More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4081 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  100 
 
 
237 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  100 
 
 
237 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3939  ABC transporter, ATPase subunit  98.67 
 
 
236 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.920707  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  78.48 
 
 
237 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0367  ABC transporter related  61.16 
 
 
244 aa  272  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  59.01 
 
 
228 aa  270  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3285  ABC transporter related  59.82 
 
 
249 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2391  ABC transporter related  55.36 
 
 
253 aa  260  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  55.65 
 
 
234 aa  252  3e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2345  ABC transporter, ATP-binding protein  56.44 
 
 
233 aa  249  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2086  ABC transporter, ATP-binding protein  56 
 
 
233 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2377  ABC transporter, ATP-binding protein  56 
 
 
233 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1113  ABC transporter, ATP-binding protein  56 
 
 
233 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1392  ABC transporter, ATP-binding protein  56 
 
 
233 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3258  ABC transporter, ATP-binding protein  56 
 
 
233 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.219344  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1473  ABC-transporter ATP binding protein  56 
 
 
233 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3144  ABC transporter, ATP-binding protein  56 
 
 
233 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1950  ABC transporter related  54.81 
 
 
238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458128  normal  0.0230529 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1802  ABC transporter related  54.55 
 
 
234 aa  239  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  50.45 
 
 
230 aa  237  9e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  55.2 
 
 
230 aa  236  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  51.11 
 
 
246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2019  ABC transporter related protein  49.54 
 
 
228 aa  230  1e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0275435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2437  ABC transporter related  51.14 
 
 
231 aa  228  8e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2375  ABC-type transport system, ATPase component  49.55 
 
 
229 aa  228  9e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797432  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1852  ABC transporter, ATP-binding protein  46.5 
 
 
250 aa  227  1e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000122663  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  48.87 
 
 
228 aa  227  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2540  ABC transporter related  51.12 
 
 
241 aa  226  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.656818  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2507  ABC transporter related  52.25 
 
 
231 aa  223  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6690  ABC transporter, ATPase subunit  56.28 
 
 
234 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810231  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  51.49 
 
 
241 aa  222  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  51.49 
 
 
241 aa  222  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5302  ABC transporter related  54.63 
 
 
234 aa  221  6e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.155471  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  49.77 
 
 
238 aa  221  8e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  51.06 
 
 
241 aa  221  9e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  45.5 
 
 
236 aa  221  9e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  45.5 
 
 
240 aa  219  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  48.65 
 
 
227 aa  219  3e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 
232 aa  219  3.9999999999999997e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29510  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.91 
 
 
250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1662  ABC transporter related  54.19 
 
 
234 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.822676  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  48.43 
 
 
237 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  44.34 
 
 
260 aa  218  6e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  45.98 
 
 
239 aa  218  7e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  50.9 
 
 
232 aa  218  8.999999999999998e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  45.61 
 
 
242 aa  217  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  49.32 
 
 
227 aa  216  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  48.42 
 
 
233 aa  216  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  44.07 
 
 
238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  49.09 
 
 
237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  47.96 
 
 
244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  45.41 
 
 
266 aa  216  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  48.64 
 
 
252 aa  215  4e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  46.82 
 
 
246 aa  215  5e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  43.69 
 
 
226 aa  214  8e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1252  ABC transporter related  52.78 
 
 
234 aa  214  8e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.252759 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4296  ABC transporter related  50.64 
 
 
242 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0438871  normal  0.557698 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1291  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  48.18 
 
 
235 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.286185 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  47.37 
 
 
235 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  45.7 
 
 
230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  47.3 
 
 
225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  47.25 
 
 
244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  47.3 
 
 
225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  49.34 
 
 
240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  48.21 
 
 
240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  48.21 
 
 
240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  46.43 
 
 
226 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  49.55 
 
 
228 aa  211  5.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1100  ABC transporter related  48.66 
 
 
236 aa  211  7e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  47.25 
 
 
234 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  48.21 
 
 
240 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  48.2 
 
 
241 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  47.25 
 
 
234 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  50 
 
 
249 aa  211  9e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  46.61 
 
 
228 aa  211  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  47.27 
 
 
248 aa  211  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  44.44 
 
 
247 aa  210  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  46.4 
 
 
235 aa  209  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  45.78 
 
 
240 aa  210  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  46.19 
 
 
715 aa  209  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0060  ABC transporter related  50 
 
 
232 aa  209  3e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  44.44 
 
 
242 aa  209  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8875  ABC transporter-related protein  52.49 
 
 
243 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534003  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  47.06 
 
 
249 aa  208  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  46.33 
 
 
228 aa  208  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  45.05 
 
 
249 aa  208  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  44.8 
 
 
248 aa  208  6e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  44.39 
 
 
230 aa  208  6e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  47.27 
 
 
277 aa  208  6e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  46.02 
 
 
225 aa  208  7e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  45.71 
 
 
244 aa  208  7e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  44.34 
 
 
228 aa  207  8e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  46.61 
 
 
224 aa  207  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 
224 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  46.61 
 
 
224 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  44.2 
 
 
237 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3195  putative ABC transporter, ATP-binding protein  49.75 
 
 
227 aa  207  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  44.55 
 
 
230 aa  207  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  43.89 
 
 
235 aa  206  2e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  47.19 
 
 
565 aa  206  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>