More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2603 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  100 
 
 
271 aa  536  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  73.53 
 
 
274 aa  389  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  72.01 
 
 
277 aa  380  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  76.03 
 
 
268 aa  373  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  74.18 
 
 
258 aa  373  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  69.92 
 
 
250 aa  335  5.999999999999999e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  66.95 
 
 
258 aa  330  1e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  65.99 
 
 
256 aa  328  6e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  66.53 
 
 
280 aa  323  2e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  65.59 
 
 
258 aa  318  5e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  65.15 
 
 
247 aa  318  6e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  64.68 
 
 
263 aa  317  1e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  63.18 
 
 
255 aa  310  1e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  63.56 
 
 
252 aa  310  2e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  61.57 
 
 
455 aa  310  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  59.52 
 
 
266 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  62.65 
 
 
258 aa  307  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  63.14 
 
 
255 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  62.45 
 
 
279 aa  306  2.0000000000000002e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  60.26 
 
 
259 aa  305  6e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  60.74 
 
 
264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  59.59 
 
 
277 aa  302  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  64.13 
 
 
253 aa  299  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  62.93 
 
 
255 aa  299  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  60.17 
 
 
255 aa  297  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  60.57 
 
 
253 aa  296  2e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  57.96 
 
 
256 aa  296  3e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  63.84 
 
 
445 aa  295  4e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  59.92 
 
 
262 aa  294  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  66.81 
 
 
257 aa  293  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  59.05 
 
 
264 aa  293  3e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  67.3 
 
 
250 aa  291  8e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  57.44 
 
 
291 aa  286  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  61.21 
 
 
245 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  60.36 
 
 
261 aa  281  5.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  58.23 
 
 
288 aa  282  5.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  58.33 
 
 
247 aa  275  8e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  58.05 
 
 
302 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  61.14 
 
 
244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  61.92 
 
 
258 aa  271  7e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  58.02 
 
 
255 aa  271  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  59.17 
 
 
312 aa  270  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  55.74 
 
 
245 aa  267  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  57.14 
 
 
279 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  56.38 
 
 
293 aa  255  5e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  56.72 
 
 
277 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  54.1 
 
 
255 aa  248  9e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  54.15 
 
 
252 aa  245  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  55.19 
 
 
249 aa  244  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  53.07 
 
 
243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  53.25 
 
 
266 aa  241  7.999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  53.07 
 
 
256 aa  241  9e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  56.58 
 
 
257 aa  240  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  51.37 
 
 
279 aa  238  9e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  57.77 
 
 
243 aa  235  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  49.39 
 
 
253 aa  235  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  51.97 
 
 
269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  45.91 
 
 
228 aa  233  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  46.61 
 
 
225 aa  231  8.000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  50.66 
 
 
244 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  50.43 
 
 
255 aa  226  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  49.12 
 
 
240 aa  227  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  56.38 
 
 
249 aa  227  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  53.91 
 
 
241 aa  227  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  51.98 
 
 
272 aa  225  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  44.75 
 
 
226 aa  225  7e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  47.71 
 
 
225 aa  224  9e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  45.66 
 
 
230 aa  223  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  50.4 
 
 
271 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  53.21 
 
 
248 aa  219  5e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  49.37 
 
 
239 aa  218  7e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  46.3 
 
 
227 aa  218  7.999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  51.72 
 
 
247 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  45.58 
 
 
230 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  55.65 
 
 
249 aa  215  7e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  48.65 
 
 
222 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  47.03 
 
 
229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  55.17 
 
 
224 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  48.2 
 
 
224 aa  211  1e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  46.79 
 
 
241 aa  208  6e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  43.44 
 
 
248 aa  207  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  42.68 
 
 
246 aa  207  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  41.44 
 
 
240 aa  206  3e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  51.75 
 
 
269 aa  206  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.47 
 
 
253 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  46.46 
 
 
653 aa  206  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  46.33 
 
 
222 aa  205  6e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  44.68 
 
 
248 aa  205  6e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  47.32 
 
 
231 aa  204  8e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  44.25 
 
 
266 aa  204  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  47.39 
 
 
233 aa  204  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  47.32 
 
 
231 aa  203  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 
246 aa  202  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  46.36 
 
 
227 aa  202  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  46.3 
 
 
228 aa  202  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  45.45 
 
 
229 aa  202  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  44.8 
 
 
229 aa  202  6e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1025  ABC transporter related  45.45 
 
 
223 aa  202  7e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490239  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 
227 aa  201  7e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  44 
 
 
226 aa  202  7e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>