More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2247 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  100 
 
 		 247 aa  491  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  69.4 
 
 		 243 aa  317  9e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  65.82 
 
 		 271 aa  285  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  60.85 
 
 		 243 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  61.64 
 
 		 245 aa  272  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  66.05 
 
 		 224 aa  269  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  54.01 
 
 		 264 aa  264  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  57.09 
 
 		 252 aa  261  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  57.85 
 
 		 253 aa  261  6.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  60.83 
 
 		 253 aa  260  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  57.2 
 
 		 244 aa  258  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  54.07 
 
 		 262 aa  255  6e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  54.24 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  53.16 
 
 		 455 aa  251  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  56.78 
 
 		 266 aa  251  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  58.01 
 
 		 280 aa  248  6e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  54.13 
 
 		 255 aa  248  7e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  52.87 
 
 		 269 aa  248  9e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  56.31 
 
 		 261 aa  246  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  59.82 
 
 		 256 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  51.49 
 
 		 277 aa  246  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  54.71 
 
 		 445 aa  246  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  53.68 
 
 		 266 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  52.89 
 
 		 253 aa  243  3e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  52.44 
 
 		 247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  51.05 
 
 		 279 aa  242  3.9999999999999997e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  54.74 
 
 		 277 aa  242  5e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  50.82 
 
 		 291 aa  241  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  52.79 
 
 		 255 aa  240  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  58.08 
 
 		 258 aa  239  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  53.39 
 
 		 258 aa  240  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  51.91 
 
 		 256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  58.18 
 
 		 268 aa  238  4e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  54.81 
 
 		 279 aa  238  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  53.59 
 
 		 250 aa  238  6.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  56.43 
 
 		 249 aa  238  6.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  52.36 
 
 		 255 aa  238  8e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  56.28 
 
 		 269 aa  235  5.0000000000000005e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  48.16 
 
 		 263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  53.81 
 
 		 271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  50.41 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  50.83 
 
 		 256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  53.14 
 
 		 258 aa  232  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  51.29 
 
 		 264 aa  231  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  56.64 
 
 		 272 aa  231  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  57.56 
 
 		 277 aa  230  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  52.38 
 
 		 255 aa  230  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  57.5 
 
 		 244 aa  230  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  56.3 
 
 		 241 aa  230  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  50.82 
 
 		 279 aa  229  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  51.63 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  48.97 
 
 		 258 aa  228  5e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  51.93 
 
 		 258 aa  227  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  51.05 
 
 		 274 aa  226  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  56.5 
 
 		 250 aa  226  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  56.58 
 
 		 302 aa  226  3e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  55.92 
 
 		 245 aa  226  3e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  51.05 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  56.16 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  51.48 
 
 		 288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  51.67 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  52.79 
 
 		 255 aa  216  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  53.11 
 
 		 312 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  51.65 
 
 		 255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  52.19 
 
 		 257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  54.7 
 
 		 247 aa  211  9e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  45.37 
 
 		 228 aa  209  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  56.07 
 
 		 249 aa  209  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  51.61 
 
 		 248 aa  206  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  46.76 
 
 		 229 aa  205  5e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  43.32 
 
 		 230 aa  205  6e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  45.85 
 
 		 248 aa  202  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  46.3 
 
 		 225 aa  202  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  49.79 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  46.19 
 
 		 241 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  46.88 
 
 		 252 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2319  ABC transporter related  51.69 
 
 		 245 aa  195  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  46.82 
 
 		 231 aa  194  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  42.13 
 
 		 226 aa  194  7e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  43.44 
 
 		 227 aa  194  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  45.33 
 
 		 225 aa  192  6e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  45.91 
 
 		 231 aa  191  8e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  46.58 
 
 		 228 aa  191  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  47.96 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  42.4 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0836  peptide ABC transporter ATPase  43.6 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.506405  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  41.1 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  46.67 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  38.72 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  43.75 
 
 		 388 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  44.07 
 
 		 277 aa  188  8e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  42.92 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  42.92 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0021  ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1252  ABC transporter related  47.69 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.252759 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  45.95 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  39.3 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  43.75 
 
 		 251 aa  186  4e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0493  ABC transporter related  41.82 
 
 		 259 aa  185  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>