259 aa  208  5e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  44.83 
 
 		 240 aa  208  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  46.12 
 
 		 235 aa  208  6e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  41.1 
 
 		 293 aa  208  7e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.2 
 
 		 280 aa  207  8e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  45.16 
 
 		 230 aa  207  8e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>