More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3930 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3930  ABC transporter related  100 
 
 
222 aa  424  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194421  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3844  ABC transporter-related protein  99.1 
 
 
222 aa  421  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3787  ABC transporter, ATPase subunit  97.75 
 
 
222 aa  391  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0405178  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  51.58 
 
 
228 aa  210  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 
230 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  47.27 
 
 
715 aa  200  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  49.32 
 
 
248 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  47.96 
 
 
248 aa  199  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  45 
 
 
234 aa  199  3e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  52.25 
 
 
253 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  51.35 
 
 
253 aa  198  5e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  44.14 
 
 
232 aa  197  9e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  44.8 
 
 
239 aa  197  9e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  45.7 
 
 
242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  45.05 
 
 
224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  42.92 
 
 
229 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  43.5 
 
 
228 aa  196  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  43.56 
 
 
224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  43.56 
 
 
224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  43.56 
 
 
224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3459  ABC transporter related protein  50.45 
 
 
258 aa  195  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  43.11 
 
 
224 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  42.53 
 
 
225 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  47.96 
 
 
238 aa  194  6e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0366  ABC-type transport system, ATPase component PhnL  47.06 
 
 
245 aa  195  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  46.15 
 
 
237 aa  195  6e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  43.89 
 
 
642 aa  195  6e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  44.89 
 
 
224 aa  194  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2319  ABC transporter related  51.83 
 
 
245 aa  194  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  44.59 
 
 
242 aa  194  7e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  43.11 
 
 
224 aa  194  9e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  43.11 
 
 
224 aa  193  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  48.4 
 
 
244 aa  194  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  45.7 
 
 
226 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  43.11 
 
 
224 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  45.25 
 
 
230 aa  193  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  45.91 
 
 
228 aa  194  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  43.11 
 
 
224 aa  193  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  43.11 
 
 
224 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  45.7 
 
 
228 aa  192  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  52.49 
 
 
235 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  45.7 
 
 
226 aa  193  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  42.92 
 
 
220 aa  192  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  45.7 
 
 
226 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  44.8 
 
 
239 aa  192  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  42.67 
 
 
224 aa  192  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2835  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.15 
 
 
225 aa  192  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.21843  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  45.05 
 
 
225 aa  191  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  45.7 
 
 
226 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  45.7 
 
 
226 aa  191  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  45.7 
 
 
226 aa  191  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  45.7 
 
 
226 aa  191  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  45.7 
 
 
226 aa  191  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  45.7 
 
 
226 aa  191  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  47.98 
 
 
233 aa  191  7e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  45.7 
 
 
226 aa  191  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  45.7 
 
 
228 aa  191  8e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  40.72 
 
 
235 aa  191  8e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1663  ABC transporter, ATP-binding protein  47.09 
 
 
219 aa  191  9e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.557172 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  45.7 
 
 
226 aa  191  9e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  46.61 
 
 
229 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0183  ABC transporter related  39.91 
 
 
226 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.337585  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0188  ABC transporter related  39.91 
 
 
226 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  44.8 
 
 
226 aa  189  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 
233 aa  189  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  52.15 
 
 
236 aa  189  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  45.29 
 
 
240 aa  190  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.46 
 
 
236 aa  190  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  41.18 
 
 
234 aa  189  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  44.8 
 
 
232 aa  189  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  44.84 
 
 
246 aa  190  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.69 
 
 
233 aa  190  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  45.7 
 
 
234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  46.67 
 
 
671 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2051  peptide ABC transporter ATPase  43.81 
 
 
229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 
234 aa  189  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0269  ABC-type transport system, ATP-binding component  47.49 
 
 
227 aa  189  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  43.89 
 
 
230 aa  189  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3255  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.65 
 
 
318 aa  188  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  46.4 
 
 
249 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  50.45 
 
 
252 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2517  ABC transporter related protein  44.8 
 
 
255 aa  188  5.999999999999999e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  45.25 
 
 
235 aa  187  7e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  46.15 
 
 
252 aa  188  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  45.18 
 
 
239 aa  187  8e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.29 
 
 
234 aa  187  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  44.8 
 
 
253 aa  187  8e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  50 
 
 
246 aa  187  9e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  44.8 
 
 
250 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  43.05 
 
 
226 aa  187  1e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  50.23 
 
 
227 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  45.7 
 
 
644 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.14 
 
 
238 aa  187  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.84 
 
 
234 aa  186  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  41.63 
 
 
640 aa  186  2e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  43.89 
 
 
233 aa  186  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.84 
 
 
234 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
241 aa  186  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  44.75 
 
 
230 aa  186  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1251  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.85 
 
 
238 aa  186  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>