More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3332 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3332  ABC transporter related  100 
 
 
259 aa  525  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0523  ABC transporter related  75.1 
 
 
254 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1308  peptide ABC transporter ATPase  61.04 
 
 
252 aa  317  7.999999999999999e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000199498  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0974  ABC transporter, ATP-binding protein  59.27 
 
 
250 aa  314  9e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1913  peptide ABC transporter ATPase  62.6 
 
 
259 aa  312  3.9999999999999997e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.334881  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0836  peptide ABC transporter ATPase  56 
 
 
251 aa  304  9.000000000000001e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.506405  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1091  ABC transporter related  54.18 
 
 
251 aa  290  2e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0657  ABC transporter, ATP-binding protein  60.98 
 
 
253 aa  281  1e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.10153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4557  ABC transporter, ATP-binding protein  51.79 
 
 
256 aa  276  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124058  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4964  bacitracin export ATP-binding protein BceA  50.6 
 
 
256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2204  ABC transporter, ATP-binding protein  53.06 
 
 
249 aa  272  5.000000000000001e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4950  bacitracin export ATP-binding protein BceA  50.2 
 
 
256 aa  268  7e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3481  ABC transporter-related protein  48.62 
 
 
256 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4723  ABC transporter ATP-binding protein  48.41 
 
 
256 aa  266  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4581  ABC transporter, ATP-binding protein  48.41 
 
 
256 aa  266  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5085  ABC transporter ATP-binding protein  48.41 
 
 
256 aa  266  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4946  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  48.41 
 
 
256 aa  266  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4956  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  49.21 
 
 
256 aa  266  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4985  ABC transporter, ATP-binding protein  48.41 
 
 
256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4565  ABC transporter, ATP-binding protein  48.41 
 
 
256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0124496  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4972  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  48.41 
 
 
256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0279  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  48.81 
 
 
256 aa  266  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4671  ABC transporter related  48.41 
 
 
256 aa  263  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1789  ABC transporter related  50.8 
 
 
251 aa  260  2e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0954945  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1079  ABC transporter related  48.64 
 
 
276 aa  258  5.0000000000000005e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2702  ABC transporter related  48.8 
 
 
251 aa  256  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3418  ABC transporter-related protein  49.6 
 
 
266 aa  256  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0483067  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2646  ABC transporter related  48.8 
 
 
251 aa  256  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0841  ABC transporter, ATP-binding protein  48.44 
 
 
255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.598404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0380  ABC transporter, ATP-binding protein  49 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4881  ABC transporter, ATP-binding protein  49 
 
 
253 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4857  ABC transporter, ATP-binding protein  49 
 
 
253 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4888  ABC transporter, ATP-binding protein  49.4 
 
 
253 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4576  ABC transporter related  49 
 
 
253 aa  251  6e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2175  ABC transporter related protein  49.8 
 
 
274 aa  251  6e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4659  ABC transporter related  48.81 
 
 
253 aa  249  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4643  ABC transporter ATP-binding protein  49.4 
 
 
253 aa  250  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4731  ABC transporter ATP-binding protein  49.41 
 
 
250 aa  249  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4478  ABC transporter, ATP-binding protein  49.4 
 
 
253 aa  250  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4571  ABC transporter, ATP-binding protein  49.41 
 
 
250 aa  249  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00946862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4496  ABC transporter, ATP-binding protein  49.4 
 
 
253 aa  250  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4591  ABC transporter, ATP-binding protein  49.41 
 
 
250 aa  249  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4997  ABC transporter ATP-binding protein  49.4 
 
 
253 aa  250  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5091  ABC transporter ATP-binding protein  49.41 
 
 
250 aa  249  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4867  ABC transporter, ATP-binding protein  49.4 
 
 
253 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4952  ABC transporter, ATP-binding protein  49.41 
 
 
250 aa  249  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2310  ABC transporter related  49 
 
 
253 aa  249  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00369124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2023  ABC transporter, ATP-binding protein  49 
 
 
253 aa  249  4e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3486  ABC transporter-related protein  49.01 
 
 
250 aa  248  6e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0268  ABC transporter, ATP-binding protein  49.01 
 
 
250 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4965  ABC transporter, ATP-binding protein  49.01 
 
 
250 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4993  ABC transporter, ATP-binding protein  48.62 
 
 
250 aa  247  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0493  ABC transporter related  47.31 
 
 
259 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4980  ABC transporter, ATP-binding protein  48.62 
 
 
250 aa  246  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  47.31 
 
 
256 aa  246  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4334  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
258 aa  245  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4171  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
258 aa  245  4e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.402066  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4517  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
258 aa  245  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4182  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
258 aa  245  4e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4283  ABC transporter related  50 
 
 
258 aa  246  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4669  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
258 aa  245  4e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0679  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
258 aa  246  4e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000150042  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2843  ABC transporter, ATP-binding protein  48.39 
 
 
253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4555  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
258 aa  245  6e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5201  bacitracin export ATP-binding protein BceA  46.86 
 
 
255 aa  244  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0119  ABC transporter  47.06 
 
 
256 aa  244  8e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.393598  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4528  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
258 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1417  ABC transporter related  45.74 
 
 
279 aa  244  9.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.153222  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4570  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
258 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0118  ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 
256 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3152  ABC transporter-related protein  49.62 
 
 
258 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4681  ABC transporter related  48.62 
 
 
250 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1938  ABC transporter related  47.37 
 
 
275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305639  normal  0.108587 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2575  ABC transporter, ATP-binding protein  44.62 
 
 
256 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2659  ABC transporter, ATP-binding protein  43.85 
 
 
256 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00013766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2621  ABC transporter, ATP-binding protein  43.46 
 
 
256 aa  239  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.012082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2383  ABC transporter, ATP-binding protein  44.23 
 
 
256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0355575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2349  ABC transporter, ATP-binding protein  44.23 
 
 
256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0800376  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2427  ABC transporter ATP-binding protein  43.85 
 
 
256 aa  237  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2531  ABC transporter related  43.46 
 
 
256 aa  237  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2603  ABC transporter ATP-binding protein  43.85 
 
 
256 aa  237  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2620  ABC transporter, ATP-binding protein  43.85 
 
 
256 aa  237  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014367 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03360  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.49 
 
 
255 aa  235  6e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.922204 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5204  bacitracin export ATP-binding protein BceA  47.01 
 
 
253 aa  234  9e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2748  ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 
256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.403092  hitchhiker  0.000000938072 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0021  ABC transporter, ATP-binding protein  45.64 
 
 
252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2306  ABC transporter related  45.38 
 
 
256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000206589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4798  ABC transporter, ATP-binding protein  48.93 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313753  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1526  ABC transporter related protein  48.4 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2110  ABC transporter related protein  44.88 
 
 
257 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2724  ABC transporter related  45.64 
 
 
252 aa  229  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2781  ABC transporter related  45.64 
 
 
252 aa  229  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2420  ABC transporter, ATP-binding protein  45.42 
 
 
255 aa  229  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.658909  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5251  bacitracin export ATP-binding protein BceA  47.64 
 
 
253 aa  229  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0684  ABC transporter related  46.89 
 
 
253 aa  229  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0699  ABC transporter related  46.89 
 
 
253 aa  229  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.184929  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2490  ABC transporter, ATP-binding protein  45.42 
 
 
270 aa  228  7e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.755313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2196  ABC transporter related  45.42 
 
 
258 aa  228  7e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0111069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2355  ABC transporter, ATP-binding protein  45.42 
 
 
255 aa  228  9e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2972  ABC transporter, ATP-binding protein  45.42 
 
 
255 aa  228  9e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.344281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>