More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0064 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 222 aa  450  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  66.97 
 
 		 228 aa  304  6e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  66.06 
 
 		 224 aa  301  7.000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1252  ABC transporter related  63.96 
 
 		 234 aa  291  4e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.252759 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1821  ABC transporter-related protein  62.16 
 
 		 223 aa  281  6.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.373636  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0060  ABC transporter related  60.45 
 
 		 232 aa  280  1e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0270  ABC transporter related  61.82 
 
 		 228 aa  272  3e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1025  ABC transporter related  57.47 
 
 		 223 aa  271  7e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490239  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  60.73 
 
 		 227 aa  268  4e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  58.82 
 
 		 226 aa  268  4e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0756  ABC transporter related  59.91 
 
 		 226 aa  266  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.688421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1647  ABC transporter related  58.82 
 
 		 226 aa  261  4.999999999999999e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.204823  hitchhiker  0.000330012 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  51.58 
 
 		 228 aa  234  7e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  55.16 
 
 		 225 aa  232  3e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  51.13 
 
 		 229 aa  228  4e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  50.68 
 
 		 229 aa  228  7e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4354  ABC transporter related  52.91 
 
 		 230 aa  226  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  51.82 
 
 		 239 aa  224  7e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  52.04 
 
 		 236 aa  224  9e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  50.23 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  52.27 
 
 		 230 aa  222  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  49.32 
 
 		 235 aa  222  3e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  50.91 
 
 		 225 aa  221  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  51.58 
 
 		 277 aa  221  6e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  49.1 
 
 		 241 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  50 
 
 		 241 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  50.9 
 
 		 231 aa  219  1.9999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  50 
 
 		 226 aa  219  3e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  49.09 
 
 		 264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  50.22 
 
 		 237 aa  218  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  49.55 
 
 		 241 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1707  ABC transporter related  55.41 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  51.13 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  49.55 
 
 		 241 aa  217  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1893  ABC transporter related  54.95 
 
 		 238 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472097  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  52.04 
 
 		 236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  51.6 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  52.73 
 
 		 228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  50.91 
 
 		 237 aa  215  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  49.1 
 
 		 293 aa  215  5e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.09 
 
 		 274 aa  214  5.9999999999999996e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  52.34 
 
 		 249 aa  213  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  50 
 
 		 240 aa  213  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  50.45 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  51.8 
 
 		 236 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  51.12 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  48.87 
 
 		 653 aa  213  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  50.67 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0180  ABC transporter related  51.57 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0585319 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  50.23 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  46.4 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  47.25 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  49.1 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  52.68 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  49.55 
 
 		 232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  49.77 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  51.12 
 
 		 238 aa  212  2.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  51.38 
 
 		 222 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  48.64 
 
 		 246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  49.77 
 
 		 226 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3708  ABC transporter-related protein  50.68 
 
 		 254 aa  211  5.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00747361 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  46.82 
 
 		 235 aa  211  5.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  48.18 
 
 		 255 aa  211  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 226 aa  211  7e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 		 226 aa  211  9e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  47.51 
 
 		 230 aa  210  1e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  50.45 
 
 		 235 aa  210  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 228 aa  210  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  49.55 
 
 		 235 aa  210  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  48.86 
 
 		 228 aa  210  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  49.09 
 
 		 225 aa  211  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 226 aa  209  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  49.09 
 
 		 234 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  51.82 
 
 		 565 aa  210  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  47.09 
 
 		 230 aa  210  2e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  49.55 
 
 		 246 aa  209  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  50.9 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 226 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 226 aa  209  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  49.77 
 
 		 226 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 226 aa  209  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 226 aa  209  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  49.77 
 
 		 226 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  50.69 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  48.62 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 226 aa  208  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  48.4 
 
 		 256 aa  209  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  49.09 
 
 		 234 aa  208  5e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  46.82 
 
 		 228 aa  208  5e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  50.92 
 
 		 242 aa  208  6e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  49.55 
 
 		 238 aa  208  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  48.18 
 
 		 252 aa  208  6e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  49.32 
 
 		 228 aa  208  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  48.64 
 
 		 225 aa  207  7e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1413  ABC transporter ATPase  50.68 
 
 		 233 aa  208  7e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  51.36 
 
 		 219 aa  207  8e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 232 aa  207  8e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  50.89 
 
 		 233 aa  207  8e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  47.3 
 
 		 237 aa  207  8e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  51.14 
 
 		 252 aa  207  8e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>