More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3550 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3550  ABC transporter related protein  100 
 
 
238 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4159  ABC transporter related  70.64 
 
 
243 aa  323  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  75.8 
 
 
235 aa  323  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4805  ABC transporter related  69.83 
 
 
245 aa  316  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3176  ABC transporter related  73.42 
 
 
269 aa  305  3e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0415179 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0829  ABC transporter related  67.8 
 
 
245 aa  303  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.848546 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0700  ABC transporter related protein  69.36 
 
 
242 aa  295  5e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1414  ABC transporter related protein  66.95 
 
 
238 aa  282  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201089  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06220  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  61.9 
 
 
234 aa  235  4e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.433338  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  44.64 
 
 
235 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  47.06 
 
 
221 aa  216  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  48.64 
 
 
222 aa  216  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  46.4 
 
 
234 aa  216  4e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  47.73 
 
 
222 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  46.85 
 
 
228 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  47.47 
 
 
230 aa  211  7e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  45.54 
 
 
234 aa  211  7e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  45.66 
 
 
234 aa  210  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  47.49 
 
 
228 aa  209  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  56.22 
 
 
236 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  52.78 
 
 
253 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  44.75 
 
 
240 aa  210  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  46.38 
 
 
235 aa  209  4e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  49.1 
 
 
234 aa  208  5e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  52.78 
 
 
253 aa  208  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  49.76 
 
 
249 aa  208  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  45.91 
 
 
226 aa  208  8e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  45.91 
 
 
226 aa  206  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  45.91 
 
 
226 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  44.93 
 
 
229 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  44.05 
 
 
236 aa  206  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3644  ABC transporter related  46.61 
 
 
221 aa  206  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
226 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
226 aa  206  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 
226 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
226 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
226 aa  206  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 
226 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  45 
 
 
240 aa  206  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  46.64 
 
 
252 aa  205  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
226 aa  205  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  49.78 
 
 
255 aa  205  6e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
226 aa  204  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07200  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  57.43 
 
 
242 aa  204  7e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.408967  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  48.15 
 
 
246 aa  204  7e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  49.77 
 
 
240 aa  204  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
226 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  51.82 
 
 
248 aa  204  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  44.7 
 
 
225 aa  203  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  48.86 
 
 
239 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  46.15 
 
 
248 aa  203  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  50 
 
 
248 aa  202  4e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  49.54 
 
 
252 aa  201  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  48.89 
 
 
249 aa  201  8e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  44.55 
 
 
226 aa  201  9e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  51.23 
 
 
237 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  49.78 
 
 
253 aa  201  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  46.79 
 
 
242 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  49.76 
 
 
225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  45.87 
 
 
242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  46.51 
 
 
248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  47.76 
 
 
220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  49.52 
 
 
291 aa  199  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  45.25 
 
 
230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  46.51 
 
 
248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  44.14 
 
 
248 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  49.76 
 
 
225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 
232 aa  199  3e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  50.47 
 
 
255 aa  199  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  45.12 
 
 
229 aa  199  3e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  45.91 
 
 
244 aa  199  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 
228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3332  ABC transporter related  42.27 
 
 
259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  54.91 
 
 
249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  46.3 
 
 
226 aa  199  3.9999999999999996e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  45.7 
 
 
225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  46.36 
 
 
231 aa  199  5e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  45.95 
 
 
230 aa  198  6e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1414  ATPase  47.81 
 
 
241 aa  198  7e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  43.56 
 
 
263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  47.75 
 
 
224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  44.29 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  45.66 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  48.83 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  50.23 
 
 
244 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  49.77 
 
 
228 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.09 
 
 
264 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  46.15 
 
 
256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  46.85 
 
 
229 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  47.95 
 
 
657 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  49.32 
 
 
243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2204  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 
249 aa  196  3e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  45.29 
 
 
228 aa  196  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  50.23 
 
 
230 aa  196  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  49.57 
 
 
266 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  53.33 
 
 
230 aa  196  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  53.24 
 
 
256 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  46.05 
 
 
247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0493  ABC transporter related  44.09 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  48.47 
 
 
279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>