More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1339 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1339  ATPase  100 
 
 
232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0796  ABC transporter related  70.09 
 
 
299 aa  301  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2955  ABC transporter related  70.54 
 
 
250 aa  301  8.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.176786 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0269  ABC-type transport system, ATP-binding component  61.36 
 
 
227 aa  275  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  53.42 
 
 
228 aa  242  3e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  50.66 
 
 
239 aa  240  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  50.89 
 
 
232 aa  238  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  52.23 
 
 
230 aa  236  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 
230 aa  235  4e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  48.88 
 
 
252 aa  234  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  50.92 
 
 
226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  49.55 
 
 
260 aa  230  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  50.68 
 
 
240 aa  230  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  52.75 
 
 
228 aa  230  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  50.23 
 
 
226 aa  229  3e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  51.83 
 
 
229 aa  229  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  49.33 
 
 
242 aa  228  5e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  49.31 
 
 
228 aa  228  6e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  47.25 
 
 
230 aa  226  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1766  ATPase  48.89 
 
 
228 aa  226  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104306  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  49.12 
 
 
227 aa  226  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04881  ABC transporter ATP-binding protein  49.77 
 
 
235 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  49.32 
 
 
244 aa  225  4e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  50.92 
 
 
653 aa  225  6e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1767  ATPase  49.77 
 
 
248 aa  224  7e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  50 
 
 
236 aa  224  7e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  50.23 
 
 
238 aa  224  8e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  48.17 
 
 
224 aa  224  9e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 
224 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  47.71 
 
 
224 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  47.71 
 
 
224 aa  224  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  48.2 
 
 
233 aa  223  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  47.09 
 
 
259 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  48.57 
 
 
228 aa  223  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  47.25 
 
 
224 aa  223  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  47.03 
 
 
228 aa  223  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04581  ABC transporter ATP-binding protein  47.69 
 
 
228 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  49.55 
 
 
233 aa  223  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  47.25 
 
 
224 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  47.25 
 
 
224 aa  223  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04891  ABC transporter ATP-binding protein  47.69 
 
 
228 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  48.67 
 
 
266 aa  222  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  50.46 
 
 
228 aa  222  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  47.25 
 
 
224 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  46.79 
 
 
224 aa  223  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  47.98 
 
 
236 aa  222  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0433  ATPase  47.64 
 
 
228 aa  222  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.526748  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4456  ABC transporter related protein  50.44 
 
 
239 aa  222  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  47.49 
 
 
232 aa  221  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  49.1 
 
 
233 aa  221  6e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  48.86 
 
 
248 aa  221  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  48.86 
 
 
248 aa  221  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  47.49 
 
 
246 aa  221  7e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  47.25 
 
 
224 aa  221  7e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  48.66 
 
 
229 aa  221  9e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1414  ATPase  50 
 
 
241 aa  221  9e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  46.82 
 
 
238 aa  221  9e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  49.1 
 
 
228 aa  220  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  45.74 
 
 
252 aa  221  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  50.45 
 
 
248 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  46.79 
 
 
224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  50.22 
 
 
658 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  51.12 
 
 
238 aa  219  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  50.45 
 
 
291 aa  219  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  46.33 
 
 
235 aa  219  3e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  49.78 
 
 
253 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  46.67 
 
 
230 aa  219  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  48.68 
 
 
654 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  47.49 
 
 
240 aa  219  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  47.49 
 
 
228 aa  219  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  47.79 
 
 
235 aa  219  3.9999999999999997e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  49.78 
 
 
253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  48.86 
 
 
228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  45.87 
 
 
224 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  45.33 
 
 
229 aa  218  5e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  48.18 
 
 
240 aa  218  5e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  49.55 
 
 
253 aa  218  6e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  49.77 
 
 
657 aa  218  6e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  50.67 
 
 
668 aa  218  6e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  50.67 
 
 
668 aa  218  6e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  48.4 
 
 
645 aa  218  7e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  48.17 
 
 
234 aa  218  7e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  47.53 
 
 
228 aa  217  8.999999999999998e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  48.4 
 
 
661 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  49.32 
 
 
656 aa  217  1e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  48.68 
 
 
657 aa  217  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06281  ABC transporter ATP-binding protein  47.11 
 
 
246 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0807317 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  47.71 
 
 
234 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  48.42 
 
 
234 aa  216  2e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  44 
 
 
254 aa  216  2.9999999999999998e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  47.71 
 
 
234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  47.89 
 
 
234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  47.89 
 
 
234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  46.79 
 
 
226 aa  215  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  49.55 
 
 
715 aa  215  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  47.03 
 
 
237 aa  215  5e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  46.85 
 
 
239 aa  214  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  47.49 
 
 
247 aa  214  7e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  45.79 
 
 
235 aa  214  8e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  47.58 
 
 
652 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>