More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0700 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0700  ABC transporter related protein  100 
 
 
242 aa  464  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4159  ABC transporter related  68.6 
 
 
243 aa  315  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4805  ABC transporter related  69.49 
 
 
245 aa  310  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3176  ABC transporter related  73.66 
 
 
269 aa  308  4e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0415179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3550  ABC transporter related protein  69.36 
 
 
238 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1414  ABC transporter related protein  67.09 
 
 
238 aa  290  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201089  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0829  ABC transporter related  66.97 
 
 
245 aa  277  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.848546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  65.64 
 
 
235 aa  277  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06220  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  66.21 
 
 
234 aa  241  7.999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.433338  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  50.45 
 
 
247 aa  205  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.95 
 
 
234 aa  203  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3708  ABC transporter-related protein  50.85 
 
 
254 aa  199  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00747361 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  47.16 
 
 
238 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  47.32 
 
 
248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  47.81 
 
 
262 aa  197  9e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  44.34 
 
 
225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  41.07 
 
 
235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  48.91 
 
 
252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  45.74 
 
 
249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  51.16 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  49.77 
 
 
255 aa  196  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  44.34 
 
 
225 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  48.25 
 
 
252 aa  195  6e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  47.77 
 
 
256 aa  194  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4416  ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 
244 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  50.23 
 
 
255 aa  194  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  44.09 
 
 
228 aa  194  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0456  ABC transporter related  49.1 
 
 
229 aa  193  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  49.1 
 
 
288 aa  193  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  44.75 
 
 
221 aa  193  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  45.25 
 
 
237 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  47.71 
 
 
248 aa  192  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  48.68 
 
 
238 aa  192  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  47.95 
 
 
228 aa  192  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  47.09 
 
 
236 aa  192  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0437  ABC transporter related protein  48.65 
 
 
229 aa  192  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.4 
 
 
264 aa  192  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2507  ABC transporter related  48.62 
 
 
231 aa  192  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  40.99 
 
 
234 aa  192  5e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  46.89 
 
 
248 aa  191  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  46.98 
 
 
233 aa  192  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  40.72 
 
 
224 aa  191  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  40.72 
 
 
224 aa  191  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  45.65 
 
 
255 aa  191  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  47.49 
 
 
240 aa  191  8e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  44.86 
 
 
225 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  44.04 
 
 
232 aa  191  1e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 
228 aa  190  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  44.86 
 
 
225 aa  191  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.22 
 
 
258 aa  191  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50 
 
 
280 aa  190  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  47.06 
 
 
234 aa  191  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  43.11 
 
 
225 aa  190  2e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  50.9 
 
 
312 aa  190  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  44.1 
 
 
232 aa  190  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  45.89 
 
 
230 aa  190  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  45 
 
 
220 aa  190  2e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  47.81 
 
 
255 aa  190  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  46.43 
 
 
252 aa  189  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  44.05 
 
 
251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  47.44 
 
 
228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  40.72 
 
 
224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  43.17 
 
 
247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  46.82 
 
 
241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  40.18 
 
 
240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.67 
 
 
280 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  48.05 
 
 
255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 
224 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  47.75 
 
 
222 aa  189  4e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1657  ABC transporter related  46.32 
 
 
258 aa  189  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  48.43 
 
 
233 aa  188  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  41.63 
 
 
228 aa  188  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  46.9 
 
 
253 aa  188  5.999999999999999e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  43.67 
 
 
239 aa  188  5.999999999999999e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  47.06 
 
 
253 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07200  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.5 
 
 
242 aa  188  7e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.408967  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  42.99 
 
 
228 aa  188  8e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  51.28 
 
 
249 aa  187  9e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  43.58 
 
 
222 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 
230 aa  187  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  39.82 
 
 
224 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  39.82 
 
 
224 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3473  ABC transporter related protein  53.4 
 
 
238 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745227  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 
246 aa  187  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  40.99 
 
 
234 aa  187  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  39.37 
 
 
224 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  43.42 
 
 
238 aa  187  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  39.82 
 
 
224 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  48.43 
 
 
233 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  48.65 
 
 
271 aa  186  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  48.5 
 
 
248 aa  186  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  38.96 
 
 
229 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3917  ABC transporter related  49.14 
 
 
232 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  45.81 
 
 
253 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  43.12 
 
 
222 aa  186  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3234  ABC transporter related  47.75 
 
 
227 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0162255  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  40.18 
 
 
234 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  47.14 
 
 
244 aa  186  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  43.46 
 
 
240 aa  186  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  41.53 
 
 
239 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>