More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1427 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1427  ABC transporter related  100 
 
 
241 aa  495  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0799296  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2200  ABC transporter-related protein  63.27 
 
 
229 aa  298  5e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0758  ABC transporter related  58.23 
 
 
237 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0209945  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1653  ABC transporter related  55.41 
 
 
228 aa  260  1e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.200996  normal  0.926793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2653  ABC transporter, ATP-binding protein  57.28 
 
 
214 aa  258  6e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.670995  normal  0.0652814 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  52.91 
 
 
229 aa  250  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0986  ABC transporter, ATPase subunit  54.26 
 
 
232 aa  246  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  49.34 
 
 
229 aa  231  1e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  50 
 
 
225 aa  221  7e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  46.93 
 
 
230 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  45.85 
 
 
228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  49.78 
 
 
233 aa  218  6e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  47.71 
 
 
235 aa  216  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  50.21 
 
 
656 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  47.79 
 
 
237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  50.21 
 
 
657 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  49.34 
 
 
657 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  48.44 
 
 
291 aa  211  9e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  48.23 
 
 
230 aa  210  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  47.95 
 
 
221 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  45.09 
 
 
225 aa  210  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  46.82 
 
 
240 aa  210  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  47.16 
 
 
256 aa  209  2e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  45.41 
 
 
242 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  45.87 
 
 
259 aa  209  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  47.51 
 
 
222 aa  209  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.54 
 
 
264 aa  208  5e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  47.47 
 
 
246 aa  208  6e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  44.58 
 
 
266 aa  208  7e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  47.75 
 
 
240 aa  208  7e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  45.13 
 
 
225 aa  208  7e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  45.22 
 
 
237 aa  207  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  45.09 
 
 
226 aa  207  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  47.14 
 
 
248 aa  206  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  45.61 
 
 
241 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  45.02 
 
 
238 aa  206  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  44.14 
 
 
228 aa  207  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  50.23 
 
 
228 aa  206  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  47.53 
 
 
230 aa  205  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  43.81 
 
 
242 aa  205  5e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  44.84 
 
 
230 aa  205  6e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  46.36 
 
 
239 aa  204  8e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  46.22 
 
 
244 aa  204  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4456  ABC transporter related protein  46.52 
 
 
239 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  48.87 
 
 
234 aa  204  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  48.87 
 
 
234 aa  204  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  47.95 
 
 
222 aa  203  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  48 
 
 
238 aa  203  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  47.32 
 
 
658 aa  203  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  46.45 
 
 
238 aa  202  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  47.03 
 
 
227 aa  202  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  43.35 
 
 
235 aa  202  3e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  46.33 
 
 
287 aa  202  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  42.86 
 
 
239 aa  202  5e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  45.09 
 
 
229 aa  201  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  45.91 
 
 
223 aa  201  6e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  46.58 
 
 
653 aa  202  6e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  43.7 
 
 
240 aa  201  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  47.95 
 
 
236 aa  201  7e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  46.15 
 
 
234 aa  201  8e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  47.95 
 
 
222 aa  201  8e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  43.89 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  45 
 
 
225 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  45.25 
 
 
244 aa  200  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  45.05 
 
 
252 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  44.29 
 
 
252 aa  200  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  45.66 
 
 
233 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  46.22 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  44.29 
 
 
219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  46.35 
 
 
248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1370  ABC transporter related  48.64 
 
 
232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000531133  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  42.92 
 
 
236 aa  199  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  45.5 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  45.05 
 
 
236 aa  199  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  45.45 
 
 
250 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  43.3 
 
 
230 aa  199  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  45 
 
 
249 aa  199  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  44.55 
 
 
236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  43.17 
 
 
715 aa  199  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  45.66 
 
 
221 aa  198  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1201  ABC transporter related protein  45.45 
 
 
228 aa  198  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  43.5 
 
 
240 aa  198  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  47.49 
 
 
238 aa  198  6e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0199  ABC transporter related  45.13 
 
 
291 aa  198  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.500002  normal  0.26855 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  44.59 
 
 
228 aa  198  7e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  44.78 
 
 
234 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0471  ABC transporter related  45.29 
 
 
236 aa  197  9e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 
228 aa  197  9e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  48.21 
 
 
252 aa  197  9e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  44.89 
 
 
644 aa  197  9e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  46.85 
 
 
225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8342  ABC transporter related  45 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  46.19 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  45.66 
 
 
240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.18 
 
 
239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  45.66 
 
 
240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  45.66 
 
 
241 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  46.76 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  45.29 
 
 
228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  47.77 
 
 
657 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>