More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4049 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  100 
 
 		 250 aa  484  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  66.22 
 
 		 247 aa  300  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  72.99 
 
 		 268 aa  298  5e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  70.51 
 
 		 250 aa  297  8e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  66.96 
 
 		 258 aa  296  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  67.76 
 
 		 252 aa  295  4e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  64.38 
 
 		 256 aa  294  8e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  68.69 
 
 		 277 aa  293  1e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  67.3 
 
 		 271 aa  291  9e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  63.35 
 
 		 259 aa  290  1e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  65.58 
 
 		 258 aa  289  3e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  65.57 
 
 		 455 aa  287  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  61.78 
 
 		 264 aa  284  9e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  64.52 
 
 		 291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  65.12 
 
 		 262 aa  282  5.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  64.52 
 
 		 258 aa  281  6.000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  62.22 
 
 		 266 aa  281  9e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  66.35 
 
 		 280 aa  280  2e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  60.96 
 
 		 263 aa  280  2e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  65.3 
 
 		 253 aa  277  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  64.15 
 
 		 255 aa  277  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  59.73 
 
 		 279 aa  276  2e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  62.05 
 
 		 255 aa  276  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  70.19 
 
 		 257 aa  276  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  60.44 
 
 		 256 aa  275  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  63.64 
 
 		 274 aa  275  5e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  63.68 
 
 		 264 aa  275  5e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  67.92 
 
 		 258 aa  274  9e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  62.74 
 
 		 445 aa  272  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  61.86 
 
 		 255 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  61.4 
 
 		 255 aa  271  8.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  62.67 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  59.36 
 
 		 277 aa  267  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  62.21 
 
 		 288 aa  267  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  62.79 
 
 		 244 aa  265  4e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  61.01 
 
 		 261 aa  265  4e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  61.28 
 
 		 302 aa  262  4.999999999999999e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  62.67 
 
 		 247 aa  260  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  58.72 
 
 		 279 aa  254  9e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  61.5 
 
 		 266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  65.57 
 
 		 312 aa  253  3e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  60.26 
 
 		 243 aa  248  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  59.15 
 
 		 269 aa  248  7e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  63.47 
 
 		 258 aa  246  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  57.41 
 
 		 245 aa  245  4e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  60.18 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  58.06 
 
 		 252 aa  242  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  61.29 
 
 		 256 aa  241  6e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  61.11 
 
 		 255 aa  239  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  56.94 
 
 		 253 aa  239  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  60.83 
 
 		 224 aa  239  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  58.15 
 
 		 272 aa  238  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  59.91 
 
 		 257 aa  236  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  61.5 
 
 		 245 aa  236  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  62.98 
 
 		 277 aa  234  7e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  58.64 
 
 		 243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  55.96 
 
 		 293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  59.35 
 
 		 249 aa  231  7.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  49.54 
 
 		 228 aa  229  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  54.47 
 
 		 271 aa  225  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  59.91 
 
 		 241 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  54.13 
 
 		 244 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  45.21 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  50.45 
 
 		 240 aa  218  5e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  59.19 
 
 		 249 aa  216  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  52 
 
 		 279 aa  214  9e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  47.22 
 
 		 227 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  51.3 
 
 		 250 aa  212  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  50.64 
 
 		 248 aa  211  9e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  47.22 
 
 		 225 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  45.62 
 
 		 225 aa  211  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  45.37 
 
 		 227 aa  209  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  43.72 
 
 		 230 aa  209  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  43.69 
 
 		 226 aa  209  4e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  55.75 
 
 		 247 aa  208  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  45.05 
 
 		 255 aa  208  8e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  44.26 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  48.65 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  47.69 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  52.34 
 
 		 239 aa  205  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  44.29 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  43.72 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  46.08 
 
 		 246 aa  203  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  47.75 
 
 		 653 aa  202  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  56.48 
 
 		 247 aa  201  6e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  49.54 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  52.86 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  45.83 
 
 		 227 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  45.87 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  47.92 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  44.75 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  47.47 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  42.67 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  44.87 
 
 		 242 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  46.26 
 
 		 249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  50.46 
 
 		 255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  46.54 
 
 		 266 aa  199  5e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  44.34 
 
 		 293 aa  198  6e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  48.34 
 
 		 224 aa  198  6e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  42.29 
 
 		 234 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>