More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0119 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0118  ABC transporter, ATP-binding protein  99.61 
 
 		 256 aa  515  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0119  ABC transporter  100 
 
 		 256 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.393598  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0841  ABC transporter, ATP-binding protein  74.41 
 
 		 255 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.598404  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1417  ABC transporter related  63.45 
 
 		 279 aa  347  9e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.153222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03360  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  63.1 
 
 		 255 aa  344  1e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.922204 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1079  ABC transporter related  60.56 
 
 		 276 aa  334  7.999999999999999e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1938  ABC transporter related  60.56 
 
 		 275 aa  313  9.999999999999999e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305639  normal  0.108587 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0279  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  55.24 
 
 		 256 aa  293  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4956  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  55.65 
 
 		 256 aa  293  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4985  ABC transporter, ATP-binding protein  55.24 
 
 		 256 aa  291  7e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4565  ABC transporter, ATP-binding protein  55.24 
 
 		 256 aa  291  7e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0124496  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4671  ABC transporter related  54.84 
 
 		 256 aa  291  7e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4972  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  55.24 
 
 		 256 aa  291  7e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4723  ABC transporter ATP-binding protein  55.24 
 
 		 256 aa  291  9e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4581  ABC transporter, ATP-binding protein  55.24 
 
 		 256 aa  291  9e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5085  ABC transporter ATP-binding protein  55.24 
 
 		 256 aa  291  9e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4946  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  55.24 
 
 		 256 aa  291  9e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3481  ABC transporter-related protein  53.54 
 
 		 256 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4557  ABC transporter, ATP-binding protein  54.37 
 
 		 256 aa  287  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124058  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4950  bacitracin export ATP-binding protein BceA  53.97 
 
 		 256 aa  286  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4881  ABC transporter, ATP-binding protein  55.2 
 
 		 253 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4888  ABC transporter, ATP-binding protein  55.2 
 
 		 253 aa  285  4e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4964  bacitracin export ATP-binding protein BceA  53.57 
 
 		 256 aa  285  5e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3418  ABC transporter-related protein  55.6 
 
 		 266 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0483067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4867  ABC transporter, ATP-binding protein  55.2 
 
 		 253 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5201  bacitracin export ATP-binding protein BceA  54.07 
 
 		 255 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4643  ABC transporter ATP-binding protein  55.2 
 
 		 253 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4478  ABC transporter, ATP-binding protein  55.2 
 
 		 253 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4496  ABC transporter, ATP-binding protein  55.2 
 
 		 253 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2023  ABC transporter, ATP-binding protein  55.6 
 
 		 253 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4857  ABC transporter, ATP-binding protein  54.8 
 
 		 253 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4997  ABC transporter ATP-binding protein  55.2 
 
 		 253 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2843  ABC transporter, ATP-binding protein  54.8 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4576  ABC transporter related  54 
 
 		 253 aa  280  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0380  ABC transporter, ATP-binding protein  54 
 
 		 253 aa  279  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2310  ABC transporter related  54.4 
 
 		 253 aa  279  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00369124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4659  ABC transporter related  55.2 
 
 		 253 aa  279  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1694  peptide ABC transporter ATPase  57.5 
 
 		 248 aa  278  6e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000011753  unclonable  4.03836e-28 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2110  ABC transporter related protein  51.97 
 
 		 257 aa  277  9e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2420  ABC transporter, ATP-binding protein  54.8 
 
 		 255 aa  276  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.658909  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5204  bacitracin export ATP-binding protein BceA  54.8 
 
 		 253 aa  276  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2162  ABC transporter, ATP-binding protein  54.8 
 
 		 255 aa  276  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.754182  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2490  ABC transporter, ATP-binding protein  54.8 
 
 		 270 aa  276  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.755313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2196  ABC transporter related  54.8 
 
 		 258 aa  275  4e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0111069  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2972  ABC transporter, ATP-binding protein  54.4 
 
 		 255 aa  275  7e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.344281 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2355  ABC transporter, ATP-binding protein  54.4 
 
 		 255 aa  275  7e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0021  ABC transporter, ATP-binding protein  51 
 
 		 252 aa  273  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2146  ABC transporter, ATP-binding protein  54.8 
 
 		 255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.278232  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2406  ABC transporter, ATP-binding protein  54.4 
 
 		 255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5251  bacitracin export ATP-binding protein BceA  54.66 
 
 		 253 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1526  ABC transporter related protein  54.88 
 
 		 254 aa  268  8.999999999999999e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2659  ABC transporter, ATP-binding protein  52.38 
 
 		 256 aa  267  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00013766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4798  ABC transporter, ATP-binding protein  54.24 
 
 		 253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2621  ABC transporter, ATP-binding protein  51.98 
 
 		 256 aa  265  4e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.012082  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2306  ABC transporter related  53.39 
 
 		 256 aa  264  8e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000206589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2383  ABC transporter, ATP-binding protein  52.38 
 
 		 256 aa  264  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0355575  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0493  ABC transporter related  50.4 
 
 		 259 aa  264  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2575  ABC transporter, ATP-binding protein  51.98 
 
 		 256 aa  262  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2427  ABC transporter ATP-binding protein  51.98 
 
 		 256 aa  262  4e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2349  ABC transporter, ATP-binding protein  51.98 
 
 		 256 aa  262  4e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0800376  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2603  ABC transporter ATP-binding protein  51.98 
 
 		 256 aa  262  4e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2620  ABC transporter, ATP-binding protein  51.98 
 
 		 256 aa  262  4e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014367 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4528  ABC transporter, ATP-binding protein  55.16 
 
 		 258 aa  260  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4283  ABC transporter related  55.16 
 
 		 258 aa  260  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4570  ABC transporter, ATP-binding protein  55.16 
 
 		 258 aa  260  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0679  ABC transporter, ATP-binding protein  55.16 
 
 		 258 aa  260  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000150042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0684  ABC transporter related  50 
 
 		 253 aa  260  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4334  ABC transporter ATP-binding protein  55.16 
 
 		 258 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4171  ABC transporter, ATP-binding protein  55.16 
 
 		 258 aa  260  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.402066  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4182  ABC transporter, ATP-binding protein  55.16 
 
 		 258 aa  260  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2748  ABC transporter, ATP-binding protein  50.79 
 
 		 256 aa  259  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.403092  hitchhiker  0.000000938072 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4669  ABC transporter ATP-binding protein  55.16 
 
 		 258 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3152  ABC transporter-related protein  54.76 
 
 		 258 aa  259  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0699  ABC transporter related  50 
 
 		 253 aa  260  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.184929  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3486  ABC transporter-related protein  52.82 
 
 		 250 aa  259  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4555  ABC transporter, ATP-binding protein  55.16 
 
 		 258 aa  259  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4517  ABC transporter, ATP-binding protein  55.16 
 
 		 258 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4731  ABC transporter ATP-binding protein  53.63 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4571  ABC transporter, ATP-binding protein  53.63 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00946862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4591  ABC transporter, ATP-binding protein  53.63 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5091  ABC transporter ATP-binding protein  53.63 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4952  ABC transporter, ATP-binding protein  53.63 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2531  ABC transporter related  51.19 
 
 		 256 aa  259  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2175  ABC transporter related protein  48.62 
 
 		 274 aa  258  4e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2781  ABC transporter related  47.81 
 
 		 252 aa  259  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2724  ABC transporter related  47.81 
 
 		 252 aa  259  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4965  ABC transporter, ATP-binding protein  52.82 
 
 		 250 aa  256  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0268  ABC transporter, ATP-binding protein  52.82 
 
 		 250 aa  256  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4993  ABC transporter, ATP-binding protein  52.42 
 
 		 250 aa  254  7e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4980  ABC transporter, ATP-binding protein  52.42 
 
 		 250 aa  254  7e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4681  ABC transporter related  52.82 
 
 		 250 aa  254  8e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0314  ABC transporter, ATP-binding protein  47.56 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.924183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  51.59 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0341  ABC transporter related protein  48.78 
 
 		 251 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1308  peptide ABC transporter ATPase  48.61 
 
 		 252 aa  251  1e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000199498  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0836  peptide ABC transporter ATPase  50.4 
 
 		 251 aa  249  3e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.506405  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2892  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 251 aa  245  6e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3332  ABC transporter related  47.06 
 
 		 259 aa  244  8e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2956  ABC transporter, ATP-binding protein  51.05 
 
 		 251 aa  242  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000801785  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2646  ABC transporter related  46.22 
 
 		 251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>