More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0849 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  100 
 
 		 271 aa  529  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  68.94 
 
 		 243 aa  319  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  65.82 
 
 		 247 aa  285  8e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  59.49 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  58.65 
 
 		 243 aa  273  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  55.7 
 
 		 262 aa  272  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  52.49 
 
 		 264 aa  271  9e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  56.12 
 
 		 266 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  58.96 
 
 		 244 aa  266  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  54.01 
 
 		 455 aa  266  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  56.72 
 
 		 253 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  60.09 
 
 		 256 aa  265  7e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  58.67 
 
 		 253 aa  265  7e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  67.65 
 
 		 224 aa  265  8e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  57.74 
 
 		 245 aa  264  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  53.01 
 
 		 266 aa  262  4e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  55.08 
 
 		 253 aa  262  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  51.01 
 
 		 277 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  54.43 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  57.46 
 
 		 280 aa  259  4e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  55.92 
 
 		 279 aa  259  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  53.78 
 
 		 445 aa  257  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  55.19 
 
 		 250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  55.74 
 
 		 264 aa  253  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  60.08 
 
 		 241 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  51.81 
 
 		 259 aa  252  4.0000000000000004e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  52.54 
 
 		 258 aa  251  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  55.26 
 
 		 261 aa  250  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  55.25 
 
 		 258 aa  250  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  53.53 
 
 		 258 aa  249  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  56.9 
 
 		 302 aa  249  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  54.67 
 
 		 255 aa  248  7e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  52.14 
 
 		 255 aa  248  7e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  49.79 
 
 		 263 aa  248  8e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  54.92 
 
 		 255 aa  246  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  55.9 
 
 		 272 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  56.4 
 
 		 257 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  53.39 
 
 		 244 aa  244  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  50.83 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  49.79 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  58.33 
 
 		 312 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  53.85 
 
 		 249 aa  243  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 279 aa  243  3e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  51.71 
 
 		 291 aa  242  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  56.16 
 
 		 268 aa  242  5e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  51.97 
 
 		 247 aa  241  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  51.9 
 
 		 247 aa  240  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  55.3 
 
 		 277 aa  240  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  53.95 
 
 		 258 aa  238  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  56.96 
 
 		 277 aa  238  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  55.9 
 
 		 257 aa  238  6.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  53.72 
 
 		 255 aa  237  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.77 
 
 		 245 aa  235  7e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  49.8 
 
 		 274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  53.75 
 
 		 269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  57.69 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  50.22 
 
 		 255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  54.47 
 
 		 250 aa  232  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  49.16 
 
 		 258 aa  232  5e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  48.4 
 
 		 252 aa  231  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  50.22 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  56.28 
 
 		 249 aa  230  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  50.59 
 
 		 288 aa  229  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  51.72 
 
 		 271 aa  228  8e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  56.78 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  49.79 
 
 		 252 aa  223  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  43.95 
 
 		 230 aa  220  1.9999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  48.95 
 
 		 279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  48.39 
 
 		 225 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  50.61 
 
 		 255 aa  219  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  51.54 
 
 		 293 aa  217  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  45.21 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  52.32 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3482  ABC transporter related protein  48.43 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.782021  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  44.91 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  50.68 
 
 		 239 aa  211  7e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  46.43 
 
 		 232 aa  208  9e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  44.2 
 
 		 234 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  45.28 
 
 		 225 aa  206  4e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  42.86 
 
 		 240 aa  205  6e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  48.4 
 
 		 221 aa  204  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2196  ABC transporter related  47 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.439888  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  45.41 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  44.2 
 
 		 234 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  51.56 
 
 		 233 aa  204  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  45.41 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  44.64 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  46.54 
 
 		 241 aa  203  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  42.34 
 
 		 235 aa  202  4e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1427  ABC transporter related  43.89 
 
 		 241 aa  202  5e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0799296  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  41.59 
 
 		 238 aa  202  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  50 
 
 		 565 aa  201  8e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  42.2 
 
 		 226 aa  201  8e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  41.7 
 
 		 242 aa  201  8e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  45.66 
 
 		 240 aa  201  9e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  48.65 
 
 		 240 aa  201  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  48.62 
 
 		 653 aa  200  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  45.21 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  45.45 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  45.95 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>