More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5675 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  100 
 
 		 250 aa  498  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  70.83 
 
 		 247 aa  350  8.999999999999999e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  71.43 
 
 		 256 aa  347  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  71.73 
 
 		 258 aa  346  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  75.33 
 
 		 257 aa  339  2e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  71.67 
 
 		 277 aa  339  2e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  70.18 
 
 		 255 aa  340  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  71.43 
 
 		 258 aa  338  5e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  69.13 
 
 		 255 aa  337  8e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  72.15 
 
 		 280 aa  337  9.999999999999999e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  68.22 
 
 		 262 aa  336  2.9999999999999997e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  71.19 
 
 		 258 aa  334  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  69.66 
 
 		 271 aa  332  5e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  66.95 
 
 		 256 aa  329  3e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  66.11 
 
 		 455 aa  328  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  71.86 
 
 		 268 aa  328  5.0000000000000004e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  69.29 
 
 		 274 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  67.77 
 
 		 258 aa  324  7e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  66.38 
 
 		 266 aa  324  9e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  65.83 
 
 		 253 aa  323  2e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  65.94 
 
 		 263 aa  321  8e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  63.14 
 
 		 264 aa  319  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  63.98 
 
 		 291 aa  318  3.9999999999999996e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  65.94 
 
 		 279 aa  318  5e-86  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  66.81 
 
 		 445 aa  317  2e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  66.39 
 
 		 255 aa  315  5e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  61.98 
 
 		 277 aa  313  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  67.69 
 
 		 253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  67.37 
 
 		 252 aa  310  2e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  63.95 
 
 		 259 aa  306  2.0000000000000002e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  61.6 
 
 		 255 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  63.64 
 
 		 264 aa  298  4e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  70.51 
 
 		 250 aa  297  8e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  62.01 
 
 		 261 aa  296  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  61.7 
 
 		 288 aa  289  3e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  66.09 
 
 		 312 aa  288  4e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  61.86 
 
 		 247 aa  285  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  61.44 
 
 		 255 aa  281  6.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  63.93 
 
 		 258 aa  279  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  63.68 
 
 		 245 aa  279  4e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  61.4 
 
 		 244 aa  277  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  62.61 
 
 		 302 aa  277  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  61.11 
 
 		 257 aa  275  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  63.91 
 
 		 255 aa  269  2.9999999999999997e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  55.92 
 
 		 293 aa  268  7e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  55.82 
 
 		 269 aa  267  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  58.75 
 
 		 279 aa  266  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  57.39 
 
 		 243 aa  265  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  56.97 
 
 		 252 aa  264  8e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  54.36 
 
 		 266 aa  257  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  58.08 
 
 		 256 aa  256  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  55.93 
 
 		 245 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  59.75 
 
 		 277 aa  253  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  57.2 
 
 		 249 aa  252  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  55.19 
 
 		 271 aa  247  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  50.45 
 
 		 228 aa  246  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  54.43 
 
 		 243 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  52.52 
 
 		 255 aa  239  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  51.69 
 
 		 253 aa  239  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  55.41 
 
 		 279 aa  238  9e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  56.67 
 
 		 249 aa  236  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  56.12 
 
 		 241 aa  236  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  51.65 
 
 		 244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  50.92 
 
 		 225 aa  233  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  51.97 
 
 		 240 aa  230  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  52.86 
 
 		 272 aa  228  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  46.73 
 
 		 230 aa  228  8e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  59.61 
 
 		 224 aa  228  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  55 
 
 		 248 aa  227  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  60.43 
 
 		 249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  53.59 
 
 		 247 aa  218  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  47.03 
 
 		 229 aa  215  5.9999999999999996e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  45.21 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  46.36 
 
 		 225 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  50.68 
 
 		 653 aa  212  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  55.36 
 
 		 247 aa  211  7e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  50.65 
 
 		 239 aa  211  7.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.41 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  47.51 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  47.75 
 
 		 241 aa  207  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  44.65 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  49.3 
 
 		 231 aa  204  9e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  43.35 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  45.91 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0021  ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 		 252 aa  202  3e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  48.91 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  47.32 
 
 		 240 aa  202  4e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  43.84 
 
 		 221 aa  201  6e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  50.46 
 
 		 268 aa  201  8e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  45.41 
 
 		 230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1938  ABC transporter related  48.51 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305639  normal  0.108587 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2781  ABC transporter related  45.5 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2724  ABC transporter related  45.5 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  46.4 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0699  ABC transporter related  42.86 
 
 		 253 aa  198  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.184929  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0684  ABC transporter related  42.86 
 
 		 253 aa  198  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  45.62 
 
 		 228 aa  198  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  47.96 
 
 		 565 aa  198  7e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  43.9 
 
 		 251 aa  198  7e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>