More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0035 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  100 
 
 		 225 aa  456  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  64.25 
 
 		 242 aa  295  3e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  55.71 
 
 		 225 aa  250  2e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  55.71 
 
 		 225 aa  250  2e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  52.94 
 
 		 231 aa  231  9e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  50.23 
 
 		 224 aa  224  1e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  47.51 
 
 		 224 aa  218  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  52.94 
 
 		 238 aa  216  2e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0021  ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  45.78 
 
 		 227 aa  210  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  49.78 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  43.05 
 
 		 227 aa  209  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2724  ABC transporter related  45.29 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2781  ABC transporter related  45.29 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  43.44 
 
 		 227 aa  208  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  47.09 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  44.2 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  47.2 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1445  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.12 
 
 		 247 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  46.85 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  46.5 
 
 		 217 aa  204  8e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  46.67 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  49.32 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1291  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  45.05 
 
 		 235 aa  203  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.286185 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.09 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.09 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.09 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.09 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.09 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  48.89 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0964  ABC transporter related  42.99 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.64 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  45.33 
 
 		 228 aa  202  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  46.64 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.64 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  44.64 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.64 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.64 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  48.87 
 
 		 241 aa  202  3e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.64 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  44.64 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  46.4 
 
 		 238 aa  202  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  43.24 
 
 		 246 aa  202  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.64 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  43.75 
 
 		 259 aa  202  3e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  45.54 
 
 		 251 aa  202  4e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  45 
 
 		 229 aa  202  4e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  46.22 
 
 		 246 aa  202  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 262 aa  202  5e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  49.32 
 
 		 241 aa  201  5e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.64 
 
 		 233 aa  202  5e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  46.82 
 
 		 219 aa  201  6e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  44.64 
 
 		 235 aa  201  8e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  47.51 
 
 		 249 aa  201  9e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  43.24 
 
 		 227 aa  201  9e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.84 
 
 		 225 aa  201  9e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  44.39 
 
 		 240 aa  200  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0119  ABC transporter  45.29 
 
 		 256 aa  200  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.393598  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7810  ABC transporter related  44.84 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.24 
 
 		 227 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0282  ABC transporter, ATP-binding protein  44.5 
 
 		 223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  44.25 
 
 		 239 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.64 
 
 		 233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  43.48 
 
 		 277 aa  199  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  48.67 
 
 		 230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0118  ABC transporter, ATP-binding protein  44.84 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  48.54 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  48 
 
 		 222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.41 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1692  ABC transporter, ATP-binding protein  44.84 
 
 		 219 aa  199  3e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.623229 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0314  ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.924183  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2307  ABC transporter ATP-binding protein  47.77 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00152592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2275  ABC transporter, ATP-binding protein  47.77 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000136172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2482  ABC transporter ATP-binding protein  47.77 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000750966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2503  ABC transporter, ATP-binding protein  47.77 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  43.11 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  42.54 
 
 		 280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  48.5 
 
 		 247 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14700  lipoprotein-releasing ABC transporter  43.05 
 
 		 232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.072484  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  44.44 
 
 		 229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.09 
 
 		 264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  44.34 
 
 		 235 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  47.32 
 
 		 230 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  44.89 
 
 		 227 aa  198  5e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  43.52 
 
 		 268 aa  198  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  44.64 
 
 		 238 aa  198  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  45.74 
 
 		 226 aa  198  5e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  42.29 
 
 		 233 aa  198  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3858  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.95 
 
 		 232 aa  198  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  47.27 
 
 		 240 aa  198  5e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  45.45 
 
 		 229 aa  198  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 		 221 aa  198  5e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  43.36 
 
 		 253 aa  198  5e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  45 
 
 		 229 aa  198  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2110  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  44.8 
 
 		 227 aa  197  7e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327519  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  42.15 
 
 		 249 aa  197  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0939  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.75 
 
 		 233 aa  198  7e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 		 240 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 		 240 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>