More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1457 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  100 
 
 		 228 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  79.74 
 
 		 231 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  80.18 
 
 		 229 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  78.41 
 
 		 231 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  78.85 
 
 		 229 aa  370  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  76.21 
 
 		 231 aa  352  4e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  73.52 
 
 		 230 aa  335  2.9999999999999997e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  71.49 
 
 		 234 aa  328  4e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  71.82 
 
 		 230 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  70.14 
 
 		 235 aa  314  7e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0230  ABC transporter related  70.48 
 
 		 232 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000298 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  69.09 
 
 		 268 aa  310  1e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0222  ABC transporter related  69.91 
 
 		 232 aa  310  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0303  ABC transporter related  70.67 
 
 		 232 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0537962  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3402  ABC efflux pump, ATPase subunit  70.35 
 
 		 232 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0029159  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2803  ABC transporter related  70.22 
 
 		 232 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0893633  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0206  ABC transporter related  71.24 
 
 		 232 aa  307  9e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  unclonable  0.000000000007713 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0284  ABC transporter related  70.67 
 
 		 232 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  hitchhiker  0.00000395766 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  65.09 
 
 		 235 aa  306  3e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  56.64 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  59.45 
 
 		 231 aa  267  1e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  59.36 
 
 		 229 aa  266  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  57.89 
 
 		 232 aa  266  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1620  ABC transporter, ATPase subunit  57.14 
 
 		 241 aa  262  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  57.99 
 
 		 229 aa  258  4e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  56.22 
 
 		 235 aa  257  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  56.42 
 
 		 225 aa  255  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2260  ABC transporter related  54.02 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2582  ABC transporter related  53.57 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  51.15 
 
 		 242 aa  218  6e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  47.95 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  47.03 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  46.82 
 
 		 221 aa  213  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  47.73 
 
 		 266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  48.28 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 229 aa  211  7e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  48.9 
 
 		 233 aa  211  7e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  44.8 
 
 		 246 aa  211  7e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  47.53 
 
 		 233 aa  211  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  45 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  42.66 
 
 		 233 aa  209  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  46.12 
 
 		 226 aa  209  4e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  46.33 
 
 		 237 aa  208  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1802  ABC transporter related  45 
 
 		 234 aa  208  5e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  46.33 
 
 		 237 aa  208  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  47.03 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  42.53 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 		 222 aa  207  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0367  ABC transporter related  50.46 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3939  ABC transporter, ATPase subunit  45.87 
 
 		 236 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.920707  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  47.93 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  47.93 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  45.91 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  44.55 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  45.54 
 
 		 232 aa  206  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  45.21 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  47.2 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  44.29 
 
 		 237 aa  205  4e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  46.15 
 
 		 236 aa  205  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  44.34 
 
 		 251 aa  205  4e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  48.67 
 
 		 238 aa  205  5e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.66 
 
 		 264 aa  204  6e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0380  ABC transporter, ATP-binding protein  45.25 
 
 		 253 aa  205  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  47.77 
 
 		 250 aa  205  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  43.5 
 
 		 248 aa  204  6e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  44.34 
 
 		 242 aa  204  7e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  47.03 
 
 		 239 aa  203  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  43.32 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  47.39 
 
 		 388 aa  203  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  45.54 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  46.12 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  44.8 
 
 		 252 aa  202  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  49.25 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  47.12 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  43.12 
 
 		 240 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 		 224 aa  202  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 		 224 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  46.12 
 
 		 230 aa  202  5e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3418  ABC transporter-related protein  45 
 
 		 266 aa  201  6e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0483067  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0199  ABC transporter related  45.45 
 
 		 291 aa  201  6e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.500002  normal  0.26855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  44.14 
 
 		 230 aa  201  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  46.15 
 
 		 228 aa  201  6e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  46.54 
 
 		 228 aa  201  7e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  46.12 
 
 		 238 aa  201  7e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  44.8 
 
 		 220 aa  201  8e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3285  ABC transporter related  47.3 
 
 		 249 aa  201  8e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  45 
 
 		 258 aa  201  9e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  47.6 
 
 		 224 aa  201  9e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4576  ABC transporter related  44.34 
 
 		 253 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  46.63 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  46.63 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  46.63 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4881  ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 		 253 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  45.83 
 
 		 388 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  47.8 
 
 		 226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  46.63 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  42.66 
 
 		 240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>