More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2319 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2319  ABC transporter related  100 
 
 		 245 aa  476  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2588  ABC transporter related  56.78 
 
 		 247 aa  247  1e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0206492  hitchhiker  0.00398644 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  51.12 
 
 		 247 aa  214  7e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  52.94 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  48.28 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  51.16 
 
 		 255 aa  211  7e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  52.99 
 
 		 245 aa  210  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  54.13 
 
 		 244 aa  209  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.13 
 
 		 280 aa  210  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  50.7 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  52.53 
 
 		 243 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  47.46 
 
 		 258 aa  209  5e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  48.1 
 
 		 256 aa  208  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  50.88 
 
 		 252 aa  207  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  47.68 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  50.21 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  50 
 
 		 244 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  48.46 
 
 		 247 aa  205  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.58 
 
 		 646 aa  204  7e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  50.64 
 
 		 269 aa  204  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  46.81 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  49.14 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  53.67 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  46.98 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  55.09 
 
 		 258 aa  200  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  47.68 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  46.22 
 
 		 277 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  46.09 
 
 		 255 aa  198  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.52 
 
 		 264 aa  199  5e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  43.18 
 
 		 240 aa  198  6e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17610  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.42 
 
 		 250 aa  198  7.999999999999999e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00262944  normal  0.585837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  52.53 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  48.02 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  49.55 
 
 		 279 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  50.48 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  52.97 
 
 		 257 aa  195  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  48.7 
 
 		 293 aa  195  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  48.88 
 
 		 230 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  52.49 
 
 		 312 aa  195  7e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  48 
 
 		 291 aa  195  7e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  46.75 
 
 		 264 aa  195  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  53.77 
 
 		 257 aa  195  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  50 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  47.56 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  45.19 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  46.4 
 
 		 258 aa  193  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  50.22 
 
 		 258 aa  192  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  57 
 
 		 277 aa  192  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  49.52 
 
 		 271 aa  191  6e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  48.76 
 
 		 255 aa  191  8e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  54.5 
 
 		 235 aa  191  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  44.09 
 
 		 228 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  43.29 
 
 		 653 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  47.6 
 
 		 653 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  42.22 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  53 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.61 
 
 		 648 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  46.61 
 
 		 648 aa  189  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  44.98 
 
 		 263 aa  189  4e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  51.82 
 
 		 268 aa  189  4e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.15 
 
 		 648 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0437  ABC transporter related protein  47.49 
 
 		 229 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  46.15 
 
 		 648 aa  188  7e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.15 
 
 		 648 aa  188  7e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.15 
 
 		 648 aa  188  7e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  49.36 
 
 		 302 aa  188  7e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.15 
 
 		 648 aa  188  7e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  46.15 
 
 		 648 aa  188  7e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 		 279 aa  188  8e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3580  ABC transporter related protein  52.91 
 
 		 254 aa  188  8e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  52.29 
 
 		 271 aa  187  9e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.98 
 
 		 648 aa  187  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.98 
 
 		 648 aa  187  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.98 
 
 		 648 aa  187  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  47.98 
 
 		 455 aa  187  9e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  47.66 
 
 		 671 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0217  ABC transporter related protein  53.37 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.941766  normal  0.16938 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  40.87 
 
 		 642 aa  187  1e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  47.06 
 
 		 445 aa  187  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  45.95 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  48.37 
 
 		 655 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  44.84 
 
 		 240 aa  186  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  47.71 
 
 		 650 aa  186  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3930  ABC transporter related  51.16 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194421  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  51.38 
 
 		 248 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  50 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  47.69 
 
 		 234 aa  186  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3844  ABC transporter-related protein  51.16 
 
 		 222 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  45.33 
 
 		 231 aa  186  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  52.54 
 
 		 241 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  43.69 
 
 		 668 aa  186  4e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 		 222 aa  185  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  47.25 
 
 		 261 aa  185  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  49.55 
 
 		 272 aa  185  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0456  ABC transporter related  47.03 
 
 		 229 aa  185  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  46.32 
 
 		 643 aa  184  8e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.54 
 
 		 648 aa  184  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.54 
 
 		 648 aa  184  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  43.81 
 
 		 226 aa  184  9e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  46.08 
 
 		 682 aa  184  9e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>