More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1518 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 228 aa  456  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1657  ABC transporter related  83.19 
 
 		 258 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0456  ABC transporter related  78.76 
 
 		 229 aa  355  2.9999999999999997e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0437  ABC transporter related protein  77.43 
 
 		 229 aa  350  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  50.91 
 
 		 239 aa  222  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  49.1 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  46.61 
 
 		 225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  46.61 
 
 		 225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  46.82 
 
 		 249 aa  215  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  45.13 
 
 		 225 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  47.56 
 
 		 242 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 232 aa  209  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  46.26 
 
 		 288 aa  208  5e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  48.87 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  46.4 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  46.43 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.41 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3761  ABC transporter related protein  47.25 
 
 		 265 aa  206  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  45.41 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.41 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  49.12 
 
 		 235 aa  206  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  45.41 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  50.45 
 
 		 222 aa  206  3e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.41 
 
 		 233 aa  206  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.41 
 
 		 233 aa  206  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2659  ABC transporter, ATP-binding protein  43.12 
 
 		 256 aa  205  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00013766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.41 
 
 		 233 aa  206  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.41 
 
 		 233 aa  206  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.41 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  45.61 
 
 		 235 aa  205  5e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  47.35 
 
 		 248 aa  205  5e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  50 
 
 		 272 aa  205  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  49.78 
 
 		 279 aa  205  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  45.29 
 
 		 228 aa  205  6e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  45.85 
 
 		 230 aa  204  7e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2748  ABC transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 		 256 aa  204  7e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.403092  hitchhiker  0.000000938072 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  42.98 
 
 		 256 aa  204  8e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  51.94 
 
 		 455 aa  204  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.52 
 
 		 233 aa  204  9e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2621  ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.012082  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.85 
 
 		 233 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.85 
 
 		 233 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  46.43 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  45.54 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  45.66 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.85 
 
 		 233 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.85 
 
 		 233 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  46.4 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.85 
 
 		 233 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3708  ABC transporter-related protein  48.2 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00747361 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  43.24 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2306  ABC transporter related  44 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000206589  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  48.6 
 
 		 244 aa  203  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  48.86 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.3 
 
 		 236 aa  202  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  48.91 
 
 		 234 aa  202  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  45.5 
 
 		 246 aa  202  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  45.7 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  43.56 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  45.29 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  47.27 
 
 		 255 aa  202  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  45.95 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2383  ABC transporter, ATP-binding protein  42.22 
 
 		 256 aa  202  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0355575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0307  hypothetical protein  51.35 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 		 226 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2575  ABC transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 		 256 aa  202  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  41.78 
 
 		 227 aa  202  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2349  ABC transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 		 256 aa  201  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0800376  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  46.58 
 
 		 225 aa  201  6e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  44.89 
 
 		 319 aa  201  8e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  47.95 
 
 		 252 aa  201  8e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 		 226 aa  201  8e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  43.86 
 
 		 237 aa  201  8e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 		 219 aa  200  9.999999999999999e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4985  ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4723  ABC transporter ATP-binding protein  42.92 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4671  ABC transporter related  42.92 
 
 		 256 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4565  ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0124496  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4581  ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4972  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  42.53 
 
 		 220 aa  201  9.999999999999999e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4805  ABC transporter related  47.32 
 
 		 245 aa  200  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  45.95 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0279  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5085  ABC transporter ATP-binding protein  42.92 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4946  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2531  ABC transporter related  41.78 
 
 		 256 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  44.8 
 
 		 225 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  46.15 
 
 		 230 aa  201  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  46.43 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  47.95 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4956  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  50.24 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 		 226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2427  ABC transporter ATP-binding protein  41.33 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3521  ABC transporter related protein  47.95 
 
 		 254 aa  199  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.185776 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2603  ABC transporter ATP-binding protein  41.33 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  45.5 
 
 		 247 aa  199  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2620  ABC transporter, ATP-binding protein  41.33 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>