More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4490 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  100 
 
 		 257 aa  509  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  77.54 
 
 		 247 aa  373  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  74.68 
 
 		 250 aa  364  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  75.42 
 
 		 256 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  75.43 
 
 		 255 aa  360  9e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  75.43 
 
 		 255 aa  359  3e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  72.73 
 
 		 256 aa  347  1e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  70.76 
 
 		 455 aa  344  8.999999999999999e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  67.48 
 
 		 264 aa  338  5e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  70.95 
 
 		 258 aa  337  9.999999999999999e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  68.64 
 
 		 253 aa  334  5.999999999999999e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  68.64 
 
 		 262 aa  333  1e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  68.2 
 
 		 266 aa  333  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  72.17 
 
 		 268 aa  333  2e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  71.31 
 
 		 277 aa  332  3e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  69.2 
 
 		 255 aa  331  8e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  67.07 
 
 		 252 aa  330  1e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  67.22 
 
 		 258 aa  329  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  65.12 
 
 		 258 aa  329  2e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  70.18 
 
 		 445 aa  328  4e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  67.11 
 
 		 263 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  70.21 
 
 		 280 aa  326  3e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  64.34 
 
 		 274 aa  323  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  63.91 
 
 		 279 aa  320  9.999999999999999e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  66.11 
 
 		 258 aa  318  3.9999999999999996e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  63.98 
 
 		 291 aa  316  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  64.32 
 
 		 277 aa  315  4e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  67.69 
 
 		 253 aa  313  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  65.67 
 
 		 271 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  64.73 
 
 		 288 aa  310  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  63.87 
 
 		 255 aa  310  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  65.07 
 
 		 261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  60.63 
 
 		 259 aa  305  5.0000000000000004e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  64.78 
 
 		 264 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  69.41 
 
 		 250 aa  301  8.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  66.53 
 
 		 312 aa  298  8e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  64.71 
 
 		 245 aa  295  6e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  63.2 
 
 		 244 aa  294  1e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  63.98 
 
 		 247 aa  290  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  63.64 
 
 		 243 aa  289  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  65.4 
 
 		 255 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  63.29 
 
 		 252 aa  285  5.999999999999999e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  61.86 
 
 		 279 aa  283  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  62.08 
 
 		 257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  65.09 
 
 		 302 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  60.24 
 
 		 256 aa  281  6.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  68.09 
 
 		 258 aa  281  6.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  58.58 
 
 		 269 aa  279  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  59.41 
 
 		 293 aa  275  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  59.31 
 
 		 245 aa  267  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  59.5 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  63.87 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  64.41 
 
 		 277 aa  261  4.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  54.86 
 
 		 253 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  57.58 
 
 		 266 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  56.1 
 
 		 271 aa  259  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  56.17 
 
 		 243 aa  255  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  61.92 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  58.54 
 
 		 249 aa  253  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  58.33 
 
 		 244 aa  252  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  59.24 
 
 		 248 aa  247  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  63.68 
 
 		 224 aa  243  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  50.23 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  62.96 
 
 		 249 aa  243  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  49.31 
 
 		 230 aa  240  2e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  58.37 
 
 		 272 aa  239  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  52.74 
 
 		 255 aa  236  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  53.74 
 
 		 279 aa  236  4e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  50.46 
 
 		 225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  49.52 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  50.44 
 
 		 240 aa  226  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  54.66 
 
 		 247 aa  225  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.58 
 
 		 269 aa  224  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  50 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  45.54 
 
 		 227 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  45.66 
 
 		 229 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0758  ABC transporter related  49.36 
 
 		 237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0209945  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  45.45 
 
 		 255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  54.31 
 
 		 247 aa  218  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  48.89 
 
 		 232 aa  217  2e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  47.51 
 
 		 225 aa  217  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0222  ABC transporter related  53.57 
 
 		 247 aa  215  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256244  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  51.93 
 
 		 256 aa  215  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  49.78 
 
 		 240 aa  214  9e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  49.32 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  46.67 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  50.91 
 
 		 222 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  49.34 
 
 		 565 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  52.04 
 
 		 228 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  46.79 
 
 		 221 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  46.88 
 
 		 234 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  50.45 
 
 		 658 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  52.27 
 
 		 239 aa  212  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  45.71 
 
 		 226 aa  211  5.999999999999999e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4354  ABC transporter related  50.67 
 
 		 230 aa  212  5.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0180  ABC transporter related  50.67 
 
 		 231 aa  210  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0585319 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  49.33 
 
 		 226 aa  211  1e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  50.7 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  50.69 
 
 		 234 aa  210  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  50.69 
 
 		 234 aa  210  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>