More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0892 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  100 
 
 
251 aa  516  1e-146  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  71.49 
 
 
238 aa  348  4e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  56.84 
 
 
293 aa  282  4.0000000000000003e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3170  ABC transporter related protein  60.7 
 
 
217 aa  264  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0178954  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0941  ATP binding protein of ABC transporter  59.13 
 
 
218 aa  259  3e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000194458  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  48.64 
 
 
240 aa  249  4e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  47.27 
 
 
241 aa  231  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  48.88 
 
 
248 aa  229  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  48.39 
 
 
221 aa  223  3e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3644  ABC transporter related  50.45 
 
 
221 aa  222  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  46.36 
 
 
237 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  48.44 
 
 
228 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  43.2 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  46.32 
 
 
238 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  47.53 
 
 
226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  48.02 
 
 
232 aa  219  3e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  48.2 
 
 
222 aa  219  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  48.02 
 
 
232 aa  218  7e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  48.44 
 
 
239 aa  218  7.999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  46.09 
 
 
230 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  47.91 
 
 
235 aa  218  8.999999999999998e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  48.88 
 
 
225 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  50 
 
 
288 aa  218  8.999999999999998e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  49.78 
 
 
256 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  48.39 
 
 
244 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  47.58 
 
 
231 aa  217  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  46.52 
 
 
654 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  47.98 
 
 
225 aa  216  4e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  47.75 
 
 
222 aa  215  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  51.16 
 
 
219 aa  215  5e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  46.46 
 
 
230 aa  215  5e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  44.64 
 
 
655 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  45.78 
 
 
228 aa  215  7e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  42.86 
 
 
650 aa  214  7e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  47.73 
 
 
231 aa  214  8e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  46.05 
 
 
235 aa  214  8e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  48.07 
 
 
266 aa  214  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  49.1 
 
 
253 aa  214  8e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  45.13 
 
 
228 aa  214  9e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  47.39 
 
 
229 aa  214  9e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.44 
 
 
647 aa  214  9e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  46.36 
 
 
231 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  44.26 
 
 
654 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  48.2 
 
 
253 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  48.2 
 
 
253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  43.09 
 
 
249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  47.11 
 
 
233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  45.65 
 
 
240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  45.5 
 
 
236 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  45.33 
 
 
226 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  43.46 
 
 
240 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6611  ABC transporter related  48.62 
 
 
660 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  42.48 
 
 
235 aa  211  7.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  49.12 
 
 
234 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  46.9 
 
 
241 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.52 
 
 
649 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  46.85 
 
 
233 aa  210  1e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  46.7 
 
 
256 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  47.75 
 
 
228 aa  211  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  48.18 
 
 
228 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.67 
 
 
274 aa  211  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  45.09 
 
 
229 aa  211  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  43.04 
 
 
653 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  48.02 
 
 
252 aa  210  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.29 
 
 
649 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  47.73 
 
 
221 aa  210  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  46.46 
 
 
241 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  44.74 
 
 
229 aa  210  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  45.25 
 
 
234 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  46.46 
 
 
241 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  45.13 
 
 
228 aa  210  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  47.75 
 
 
246 aa  210  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  48.65 
 
 
244 aa  210  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  45.78 
 
 
650 aa  209  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  47.84 
 
 
259 aa  209  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  44.25 
 
 
228 aa  209  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.73 
 
 
258 aa  209  3e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04891  ABC transporter ATP-binding protein  44.54 
 
 
228 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  44.87 
 
 
266 aa  209  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  43.17 
 
 
642 aa  209  4e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  43.32 
 
 
648 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  43.32 
 
 
648 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  43.36 
 
 
236 aa  208  5e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.4 
 
 
648 aa  209  5e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  45.33 
 
 
225 aa  209  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  49.77 
 
 
455 aa  209  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  43.32 
 
 
648 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  44.02 
 
 
234 aa  209  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  46.02 
 
 
236 aa  208  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  46.61 
 
 
234 aa  209  5e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.84 
 
 
646 aa  208  6e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  44.64 
 
 
241 aa  208  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.37 
 
 
264 aa  208  7e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  43.42 
 
 
228 aa  208  7e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  50.71 
 
 
256 aa  208  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  46.54 
 
 
262 aa  208  7e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  45 
 
 
229 aa  208  7e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  47.77 
 
 
238 aa  208  7e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  44.55 
 
 
220 aa  208  8e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  43.95 
 
 
232 aa  208  8e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>