More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2078 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  100 
 
 		 227 aa  454  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  81.94 
 
 		 227 aa  387  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  64.16 
 
 		 228 aa  315  5e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1536  ABC transporter related  69.06 
 
 		 226 aa  311  4.999999999999999e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38165  normal  0.0345919 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  59.19 
 
 		 226 aa  278  5e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  54.26 
 
 		 230 aa  265  2.9999999999999995e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  54.26 
 
 		 225 aa  259  3e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  53.64 
 
 		 225 aa  256  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  49.55 
 
 		 229 aa  233  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  46.4 
 
 		 293 aa  232  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  47.44 
 
 		 244 aa  223  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  46.05 
 
 		 255 aa  220  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  45.25 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  46.19 
 
 		 223 aa  218  6e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  48.86 
 
 		 237 aa  218  7e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  46.67 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  42.2 
 
 		 245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 		 227 aa  214  8e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  48.44 
 
 		 248 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.24 
 
 		 258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  44.02 
 
 		 266 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  46.26 
 
 		 242 aa  212  3.9999999999999995e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  46.85 
 
 		 225 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  46.85 
 
 		 225 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  45.58 
 
 		 262 aa  211  4.9999999999999996e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  44.5 
 
 		 258 aa  211  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  45.33 
 
 		 247 aa  211  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.85 
 
 		 227 aa  211  7e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  47.56 
 
 		 230 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  44.75 
 
 		 279 aa  211  9e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  46.26 
 
 		 239 aa  210  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  45.16 
 
 		 255 aa  209  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  45.37 
 
 		 250 aa  209  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  44.98 
 
 		 240 aa  210  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  43.52 
 
 		 255 aa  209  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.45 
 
 		 264 aa  208  5e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2196  ABC transporter related  44.64 
 
 		 230 aa  208  6e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.439888  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  45.62 
 
 		 259 aa  208  7e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  44.65 
 
 		 264 aa  207  8e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.89 
 
 		 234 aa  207  8e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  43.5 
 
 		 277 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  45.95 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  46.64 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  43.58 
 
 		 277 aa  207  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  44.34 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  44.8 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.69 
 
 		 274 aa  206  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  45.95 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  42.41 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  47.35 
 
 		 652 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  44.8 
 
 		 235 aa  206  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.4 
 
 		 280 aa  205  4e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  45.29 
 
 		 232 aa  205  5e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  44.95 
 
 		 245 aa  205  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  43.32 
 
 		 258 aa  205  5e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  45.12 
 
 		 279 aa  204  6e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  46.64 
 
 		 653 aa  204  8e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  45.81 
 
 		 236 aa  204  8e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  43.81 
 
 		 233 aa  204  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  42.79 
 
 		 258 aa  204  9e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  45.21 
 
 		 224 aa  203  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  45.85 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  47.27 
 
 		 234 aa  203  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  42.86 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  47.27 
 
 		 234 aa  203  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  44.84 
 
 		 236 aa  204  1e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  44.75 
 
 		 224 aa  203  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  42.86 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  43.24 
 
 		 658 aa  203  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  47.09 
 
 		 227 aa  202  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 		 221 aa  203  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  47.03 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  42.34 
 
 		 230 aa  202  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  44.65 
 
 		 263 aa  203  2e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  45.98 
 
 		 249 aa  202  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  43.4 
 
 		 253 aa  202  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  42.66 
 
 		 243 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  44.75 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  42.01 
 
 		 223 aa  202  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  46.85 
 
 		 644 aa  202  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  43.64 
 
 		 220 aa  202  4e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  46.43 
 
 		 642 aa  202  5e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  44.09 
 
 		 250 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  42.92 
 
 		 233 aa  202  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  44.75 
 
 		 231 aa  201  6e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  45.12 
 
 		 302 aa  201  7e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  49.53 
 
 		 249 aa  201  7e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  42.52 
 
 		 269 aa  201  7e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  47.09 
 
 		 228 aa  201  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.59 
 
 		 233 aa  201  8e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  41.4 
 
 		 271 aa  201  9e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  46.82 
 
 		 238 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 		 229 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  42.01 
 
 		 223 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0425  ABC transporter related  44.17 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  41.55 
 
 		 223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  41.55 
 
 		 223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3285  ABC transporter related  45.5 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  47.47 
 
 		 228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  43.26 
 
 		 455 aa  199  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>