More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1349 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  100 
 
 		 258 aa  509  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  71.43 
 
 		 250 aa  338  5.9999999999999996e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  67.48 
 
 		 274 aa  325  3e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  66.94 
 
 		 256 aa  323  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  67.5 
 
 		 258 aa  322  3e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  64.03 
 
 		 262 aa  322  3e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  69.62 
 
 		 280 aa  322  5e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  65.98 
 
 		 258 aa  321  6e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  65.1 
 
 		 277 aa  321  6e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  66.81 
 
 		 247 aa  321  9.000000000000001e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  70.13 
 
 		 268 aa  320  9.999999999999999e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  65.55 
 
 		 455 aa  317  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  70.95 
 
 		 257 aa  313  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  65.79 
 
 		 255 aa  313  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  65.69 
 
 		 266 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  65.65 
 
 		 255 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  65.69 
 
 		 271 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  64.41 
 
 		 291 aa  306  3e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  64.29 
 
 		 255 aa  305  5.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  59 
 
 		 277 aa  304  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  63.11 
 
 		 253 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  62.93 
 
 		 256 aa  303  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  64.47 
 
 		 445 aa  302  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  66.95 
 
 		 258 aa  300  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  66.23 
 
 		 255 aa  300  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  60.94 
 
 		 263 aa  297  1e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  65.67 
 
 		 252 aa  296  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  60.26 
 
 		 264 aa  291  5e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  63.76 
 
 		 253 aa  290  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  61.9 
 
 		 264 aa  288  5.0000000000000004e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  58.15 
 
 		 279 aa  283  2.0000000000000002e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  61.74 
 
 		 244 aa  281  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  58.97 
 
 		 259 aa  280  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  65.11 
 
 		 258 aa  275  4e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  62.5 
 
 		 293 aa  274  8e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  67.92 
 
 		 250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  59.83 
 
 		 261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  57.85 
 
 		 279 aa  270  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  59.32 
 
 		 245 aa  268  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  62.29 
 
 		 257 aa  268  5e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  60.58 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  61.43 
 
 		 245 aa  267  1e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  57.33 
 
 		 269 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  59.32 
 
 		 247 aa  265  7e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  57.81 
 
 		 243 aa  264  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  61.29 
 
 		 312 aa  263  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  58.52 
 
 		 256 aa  261  6.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  58.72 
 
 		 288 aa  260  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  60.76 
 
 		 255 aa  258  8e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  57.83 
 
 		 252 aa  255  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  57.39 
 
 		 266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  59.47 
 
 		 302 aa  252  5.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  54.82 
 
 		 253 aa  246  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  53.53 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  60.7 
 
 		 277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  56.62 
 
 		 243 aa  241  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  57.64 
 
 		 249 aa  241  9e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  54.01 
 
 		 255 aa  240  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  46.76 
 
 		 230 aa  236  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  52.05 
 
 		 225 aa  237  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  50.7 
 
 		 225 aa  236  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  56.52 
 
 		 244 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  53.3 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  56.28 
 
 		 272 aa  230  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  46.33 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  57.94 
 
 		 249 aa  227  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  57.8 
 
 		 248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  60.71 
 
 		 224 aa  225  6e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  56.9 
 
 		 241 aa  224  9e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  48.15 
 
 		 229 aa  224  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  53.46 
 
 		 240 aa  224  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  53.64 
 
 		 239 aa  222  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  53.78 
 
 		 269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  45.61 
 
 		 240 aa  219  3e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  53.14 
 
 		 247 aa  214  9e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  46.12 
 
 		 241 aa  214  9e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  57.26 
 
 		 249 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  43.58 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  45.79 
 
 		 227 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  50.45 
 
 		 268 aa  211  9e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  46.98 
 
 		 246 aa  211  9e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  49.32 
 
 		 229 aa  210  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  49.32 
 
 		 229 aa  210  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  48.4 
 
 		 249 aa  209  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  47.75 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  44.29 
 
 		 221 aa  208  7e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  54.24 
 
 		 247 aa  207  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  51.6 
 
 		 248 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  45 
 
 		 230 aa  207  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  50.23 
 
 		 239 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  43.78 
 
 		 238 aa  205  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  48.87 
 
 		 222 aa  204  9e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  47.51 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  43.7 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  42.79 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  51.14 
 
 		 244 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  46.92 
 
 		 225 aa  204  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  51.14 
 
 		 244 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  50.23 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  44.5 
 
 		 229 aa  203  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>