More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3337 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
246 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  71.55 
 
 
252 aa  364  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  66.52 
 
 
234 aa  322  4e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  65.53 
 
 
234 aa  321  6e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  66.22 
 
 
235 aa  321  6e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  66.08 
 
 
234 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  58.44 
 
 
319 aa  278  5e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  55.84 
 
 
286 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  51.56 
 
 
225 aa  246  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  52.7 
 
 
225 aa  242  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  53.6 
 
 
640 aa  241  6e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  52.97 
 
 
230 aa  241  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  53.18 
 
 
240 aa  239  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  50.66 
 
 
230 aa  239  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  51.54 
 
 
232 aa  237  1e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  47.52 
 
 
241 aa  237  1e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  50.88 
 
 
242 aa  237  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  51.6 
 
 
234 aa  236  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  50.88 
 
 
232 aa  236  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  51.6 
 
 
234 aa  236  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  50 
 
 
239 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  47.84 
 
 
236 aa  236  4e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  51.8 
 
 
239 aa  234  7e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  47.52 
 
 
241 aa  234  8e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  51.12 
 
 
225 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  49.79 
 
 
642 aa  233  1.0000000000000001e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  50.22 
 
 
241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  47.33 
 
 
667 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  48.07 
 
 
235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  49.78 
 
 
642 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  50 
 
 
231 aa  233  3e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  47.33 
 
 
667 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  48.32 
 
 
682 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  51.56 
 
 
253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  50.22 
 
 
237 aa  232  5e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  49.14 
 
 
682 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  51.56 
 
 
253 aa  231  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  50 
 
 
228 aa  231  6e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  51.11 
 
 
248 aa  231  9e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  52.02 
 
 
653 aa  231  9e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  46.28 
 
 
241 aa  230  1e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  52.13 
 
 
241 aa  230  2e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  53 
 
 
222 aa  229  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  45.87 
 
 
246 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  49.1 
 
 
226 aa  229  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  48.9 
 
 
228 aa  229  5e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  48.28 
 
 
252 aa  228  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  48.89 
 
 
256 aa  228  7e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  48.1 
 
 
266 aa  228  7e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  50 
 
 
226 aa  228  8e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  46.64 
 
 
226 aa  228  8e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  47.16 
 
 
260 aa  227  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  48.91 
 
 
227 aa  228  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  49.13 
 
 
656 aa  227  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  50.45 
 
 
226 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  47.84 
 
 
253 aa  228  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
226 aa  226  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
226 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
226 aa  226  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
226 aa  226  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  48.51 
 
 
242 aa  226  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
226 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  48.47 
 
 
240 aa  226  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  46.72 
 
 
251 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  49.56 
 
 
668 aa  226  2e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  49.13 
 
 
656 aa  226  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  45.69 
 
 
252 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  47.75 
 
 
244 aa  226  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  49.12 
 
 
249 aa  226  3e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  48.46 
 
 
648 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 
226 aa  226  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  48.46 
 
 
648 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  48.7 
 
 
255 aa  226  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  48.2 
 
 
226 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 
226 aa  225  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  49.11 
 
 
226 aa  225  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  47.98 
 
 
229 aa  224  1e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  49.15 
 
 
244 aa  224  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  49.55 
 
 
248 aa  223  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  48.44 
 
 
247 aa  223  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  50.23 
 
 
238 aa  223  2e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  48.65 
 
 
230 aa  223  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  48.88 
 
 
233 aa  223  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  48.21 
 
 
228 aa  223  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.23 
 
 
258 aa  222  3e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  46.26 
 
 
228 aa  222  4.9999999999999996e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  47.6 
 
 
259 aa  221  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  51.14 
 
 
228 aa  221  7e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  46.26 
 
 
241 aa  221  7e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  48.66 
 
 
235 aa  221  8e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  50.22 
 
 
228 aa  221  9e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  47.32 
 
 
224 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8875  ABC transporter-related protein  48.67 
 
 
243 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534003  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2850  hypothetical protein  47.14 
 
 
229 aa  221  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  47.32 
 
 
224 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  48.67 
 
 
644 aa  220  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  47.32 
 
 
224 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  46.43 
 
 
224 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  48.48 
 
 
652 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 
224 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>