More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0848 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  100 
 
 		 249 aa  479  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  60.83 
 
 		 455 aa  280  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  58.12 
 
 		 256 aa  275  6e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  58.16 
 
 		 262 aa  273  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  57.26 
 
 		 266 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  58.16 
 
 		 258 aa  270  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  59 
 
 		 255 aa  270  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  57.5 
 
 		 247 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  60.25 
 
 		 253 aa  268  8e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  60.61 
 
 		 445 aa  267  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  58.26 
 
 		 264 aa  266  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  58.26 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  57.92 
 
 		 256 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  57.26 
 
 		 255 aa  263  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  57.94 
 
 		 255 aa  263  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  56.67 
 
 		 250 aa  262  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  57.5 
 
 		 252 aa  261  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  53.69 
 
 		 263 aa  259  2e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  57.68 
 
 		 252 aa  260  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  56.68 
 
 		 277 aa  259  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  52.21 
 
 		 277 aa  259  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  58.97 
 
 		 280 aa  258  4e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  57.83 
 
 		 244 aa  258  7e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  56.41 
 
 		 291 aa  257  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  62.72 
 
 		 257 aa  256  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  56.49 
 
 		 243 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  60.27 
 
 		 258 aa  255  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  51.65 
 
 		 279 aa  255  6e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  55.42 
 
 		 269 aa  255  6e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  56.96 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  55.51 
 
 		 259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  58.3 
 
 		 268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  57.08 
 
 		 279 aa  252  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  57.94 
 
 		 258 aa  251  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  57.39 
 
 		 261 aa  250  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  56.02 
 
 		 271 aa  250  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  56.28 
 
 		 271 aa  249  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  57.51 
 
 		 293 aa  249  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  53.75 
 
 		 274 aa  248  5e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  56.22 
 
 		 264 aa  248  9e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  54.67 
 
 		 228 aa  248  9e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  60.25 
 
 		 258 aa  247  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  59 
 
 		 312 aa  244  6e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  59.28 
 
 		 288 aa  244  6.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  59.13 
 
 		 256 aa  244  8e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  59.19 
 
 		 250 aa  244  8e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  52.04 
 
 		 230 aa  244  9.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  55.91 
 
 		 258 aa  244  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  56.03 
 
 		 266 aa  243  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  53.97 
 
 		 247 aa  241  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  52.09 
 
 		 227 aa  241  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  57.58 
 
 		 257 aa  236  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  56.44 
 
 		 245 aa  236  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  50.89 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  55.51 
 
 		 255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  47.06 
 
 		 248 aa  231  6e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  53.65 
 
 		 244 aa  231  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  56.07 
 
 		 241 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  59.81 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  55.61 
 
 		 250 aa  228  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  49.53 
 
 		 227 aa  228  9e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  58.56 
 
 		 277 aa  227  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  54.71 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  52.73 
 
 		 240 aa  227  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  52.44 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  56.05 
 
 		 272 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  51.3 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  53.3 
 
 		 245 aa  226  4e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  51.25 
 
 		 253 aa  224  9e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  52.44 
 
 		 653 aa  224  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  51.17 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  54.3 
 
 		 243 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  47.95 
 
 		 229 aa  221  6e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  53.39 
 
 		 248 aa  221  7e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  53.85 
 
 		 249 aa  221  8e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  50 
 
 		 220 aa  220  9.999999999999999e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  48.91 
 
 		 232 aa  221  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  48.2 
 
 		 229 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  53.64 
 
 		 255 aa  219  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  51.88 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  48.87 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  53.24 
 
 		 239 aa  219  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  49.78 
 
 		 228 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  55.41 
 
 		 235 aa  218  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.4 
 
 		 236 aa  218  7.999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1536  ABC transporter related  53.52 
 
 		 226 aa  217  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38165  normal  0.0345919 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  48.86 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  48.66 
 
 		 230 aa  218  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  48.88 
 
 		 227 aa  216  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  52.68 
 
 		 238 aa  216  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  49.07 
 
 		 225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  52.4 
 
 		 240 aa  215  4e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  49.77 
 
 		 241 aa  215  4e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  47.54 
 
 		 246 aa  216  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  54.13 
 
 		 224 aa  215  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  53.42 
 
 		 225 aa  215  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0678  ABC transporter, ATP-binding protein  53.21 
 
 		 225 aa  214  8e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.586556  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  47.03 
 
 		 226 aa  214  9e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3142  ABC transporter, ATP-binding protein  46.91 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00969837  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  48.42 
 
 		 225 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>