More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3006 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  100 
 
 		 257 aa  515  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  64.17 
 
 		 266 aa  316  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  62.66 
 
 		 262 aa  315  4e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  63.71 
 
 		 455 aa  312  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  61.67 
 
 		 256 aa  311  7.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  61.37 
 
 		 255 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  60.08 
 
 		 264 aa  301  5.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  63.6 
 
 		 445 aa  298  4e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  58.66 
 
 		 277 aa  298  7e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  65.79 
 
 		 253 aa  298  9e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  60.52 
 
 		 255 aa  297  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  61.11 
 
 		 250 aa  295  5e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  58.4 
 
 		 247 aa  290  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  62.29 
 
 		 258 aa  290  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  58.51 
 
 		 291 aa  285  4e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  60.43 
 
 		 253 aa  284  8e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  59.48 
 
 		 255 aa  281  9e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  58.12 
 
 		 252 aa  281  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  57.98 
 
 		 255 aa  279  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  60 
 
 		 256 aa  279  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  63.6 
 
 		 257 aa  279  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  58.12 
 
 		 258 aa  278  5e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  61.06 
 
 		 280 aa  277  1e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  64.44 
 
 		 256 aa  275  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  57.14 
 
 		 259 aa  274  8e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  59.74 
 
 		 258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  59.15 
 
 		 277 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  59.73 
 
 		 261 aa  273  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  58.67 
 
 		 264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  56.09 
 
 		 263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  62.66 
 
 		 258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  57.68 
 
 		 247 aa  272  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  57.08 
 
 		 243 aa  271  9e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  58.37 
 
 		 288 aa  267  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  57.74 
 
 		 268 aa  266  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  54 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  57.64 
 
 		 252 aa  265  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  60.94 
 
 		 312 aa  264  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  53.75 
 
 		 266 aa  261  8e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.69 
 
 		 274 aa  260  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  56.58 
 
 		 271 aa  258  8e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  59.23 
 
 		 255 aa  257  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  53.47 
 
 		 269 aa  257  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  57.14 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  53.88 
 
 		 279 aa  256  3e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  56.97 
 
 		 302 aa  255  4e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  58.44 
 
 		 293 aa  255  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  59.91 
 
 		 250 aa  255  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  57.67 
 
 		 253 aa  251  8.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  58.85 
 
 		 255 aa  249  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  55.27 
 
 		 245 aa  248  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  56.89 
 
 		 271 aa  247  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  49.81 
 
 		 279 aa  242  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  59.11 
 
 		 249 aa  243  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  53.36 
 
 		 244 aa  241  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  56.44 
 
 		 243 aa  240  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  56.05 
 
 		 272 aa  236  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  47 
 
 		 230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  53.27 
 
 		 245 aa  232  5e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  45.96 
 
 		 240 aa  231  9e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  51.98 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  55.41 
 
 		 277 aa  229  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  57.14 
 
 		 249 aa  226  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  58.42 
 
 		 224 aa  222  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  47.25 
 
 		 225 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  45.62 
 
 		 228 aa  221  9e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  52.04 
 
 		 239 aa  219  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  53.91 
 
 		 241 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.42 
 
 		 269 aa  218  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  48.07 
 
 		 279 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  44.04 
 
 		 226 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  44.64 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  55.45 
 
 		 247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  58.59 
 
 		 249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0841  ABC transporter, ATP-binding protein  40.51 
 
 		 255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.598404  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2319  ABC transporter related  52.97 
 
 		 245 aa  212  5.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  52.19 
 
 		 247 aa  211  7.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  47.93 
 
 		 235 aa  211  9e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  47.14 
 
 		 240 aa  210  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  51.71 
 
 		 235 aa  208  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  48.46 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  43.12 
 
 		 225 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  46.35 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  42.51 
 
 		 255 aa  206  4e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0836  peptide ABC transporter ATPase  46.05 
 
 		 251 aa  205  5e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.506405  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  41.63 
 
 		 223 aa  205  5e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  44.89 
 
 		 238 aa  205  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0118  ABC transporter, ATP-binding protein  40.43 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0119  ABC transporter  40.43 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.393598  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  39.15 
 
 		 293 aa  203  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  47 
 
 		 239 aa  202  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  44.55 
 
 		 237 aa  202  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  48.7 
 
 		 233 aa  202  5e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  48.42 
 
 		 231 aa  201  8e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  43.12 
 
 		 227 aa  201  8e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  49.55 
 
 		 224 aa  201  9e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  48.72 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  45.15 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  45.41 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  42.92 
 
 		 246 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>