More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4159 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4159  ABC transporter related  100 
 
 
243 aa  476  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4805  ABC transporter related  89.5 
 
 
245 aa  414  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3550  ABC transporter related protein  70.64 
 
 
238 aa  323  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3176  ABC transporter related  70.04 
 
 
269 aa  309  2.9999999999999997e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0415179 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0829  ABC transporter related  68.61 
 
 
245 aa  301  9e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.848546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1414  ABC transporter related protein  66.38 
 
 
238 aa  297  8e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201089  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0700  ABC transporter related protein  68.6 
 
 
242 aa  296  2e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  67.54 
 
 
235 aa  296  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06220  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  60.18 
 
 
234 aa  231  8.000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.433338  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  45.05 
 
 
248 aa  208  6e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  48.62 
 
 
249 aa  207  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  47.14 
 
 
237 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  46.15 
 
 
225 aa  204  8e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  43.84 
 
 
235 aa  204  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  45.66 
 
 
221 aa  203  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  44.2 
 
 
230 aa  200  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  43.89 
 
 
226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  50.21 
 
 
236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  43.44 
 
 
228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  44.34 
 
 
226 aa  199  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  44.34 
 
 
226 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  44.34 
 
 
226 aa  199  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  44.34 
 
 
226 aa  199  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  44.34 
 
 
226 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1395  ABC transporter related protein  46.75 
 
 
238 aa  199  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0267947  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 
226 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  43.89 
 
 
226 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  43.97 
 
 
235 aa  198  5e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  44.34 
 
 
226 aa  198  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 
226 aa  198  7e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  43.53 
 
 
232 aa  198  7.999999999999999e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  46.82 
 
 
220 aa  197  9e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  43.75 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  44.5 
 
 
222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 
234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4665  ABC transporter, ATP binding protein  46.05 
 
 
262 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  41.7 
 
 
229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  43.48 
 
 
246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0437  ABC transporter related protein  48.2 
 
 
229 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  46.32 
 
 
288 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  46.88 
 
 
228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  47.71 
 
 
256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  45.61 
 
 
242 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  45.71 
 
 
217 aa  197  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  42.73 
 
 
230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1667  ABC transporter related  43.17 
 
 
233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  48.47 
 
 
653 aa  196  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  44.4 
 
 
247 aa  196  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  41.63 
 
 
224 aa  196  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 
226 aa  196  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  43.86 
 
 
229 aa  196  3e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  47.25 
 
 
247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  43.23 
 
 
239 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  42.2 
 
 
240 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.33 
 
 
234 aa  195  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  42.54 
 
 
248 aa  195  5.000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 
236 aa  195  6e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  42.92 
 
 
234 aa  195  6e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0456  ABC transporter related  47.75 
 
 
229 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  43.75 
 
 
226 aa  194  9e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  43.38 
 
 
234 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  43.12 
 
 
222 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  44.89 
 
 
225 aa  194  1e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  47.09 
 
 
225 aa  194  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  47.09 
 
 
225 aa  194  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  46.98 
 
 
230 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  43.38 
 
 
240 aa  194  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  45.13 
 
 
234 aa  194  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  44.5 
 
 
248 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  44.5 
 
 
248 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01135  ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 
233 aa  193  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  42.53 
 
 
226 aa  193  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  45.83 
 
 
246 aa  193  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  48.68 
 
 
246 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  44 
 
 
225 aa  192  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  45.41 
 
 
241 aa  193  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  43.12 
 
 
236 aa  192  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  48.91 
 
 
244 aa  192  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  45.18 
 
 
252 aa  192  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  48.15 
 
 
252 aa  192  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  45.98 
 
 
249 aa  192  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  45.98 
 
 
236 aa  192  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  44.8 
 
 
226 aa  192  4e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  42.36 
 
 
227 aa  192  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1414  ATPase  46.85 
 
 
241 aa  192  5e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  40.72 
 
 
224 aa  191  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  49.54 
 
 
234 aa  191  7e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  49.54 
 
 
234 aa  191  7e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
224 aa  191  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2507  ABC transporter related  46.7 
 
 
231 aa  191  8e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
224 aa  191  9e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
224 aa  191  9e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  44.29 
 
 
252 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  44.95 
 
 
260 aa  191  9e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  47 
 
 
291 aa  191  9e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  42.06 
 
 
251 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1979  transporter  41.78 
 
 
227 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  45 
 
 
237 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  48.83 
 
 
245 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  45.25 
 
 
233 aa  191  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>