More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4354 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4354  ABC transporter related  100 
 
 		 230 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0180  ABC transporter related  92.98 
 
 		 231 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0585319 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  65.02 
 
 		 252 aa  301  7.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  58.77 
 
 		 565 aa  256  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  58.56 
 
 		 563 aa  249  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  55.25 
 
 		 239 aa  226  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  52.91 
 
 		 222 aa  226  2e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0955  ABC transporter related protein  51.75 
 
 		 240 aa  219  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0487401  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  48.66 
 
 		 225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  46.82 
 
 		 237 aa  215  5e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26100  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  49.78 
 
 		 232 aa  214  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723812  normal  0.918688 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  51.12 
 
 		 240 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2086  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2377  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1113  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1392  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3285  ABC transporter related  47.27 
 
 		 249 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1473  ABC-transporter ATP binding protein  49.32 
 
 		 233 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3144  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 233 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3258  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 233 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.219344  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  48.9 
 
 		 233 aa  211  9e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  48.68 
 
 		 240 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  48.68 
 
 		 240 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  48.68 
 
 		 240 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0367  ABC transporter related  47.96 
 
 		 244 aa  210  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  48.86 
 
 		 237 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  46.52 
 
 		 230 aa  209  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 		 235 aa  208  5e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  48 
 
 		 228 aa  208  6e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1769  ABC transporter related  50 
 
 		 247 aa  207  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2345  ABC transporter, ATP-binding protein  47.96 
 
 		 233 aa  207  8e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  46.82 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  48.67 
 
 		 241 aa  206  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  48.42 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2540  ABC transporter related  46.09 
 
 		 241 aa  206  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.656818  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2391  ABC transporter related  46.12 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  46.61 
 
 		 229 aa  205  4e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1100  ABC transporter related  47.95 
 
 		 236 aa  205  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  48.02 
 
 		 238 aa  205  5e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  46.61 
 
 		 229 aa  204  8e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  49.32 
 
 		 243 aa  204  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  47.06 
 
 		 224 aa  204  9e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  47.06 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  45.91 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1252  ABC transporter related  48.44 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.252759 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  47.49 
 
 		 248 aa  202  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  47.49 
 
 		 248 aa  202  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  45.66 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  48.65 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  46.22 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  47.06 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  47.06 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  48.85 
 
 		 241 aa  202  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  47.95 
 
 		 249 aa  202  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  44.29 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  48.42 
 
 		 253 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  48.42 
 
 		 253 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  47.93 
 
 		 222 aa  202  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  48.43 
 
 		 277 aa  202  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  46.61 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  44.55 
 
 		 237 aa  202  5e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 224 aa  201  6e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  44.29 
 
 		 240 aa  201  6e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  41.55 
 
 		 223 aa  201  6e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 221 aa  201  6e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  47.06 
 
 		 263 aa  201  7e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  44.24 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  43.89 
 
 		 256 aa  201  7e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 224 aa  201  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 224 aa  201  8e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 		 224 aa  201  9e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  47.06 
 
 		 224 aa  201  9e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  45.05 
 
 		 232 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  46.58 
 
 		 242 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  44.59 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  50.22 
 
 		 230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  44.75 
 
 		 226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  46.58 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1647  ABC transporter related  46.22 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.204823  hitchhiker  0.000330012 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  47.49 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  45.33 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  44.84 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  46.02 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0270  ABC transporter related  48.43 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  46.3 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  43.75 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  47.51 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  41.63 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  48.18 
 
 		 237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  48.18 
 
 		 237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  49.55 
 
 		 272 aa  198  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 		 233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  42.08 
 
 		 241 aa  198  5e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  48.68 
 
 		 255 aa  198  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3939  ABC transporter, ATPase subunit  47.73 
 
 		 236 aa  197  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.920707  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  48.18 
 
 		 229 aa  197  9e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  46.61 
 
 		 236 aa  197  9e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.36 
 
 		 234 aa  197  9e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>