More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0630 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  100 
 
 
268 aa  533  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  71.17 
 
 
231 aa  325  4.0000000000000003e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  70.98 
 
 
231 aa  322  4e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  69.2 
 
 
229 aa  318  7e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  71.23 
 
 
231 aa  316  3e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  69.2 
 
 
229 aa  315  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  69.09 
 
 
228 aa  310  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  63.88 
 
 
234 aa  295  5e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  66.51 
 
 
230 aa  291  7e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  64.41 
 
 
230 aa  286  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  62.77 
 
 
235 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  61.23 
 
 
235 aa  281  6.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0230  ABC transporter related  63.6 
 
 
232 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000298 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0222  ABC transporter related  63.6 
 
 
232 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0303  ABC transporter related  63.27 
 
 
232 aa  275  6e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0537962  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2803  ABC transporter related  62.83 
 
 
232 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0893633  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0206  ABC transporter related  64.19 
 
 
232 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  unclonable  0.000000000007713 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0284  ABC transporter related  62.83 
 
 
232 aa  271  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  hitchhiker  0.00000395766 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  62.56 
 
 
232 aa  270  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3402  ABC efflux pump, ATPase subunit  62.72 
 
 
232 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0029159  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  59.09 
 
 
240 aa  263  3e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  58.26 
 
 
231 aa  261  1e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  57.14 
 
 
229 aa  259  3e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  57.01 
 
 
229 aa  255  7e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  55 
 
 
225 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2260  ABC transporter related  53.57 
 
 
232 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549292  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1620  ABC transporter, ATPase subunit  56.56 
 
 
241 aa  243  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  50.92 
 
 
235 aa  241  9e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2582  ABC transporter related  53.81 
 
 
234 aa  235  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  54.03 
 
 
222 aa  222  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  48.62 
 
 
246 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  51.07 
 
 
238 aa  220  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  48.17 
 
 
242 aa  217  2e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  45.5 
 
 
240 aa  216  4e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  44.58 
 
 
241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 
221 aa  211  7.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  50.45 
 
 
258 aa  211  9e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  48.61 
 
 
220 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  47.27 
 
 
230 aa  210  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  48.67 
 
 
230 aa  210  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  45.74 
 
 
233 aa  210  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  45.73 
 
 
240 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  49.79 
 
 
277 aa  209  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.78 
 
 
274 aa  209  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  45.33 
 
 
247 aa  209  5e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  45.45 
 
 
226 aa  208  8e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  49.54 
 
 
220 aa  207  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  46.33 
 
 
242 aa  207  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  47.42 
 
 
249 aa  207  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  45 
 
 
226 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  46.76 
 
 
229 aa  207  2e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  45.3 
 
 
240 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
226 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1775  ABC transporter related  48.86 
 
 
298 aa  207  2e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  47.35 
 
 
255 aa  206  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  45.3 
 
 
240 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  47.48 
 
 
244 aa  206  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  44.54 
 
 
252 aa  206  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.27 
 
 
258 aa  206  3e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  44.95 
 
 
224 aa  206  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 
226 aa  206  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  45 
 
 
226 aa  206  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 
226 aa  206  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 
226 aa  206  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  45 
 
 
226 aa  206  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 
226 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  44.95 
 
 
224 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 
226 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  47.73 
 
 
248 aa  205  5e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  44.95 
 
 
224 aa  205  5e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2391  ABC transporter related  47.93 
 
 
253 aa  205  6e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  46.3 
 
 
237 aa  205  6e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  47.75 
 
 
258 aa  205  6e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  50 
 
 
233 aa  205  6e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 
226 aa  205  7e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  47.25 
 
 
246 aa  205  7e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  44.39 
 
 
226 aa  205  7e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  48.87 
 
 
227 aa  205  8e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  45.64 
 
 
264 aa  204  8e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  48.47 
 
 
231 aa  204  9e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  46.76 
 
 
244 aa  204  9e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  45.41 
 
 
224 aa  204  9e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  44.5 
 
 
224 aa  204  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  44.5 
 
 
224 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  44.02 
 
 
259 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  47.32 
 
 
258 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  44.5 
 
 
224 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  44.95 
 
 
235 aa  204  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 
226 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  44.5 
 
 
224 aa  203  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  44.5 
 
 
224 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  49.79 
 
 
252 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  49.56 
 
 
228 aa  203  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60790  ABC transporter ATP-binding protein  49.55 
 
 
228 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  44.04 
 
 
224 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  46.79 
 
 
291 aa  202  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5200  putative ABC transporter, ATP binding component  50 
 
 
238 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0864003  normal  0.0646011 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  45.74 
 
 
388 aa  202  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  46.4 
 
 
240 aa  203  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>