More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_25580 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_25580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  100 
 
 
280 aa  553  1e-156  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  62.3 
 
 
259 aa  278  9e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3778  ABC transporter related  66.81 
 
 
233 aa  266  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0442  ABC transporter related  62.95 
 
 
305 aa  266  4e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  58.64 
 
 
241 aa  250  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.602292  normal  0.126496 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1611  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  58.41 
 
 
357 aa  249  3e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5553  ABC transporter related protein  57.27 
 
 
258 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7376  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component-like protein  55.84 
 
 
280 aa  240  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6782  ABC transporter related  55.66 
 
 
225 aa  235  8e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3127  ABC transporter related protein  55.11 
 
 
289 aa  231  7.000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0957069  decreased coverage  0.0000103375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7925  ABC transporter related  55.05 
 
 
228 aa  231  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0812  ABC transporter related  52.77 
 
 
228 aa  228  8e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0526  ABC transporter related  52.17 
 
 
237 aa  227  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4388  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  54.42 
 
 
238 aa  225  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119739  normal  0.0787869 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07200  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  51.87 
 
 
242 aa  225  8e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.408967  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02440  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.97 
 
 
227 aa  219  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233481  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2822  ABC transporter related protein  56.77 
 
 
234 aa  217  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.794487  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3473  ABC transporter related protein  53.67 
 
 
238 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745227  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3844  ABC transporter related protein  48.9 
 
 
225 aa  216  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.67 
 
 
264 aa  209  6e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0302  ABC transporter related protein  52.49 
 
 
228 aa  207  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.25 
 
 
280 aa  207  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  47.49 
 
 
232 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  48.98 
 
 
277 aa  206  5e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  45.56 
 
 
252 aa  205  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  42.29 
 
 
238 aa  204  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.18 
 
 
274 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1616  ABC transporter related protein  47.71 
 
 
230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  44.89 
 
 
288 aa  198  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.77 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  45.09 
 
 
224 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1342  ABC transporter related  50.91 
 
 
242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525912  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  41.18 
 
 
240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  41.74 
 
 
242 aa  197  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  45.98 
 
 
225 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  45.98 
 
 
225 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  45.04 
 
 
255 aa  196  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  45.08 
 
 
258 aa  196  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3828  ABC transporter related  52.94 
 
 
226 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0596278  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.32 
 
 
231 aa  195  6e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.7 
 
 
239 aa  195  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  48.68 
 
 
247 aa  195  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0964  ABC transporter related  47.95 
 
 
241 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0700  ABC transporter related protein  50.67 
 
 
242 aa  193  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  44.2 
 
 
224 aa  193  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  41.18 
 
 
277 aa  192  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1200  ABC transporter related protein  45.74 
 
 
237 aa  192  6e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.105172 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.66 
 
 
238 aa  192  7e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  46.35 
 
 
255 aa  192  7e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  47.09 
 
 
262 aa  192  7e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  47.16 
 
 
266 aa  191  9e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  47.22 
 
 
244 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  47.3 
 
 
271 aa  191  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.53 
 
 
233 aa  191  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  45.49 
 
 
253 aa  191  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  46.5 
 
 
258 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1526  ABC transporter related protein  43.69 
 
 
254 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4171  ABC transporter related  45.67 
 
 
339 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  41.1 
 
 
227 aa  190  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3550  ABC transporter related protein  48.02 
 
 
238 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.69 
 
 
236 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  41.55 
 
 
227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04770  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.58 
 
 
253 aa  190  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4805  ABC transporter related  48.88 
 
 
245 aa  189  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  44.6 
 
 
228 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3382  ABC transporter related  43.3 
 
 
225 aa  189  5e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0956  ABC transporter related protein  44 
 
 
346 aa  189  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.121187  hitchhiker  0.00122332 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2625  lipoprotein ABC transporter, ATP-binding protein LolD  46.85 
 
 
224 aa  188  7e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.91 
 
 
249 aa  188  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  41.95 
 
 
252 aa  188  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  40 
 
 
227 aa  188  8e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  42.37 
 
 
242 aa  187  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  42.8 
 
 
291 aa  188  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  41.1 
 
 
254 aa  187  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  43.56 
 
 
241 aa  187  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  46.5 
 
 
246 aa  187  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.09 
 
 
230 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  46.43 
 
 
259 aa  187  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  45.29 
 
 
240 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.92 
 
 
231 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  49.77 
 
 
256 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1692  ABC transporter, ATP-binding protein  40.99 
 
 
219 aa  186  3e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.623229 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  50.22 
 
 
268 aa  186  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  47.22 
 
 
221 aa  186  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  40.35 
 
 
248 aa  186  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  47.54 
 
 
255 aa  186  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  47.73 
 
 
255 aa  186  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1768  ABC transporter related  43.15 
 
 
315 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  46.75 
 
 
235 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  42.99 
 
 
230 aa  186  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_003296  RS03080  ABC transporter ATP-binding protein  44.03 
 
 
260 aa  186  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.953982  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  47.24 
 
 
302 aa  186  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.2 
 
 
236 aa  186  5e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  45.02 
 
 
654 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  46.85 
 
 
238 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1291  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  42.86 
 
 
235 aa  185  6e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.286185 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.47 
 
 
253 aa  185  6e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  44.07 
 
 
248 aa  185  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.79 
 
 
233 aa  185  7e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  47.09 
 
 
445 aa  185  8e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>