More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0269 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0269  ABC-type transport system, ATP-binding component  100 
 
 		 227 aa  450  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0796  ABC transporter related  64.38 
 
 		 299 aa  275  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1339  ATPase  61.36 
 
 		 232 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2955  ABC transporter related  60.91 
 
 		 250 aa  267  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.176786 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  57.34 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  57.34 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  54.3 
 
 		 230 aa  249  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  56.88 
 
 		 652 aa  248  5e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  58.45 
 
 		 230 aa  248  8e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  53.88 
 
 		 228 aa  245  3e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  53.88 
 
 		 239 aa  245  4.9999999999999997e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  53.42 
 
 		 232 aa  243  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  52.91 
 
 		 234 aa  242  3e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  50.91 
 
 		 230 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  51.13 
 
 		 234 aa  241  6e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  51.13 
 
 		 234 aa  241  6e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  52.51 
 
 		 226 aa  240  2e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  53.21 
 
 		 252 aa  239  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  51.83 
 
 		 235 aa  238  4e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  51.14 
 
 		 248 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  58.82 
 
 		 236 aa  237  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  51.14 
 
 		 248 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  54.3 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  50.45 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  51.36 
 
 		 222 aa  236  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  51.35 
 
 		 238 aa  236  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  53.81 
 
 		 241 aa  235  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  52.29 
 
 		 244 aa  234  6e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  53.21 
 
 		 226 aa  234  6e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  49.78 
 
 		 240 aa  234  7e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  53.42 
 
 		 645 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  58.06 
 
 		 651 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  49.55 
 
 		 642 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3482  ABC transporter related protein  53.18 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.782021  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  51.38 
 
 		 225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  53.15 
 
 		 715 aa  233  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  50.23 
 
 		 260 aa  232  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  51.38 
 
 		 229 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  48.87 
 
 		 230 aa  231  5e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  49.54 
 
 		 224 aa  231  8.000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  50.89 
 
 		 247 aa  231  9e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  53.7 
 
 		 228 aa  231  9e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  53.24 
 
 		 228 aa  230  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  51.14 
 
 		 242 aa  230  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  49.77 
 
 		 240 aa  230  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  54.26 
 
 		 654 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  51.82 
 
 		 291 aa  229  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  50.92 
 
 		 237 aa  229  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  52.31 
 
 		 228 aa  229  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  49.33 
 
 		 240 aa  229  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  52.73 
 
 		 253 aa  229  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  53.24 
 
 		 228 aa  229  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  50.91 
 
 		 661 aa  228  6e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  50.45 
 
 		 239 aa  228  8e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  50 
 
 		 241 aa  227  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  53.81 
 
 		 654 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  55.41 
 
 		 654 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  46.12 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  55.2 
 
 		 657 aa  226  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  50 
 
 		 241 aa  226  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  51.14 
 
 		 244 aa  226  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  52.86 
 
 		 644 aa  226  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  50.91 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  55.2 
 
 		 657 aa  225  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  49.11 
 
 		 658 aa  225  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  47.27 
 
 		 226 aa  226  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  49.08 
 
 		 259 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  48.02 
 
 		 653 aa  226  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0199  ABC transporter related  53.64 
 
 		 291 aa  225  4e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.500002  normal  0.26855 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  52.31 
 
 		 649 aa  225  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  47.27 
 
 		 226 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  49.07 
 
 		 642 aa  225  5.0000000000000005e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  50.46 
 
 		 649 aa  224  6e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0366  ABC-type transport system, ATPase component PhnL  52.27 
 
 		 245 aa  224  6e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  50.92 
 
 		 650 aa  224  7e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 		 226 aa  224  8e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  51.85 
 
 		 649 aa  224  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  52.86 
 
 		 663 aa  224  8e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  55.2 
 
 		 656 aa  223  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 		 226 aa  223  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  53.33 
 
 		 663 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0905  ABC transporter related  51.14 
 
 		 243 aa  224  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.072369  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 226 aa  223  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  50 
 
 		 653 aa  224  1e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  48.4 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  49.33 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  48.61 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3414  ABC transporter related  49.77 
 
 		 306 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  47.22 
 
 		 235 aa  222  3e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  49.77 
 
 		 657 aa  222  3e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  46.82 
 
 		 226 aa  222  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  50.23 
 
 		 681 aa  222  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  50.23 
 
 		 681 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  51.82 
 
 		 228 aa  222  4e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1766  ATPase  50.46 
 
 		 228 aa  222  4e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104306  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  49.32 
 
 		 225 aa  222  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  50 
 
 		 646 aa  222  4e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  46.82 
 
 		 226 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  46.82 
 
 		 226 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>