More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0530 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  100 
 
 		 277 aa  529  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  69.17 
 
 		 249 aa  304  1.0000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  62.9 
 
 		 266 aa  289  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  63.87 
 
 		 269 aa  287  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  68.75 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  63.95 
 
 		 244 aa  279  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  60.52 
 
 		 259 aa  278  7e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  63.09 
 
 		 252 aa  278  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  60.09 
 
 		 264 aa  276  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  61.98 
 
 		 279 aa  276  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  60.5 
 
 		 256 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  63.45 
 
 		 245 aa  276  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  61.78 
 
 		 255 aa  275  4e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  62.08 
 
 		 280 aa  275  8e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  59.41 
 
 		 455 aa  271  9e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  61.32 
 
 		 268 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  61.09 
 
 		 243 aa  268  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  58.65 
 
 		 253 aa  268  7e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  59.49 
 
 		 247 aa  267  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  58.65 
 
 		 252 aa  266  2e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  59.75 
 
 		 250 aa  267  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  64.91 
 
 		 256 aa  265  5e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  56.25 
 
 		 258 aa  265  5.999999999999999e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  56.15 
 
 		 256 aa  265  8e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  60.35 
 
 		 445 aa  264  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  60.78 
 
 		 277 aa  263  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  62.2 
 
 		 258 aa  263  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  58.44 
 
 		 264 aa  262  4e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  57.2 
 
 		 258 aa  261  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  58.65 
 
 		 253 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  57.26 
 
 		 262 aa  259  3e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  60.44 
 
 		 253 aa  259  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  58.95 
 
 		 261 aa  258  9e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  56.61 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  57.14 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  64.6 
 
 		 257 aa  255  6e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  60.94 
 
 		 255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  56.43 
 
 		 274 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  57.45 
 
 		 255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  56.65 
 
 		 271 aa  252  4.0000000000000004e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  56.72 
 
 		 255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  55.41 
 
 		 266 aa  252  5.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  61.16 
 
 		 258 aa  252  5.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  60 
 
 		 272 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  56.5 
 
 		 243 aa  250  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  61.21 
 
 		 312 aa  249  4e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  61.65 
 
 		 244 aa  249  5e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  61.92 
 
 		 248 aa  248  8e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  55.51 
 
 		 255 aa  247  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  50.64 
 
 		 279 aa  246  2e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  50.61 
 
 		 277 aa  245  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  54.96 
 
 		 288 aa  242  3.9999999999999997e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  67.09 
 
 		 249 aa  242  5e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  55.74 
 
 		 271 aa  242  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  62.98 
 
 		 250 aa  241  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  51.56 
 
 		 291 aa  241  7.999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  55.23 
 
 		 279 aa  241  9e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  55.27 
 
 		 255 aa  239  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  52.21 
 
 		 263 aa  238  9e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  56.82 
 
 		 245 aa  234  8e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  47.09 
 
 		 228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  57.69 
 
 		 269 aa  231  7.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  64.32 
 
 		 224 aa  229  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  52.52 
 
 		 293 aa  227  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  57.08 
 
 		 302 aa  226  3e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  57.56 
 
 		 247 aa  223  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  57.51 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  53.88 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  54.89 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  55.19 
 
 		 239 aa  219  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  50.46 
 
 		 266 aa  218  7.999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  52.31 
 
 		 241 aa  218  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  59.17 
 
 		 249 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  48.62 
 
 		 225 aa  215  7e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  45.79 
 
 		 230 aa  213  3.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  46.12 
 
 		 240 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  53.24 
 
 		 231 aa  211  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  48.39 
 
 		 246 aa  211  7e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  49.78 
 
 		 229 aa  209  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  48.39 
 
 		 225 aa  210  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3170  ABC transporter related protein  50 
 
 		 217 aa  209  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0178954  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  42.5 
 
 		 248 aa  209  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  43.72 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  47.84 
 
 		 241 aa  209  5e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  47.93 
 
 		 239 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  50 
 
 		 228 aa  208  7e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  57.87 
 
 		 235 aa  208  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  52.07 
 
 		 565 aa  208  9e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  50.69 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  49.54 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  52.02 
 
 		 237 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  50.66 
 
 		 228 aa  207  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  48.82 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  52.02 
 
 		 237 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  46.58 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3939  ABC transporter, ATPase subunit  51.57 
 
 		 236 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.920707  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0456  ABC transporter related  53 
 
 		 229 aa  206  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  43.32 
 
 		 293 aa  205  6e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  51.12 
 
 		 408 aa  205  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  56.94 
 
 		 250 aa  205  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.175437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>