More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8137 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  100 
 
 		 258 aa  519  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  71.19 
 
 		 250 aa  334  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  70.09 
 
 		 277 aa  330  2e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  68.12 
 
 		 247 aa  317  1e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  67.93 
 
 		 268 aa  317  2e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  66.95 
 
 		 455 aa  316  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  68.56 
 
 		 256 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  64.71 
 
 		 263 aa  315  5e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  63.75 
 
 		 262 aa  310  1e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  65.16 
 
 		 274 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  63.07 
 
 		 264 aa  308  8e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  63.37 
 
 		 258 aa  307  1.0000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  65.37 
 
 		 255 aa  305  3e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  64.53 
 
 		 271 aa  305  6e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  64.2 
 
 		 277 aa  304  7e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  62.3 
 
 		 256 aa  303  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  63.56 
 
 		 253 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  65.52 
 
 		 280 aa  303  2.0000000000000002e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  61.48 
 
 		 259 aa  302  3.0000000000000004e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  63.22 
 
 		 258 aa  302  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  64.2 
 
 		 252 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  64.94 
 
 		 255 aa  302  4.0000000000000003e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  65.37 
 
 		 266 aa  301  9e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  66.95 
 
 		 258 aa  300  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  68.14 
 
 		 257 aa  301  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  66.81 
 
 		 253 aa  300  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  65.79 
 
 		 445 aa  300  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  64.89 
 
 		 264 aa  300  2e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  61.54 
 
 		 291 aa  299  3e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  66.96 
 
 		 250 aa  296  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  62.25 
 
 		 255 aa  294  8e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  61.8 
 
 		 279 aa  294  8e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  61.57 
 
 		 255 aa  293  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  63.16 
 
 		 261 aa  290  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  58.06 
 
 		 288 aa  284  8e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  64.86 
 
 		 302 aa  279  4e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  62.34 
 
 		 244 aa  277  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  60.76 
 
 		 247 aa  268  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  62.17 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  61.48 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  59.39 
 
 		 245 aa  265  5e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  61.74 
 
 		 312 aa  264  8.999999999999999e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  59.74 
 
 		 257 aa  257  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  57.38 
 
 		 279 aa  256  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  54.47 
 
 		 266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  55.6 
 
 		 293 aa  251  6e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  54.51 
 
 		 269 aa  251  8.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  56.12 
 
 		 255 aa  249  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  54.22 
 
 		 243 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  57.14 
 
 		 277 aa  246  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  54.82 
 
 		 243 aa  245  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  56.65 
 
 		 241 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  55.95 
 
 		 245 aa  244  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  55.08 
 
 		 249 aa  241  7e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  48.84 
 
 		 228 aa  241  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  53.78 
 
 		 256 aa  238  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  54.01 
 
 		 252 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  53.95 
 
 		 271 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  51.63 
 
 		 244 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  49.53 
 
 		 225 aa  230  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  60.27 
 
 		 249 aa  228  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  54.51 
 
 		 272 aa  227  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  49.55 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  49.58 
 
 		 253 aa  225  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  56.52 
 
 		 248 aa  221  7e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  51.1 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  45.83 
 
 		 230 aa  221  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  45.91 
 
 		 227 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  47.22 
 
 		 229 aa  217  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  47.62 
 
 		 241 aa  216  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  56.72 
 
 		 249 aa  216  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  49.34 
 
 		 240 aa  214  9e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  51.82 
 
 		 279 aa  213  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  44.5 
 
 		 227 aa  211  7.999999999999999e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  44.7 
 
 		 226 aa  211  1e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  51.93 
 
 		 247 aa  210  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  49.09 
 
 		 230 aa  209  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  45.74 
 
 		 230 aa  208  6e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  51.11 
 
 		 269 aa  207  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  47.47 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  43.4 
 
 		 248 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  51.83 
 
 		 239 aa  205  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  54.73 
 
 		 224 aa  205  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  43.61 
 
 		 240 aa  205  6e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 		 232 aa  204  8e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  47.37 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  43.44 
 
 		 246 aa  203  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  47.56 
 
 		 251 aa  202  3e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  52.63 
 
 		 247 aa  203  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  44.26 
 
 		 248 aa  202  4e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  49.33 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  45.62 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1657  ABC transporter related  49.54 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  48.62 
 
 		 228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  47.17 
 
 		 228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  48.15 
 
 		 229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  48.61 
 
 		 229 aa  198  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  42.2 
 
 		 229 aa  198  7e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  46.7 
 
 		 228 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  44.8 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>