More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2260 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2260  ABC transporter related  100 
 
 		 232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2582  ABC transporter related  92.61 
 
 		 234 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  57.66 
 
 		 235 aa  275  6e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  57.99 
 
 		 231 aa  269  2.9999999999999997e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  55.75 
 
 		 232 aa  265  5e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  54.55 
 
 		 231 aa  263  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  53.98 
 
 		 229 aa  260  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  55.56 
 
 		 230 aa  259  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  55.91 
 
 		 229 aa  259  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  54.55 
 
 		 229 aa  256  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  56.05 
 
 		 235 aa  255  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  53.98 
 
 		 229 aa  255  4e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  54.11 
 
 		 231 aa  254  6e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  53.81 
 
 		 234 aa  251  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0303  ABC transporter related  55.65 
 
 		 232 aa  251  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0537962  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  54.09 
 
 		 235 aa  251  6e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  53.57 
 
 		 268 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  54.02 
 
 		 228 aa  250  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2803  ABC transporter related  55.22 
 
 		 232 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0893633  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0284  ABC transporter related  55.22 
 
 		 232 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  hitchhiker  0.00000395766 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0206  ABC transporter related  55.6 
 
 		 232 aa  246  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  unclonable  0.000000000007713 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  53.1 
 
 		 231 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0222  ABC transporter related  53.68 
 
 		 232 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0230  ABC transporter related  53.68 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000298 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3402  ABC efflux pump, ATPase subunit  54.35 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0029159  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  53.42 
 
 		 230 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  48.64 
 
 		 225 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  50 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1620  ABC transporter, ATPase subunit  53.33 
 
 		 241 aa  225  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 221 aa  205  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  42.52 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  44.91 
 
 		 240 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  45.83 
 
 		 239 aa  198  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  46.61 
 
 		 252 aa  198  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  44.95 
 
 		 238 aa  195  4.0000000000000005e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  41.23 
 
 		 238 aa  195  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  45.66 
 
 		 233 aa  194  8.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3917  ABC transporter related  47.71 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  40.54 
 
 		 226 aa  192  5e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  44.49 
 
 		 233 aa  191  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  42.92 
 
 		 235 aa  191  8e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  45.29 
 
 		 240 aa  191  9e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0015  ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 		 228 aa  190  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  45 
 
 		 222 aa  190  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  46.92 
 
 		 277 aa  189  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  40.72 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  42.34 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1330  ABC transporter related  41.2 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.514657  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  40.89 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  44.64 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  42.73 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  42.73 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  42.73 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  42.01 
 
 		 248 aa  189  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3708  ABC transporter-related protein  47.14 
 
 		 254 aa  189  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00747361 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  41.18 
 
 		 241 aa  189  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  42.73 
 
 		 224 aa  188  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  42.73 
 
 		 224 aa  188  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3549  ABC transporter related  45.26 
 
 		 255 aa  188  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  42.73 
 
 		 224 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  42.73 
 
 		 224 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1413  ABC transporter ATPase  45 
 
 		 233 aa  188  5.999999999999999e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.82 
 
 		 225 aa  188  5.999999999999999e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  42.73 
 
 		 224 aa  188  7e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  44.49 
 
 		 238 aa  187  8e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  42.73 
 
 		 224 aa  187  8e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  39.56 
 
 		 293 aa  187  9e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  40.55 
 
 		 230 aa  187  9e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  40.45 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0816  ABC-type transport system, ATPase component  43.18 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1310  ABC transporter related  45.26 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272111  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  44.14 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  41.63 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  41.63 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  40.97 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  41.63 
 
 		 240 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  41.44 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  46.5 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  43.06 
 
 		 238 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  43.18 
 
 		 226 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  41.7 
 
 		 226 aa  187  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2730  ABC transporter related  45.98 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3506  ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  44.05 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  44.55 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2478  ABC transporter ATP-binding protein  40.37 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.866087  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  44.29 
 
 		 225 aa  186  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  37.73 
 
 		 227 aa  185  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3004  ABC transporter ATP-binding protein  40.37 
 
 		 222 aa  185  5e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000190264  hitchhiker  0.00000432285 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  43.48 
 
 		 247 aa  185  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2576  ABC transporter related  40.37 
 
 		 222 aa  185  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  40.18 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  40.09 
 
 		 230 aa  185  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  39.55 
 
 		 319 aa  185  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  41.96 
 
 		 240 aa  185  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  40.64 
 
 		 229 aa  185  6e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  39.63 
 
 		 228 aa  185  6e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  45.07 
 
 		 226 aa  185  6e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  44.34 
 
 		 248 aa  185  6e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>