More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2392 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  100 
 
 		 277 aa  540  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  78.41 
 
 		 274 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  75.41 
 
 		 271 aa  375  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  75.61 
 
 		 258 aa  371  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  75.3 
 
 		 268 aa  372  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  71.67 
 
 		 250 aa  339  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  71.19 
 
 		 280 aa  338  4e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  69.96 
 
 		 247 aa  335  7e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  70.09 
 
 		 258 aa  330  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  65.57 
 
 		 256 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  67.54 
 
 		 255 aa  325  3e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  64.08 
 
 		 266 aa  324  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  66.11 
 
 		 455 aa  323  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  66.38 
 
 		 277 aa  323  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  67.11 
 
 		 255 aa  322  4e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  64.71 
 
 		 264 aa  322  4e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  66.53 
 
 		 258 aa  322  6e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  65.1 
 
 		 258 aa  321  6e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  63.71 
 
 		 253 aa  318  6e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  67.39 
 
 		 262 aa  318  6e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  66.38 
 
 		 263 aa  318  7.999999999999999e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  64.66 
 
 		 256 aa  317  9e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  65.34 
 
 		 252 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  63.71 
 
 		 255 aa  314  9.999999999999999e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  72.57 
 
 		 257 aa  311  4.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  64.46 
 
 		 255 aa  309  4e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  67.86 
 
 		 445 aa  309  4e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  66.81 
 
 		 253 aa  305  5.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  62.98 
 
 		 259 aa  303  2.0000000000000002e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  64.66 
 
 		 264 aa  301  7.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  64.56 
 
 		 245 aa  299  3e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  63.39 
 
 		 279 aa  299  4e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  68.69 
 
 		 250 aa  293  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  57.87 
 
 		 291 aa  291  1e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  66.23 
 
 		 302 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  62.5 
 
 		 244 aa  285  4e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  59.83 
 
 		 261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  62.61 
 
 		 247 aa  284  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  62.17 
 
 		 288 aa  283  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  64.37 
 
 		 258 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  63.6 
 
 		 312 aa  280  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  61.45 
 
 		 255 aa  277  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  60.76 
 
 		 293 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  57.85 
 
 		 279 aa  267  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  57.14 
 
 		 245 aa  267  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  58.94 
 
 		 255 aa  264  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  55.56 
 
 		 266 aa  258  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  59.15 
 
 		 257 aa  256  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  59.11 
 
 		 252 aa  256  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  56.83 
 
 		 243 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  60.08 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  53.72 
 
 		 269 aa  251  9.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  55.32 
 
 		 279 aa  250  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  51.57 
 
 		 253 aa  249  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  58.8 
 
 		 256 aa  248  6e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  59.34 
 
 		 249 aa  245  4.9999999999999997e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  51.38 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  54.08 
 
 		 255 aa  240  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  48.62 
 
 		 230 aa  239  4e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  58.62 
 
 		 241 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  57.42 
 
 		 243 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  56.68 
 
 		 249 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  54.22 
 
 		 271 aa  233  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  58.45 
 
 		 248 aa  232  5e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  50.7 
 
 		 225 aa  230  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  54.63 
 
 		 272 aa  229  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  47 
 
 		 225 aa  229  4e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  54.19 
 
 		 244 aa  228  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  50.67 
 
 		 240 aa  224  8e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  49.77 
 
 		 230 aa  224  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  54.74 
 
 		 247 aa  223  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  45.22 
 
 		 240 aa  224  2e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  50 
 
 		 653 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  48.61 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  49.37 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  47.25 
 
 		 227 aa  223  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  50.44 
 
 		 229 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  51.58 
 
 		 222 aa  221  9e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  59.7 
 
 		 224 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  51.13 
 
 		 229 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  45.41 
 
 		 226 aa  219  5e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  51.05 
 
 		 239 aa  218  6e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  53.78 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  51.82 
 
 		 231 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  47.13 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  51.85 
 
 		 228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  50.46 
 
 		 228 aa  215  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  48.44 
 
 		 227 aa  214  9e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  59.19 
 
 		 249 aa  214  9e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  50.68 
 
 		 224 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  50.46 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  50 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  51.36 
 
 		 231 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  47.98 
 
 		 235 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3627  ABC transporter related  54.38 
 
 		 238 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  51.56 
 
 		 233 aa  213  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  48.05 
 
 		 233 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  50 
 
 		 237 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  50 
 
 		 228 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  51.15 
 
 		 228 aa  210  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>