More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_21590 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  100 
 
 		 269 aa  530  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  70.83 
 
 		 255 aa  345  6e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  63.29 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  58.05 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  58.52 
 
 		 256 aa  263  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  58.05 
 
 		 245 aa  258  5.0000000000000005e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  55.04 
 
 		 255 aa  254  8e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  55.7 
 
 		 252 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  51.61 
 
 		 264 aa  250  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  54.32 
 
 		 244 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  58.72 
 
 		 243 aa  247  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  53.74 
 
 		 445 aa  245  6e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  51.38 
 
 		 258 aa  244  9e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  54.36 
 
 		 253 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  52.12 
 
 		 455 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  57.63 
 
 		 253 aa  243  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  55.98 
 
 		 271 aa  241  6e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  53.81 
 
 		 269 aa  241  7.999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  51.93 
 
 		 262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  49.4 
 
 		 291 aa  238  9e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  51.44 
 
 		 266 aa  238  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  54.55 
 
 		 255 aa  238  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  55.46 
 
 		 253 aa  236  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  54.55 
 
 		 255 aa  235  6e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  54.01 
 
 		 279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  52.74 
 
 		 247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  57.69 
 
 		 277 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  52.38 
 
 		 266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.19 
 
 		 280 aa  233  3e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  53.78 
 
 		 258 aa  232  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  49.18 
 
 		 277 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  55.98 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  53.78 
 
 		 277 aa  228  9e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  57.85 
 
 		 258 aa  227  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  47.11 
 
 		 263 aa  227  2e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  56.39 
 
 		 288 aa  226  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.34 
 
 		 264 aa  226  4e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  51.54 
 
 		 256 aa  225  7e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.46 
 
 		 245 aa  224  9e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  48.1 
 
 		 279 aa  224  9e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  51.29 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  52.77 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  50.41 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  49.02 
 
 		 274 aa  224  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  52.14 
 
 		 252 aa  222  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  52.05 
 
 		 256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  56.5 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  57.33 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  55.76 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  48.47 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  53.74 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  51.11 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  51.52 
 
 		 247 aa  219  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  56.94 
 
 		 224 aa  218  7e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  52.84 
 
 		 272 aa  217  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  45.37 
 
 		 230 aa  217  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  55.23 
 
 		 241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  50.22 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  52.25 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  52.86 
 
 		 244 aa  215  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  52.42 
 
 		 257 aa  216  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  50.86 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  51.69 
 
 		 293 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  44.7 
 
 		 229 aa  211  7e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  45.61 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  45.62 
 
 		 227 aa  209  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  48.93 
 
 		 259 aa  208  6e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  49.07 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  49.07 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  51.93 
 
 		 255 aa  206  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  45.91 
 
 		 247 aa  206  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  46.08 
 
 		 255 aa  206  5e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  50.22 
 
 		 235 aa  205  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  42.41 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  45.41 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  41.45 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  42.92 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  43.3 
 
 		 242 aa  202  4e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  53.46 
 
 		 250 aa  201  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  42.22 
 
 		 240 aa  201  7e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  45.13 
 
 		 252 aa  201  9e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  50 
 
 		 255 aa  201  9e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  42.67 
 
 		 246 aa  201  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  46.12 
 
 		 221 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  42.67 
 
 		 238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  50 
 
 		 249 aa  199  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  46.32 
 
 		 222 aa  199  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  44.05 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  50.2 
 
 		 248 aa  198  7.999999999999999e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0841  ABC transporter, ATP-binding protein  37.84 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.598404  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  43.06 
 
 		 227 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  42.66 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  46.01 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  44.76 
 
 		 277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1775  ABC transporter related  41.15 
 
 		 298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  46.67 
 
 		 228 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3550  ABC transporter related protein  49.77 
 
 		 238 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  40.37 
 
 		 226 aa  195  6e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  51.81 
 
 		 249 aa  195  7e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  41.3 
 
 		 256 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>