More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2281 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  100 
 
 
235 aa  484  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  66.38 
 
 
235 aa  325  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  69.26 
 
 
240 aa  323  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  68.83 
 
 
236 aa  318  3.9999999999999996e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  67.97 
 
 
244 aa  318  5e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  64.94 
 
 
238 aa  314  9e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  68.26 
 
 
241 aa  313  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  65.09 
 
 
245 aa  308  4e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  64.22 
 
 
244 aa  308  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  63.79 
 
 
244 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  63.79 
 
 
248 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  66.52 
 
 
236 aa  304  7e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  66.09 
 
 
241 aa  301  5.000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  64.38 
 
 
251 aa  301  7.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  69.3 
 
 
250 aa  301  7.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  63.4 
 
 
235 aa  299  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  62.66 
 
 
240 aa  298  4e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  62.07 
 
 
245 aa  295  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  62.77 
 
 
254 aa  294  8e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  62.55 
 
 
240 aa  293  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  58.55 
 
 
244 aa  289  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  59.91 
 
 
236 aa  288  4e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  60.78 
 
 
253 aa  286  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  60.43 
 
 
245 aa  286  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  58.87 
 
 
248 aa  285  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  58.12 
 
 
251 aa  284  8e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  59.48 
 
 
238 aa  282  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  59.31 
 
 
245 aa  278  4e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  60.85 
 
 
238 aa  278  6e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  57.33 
 
 
253 aa  275  6e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  56.65 
 
 
234 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  56.71 
 
 
244 aa  272  3e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  59.31 
 
 
234 aa  272  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  59.05 
 
 
243 aa  272  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  57.08 
 
 
234 aa  270  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  57.08 
 
 
234 aa  270  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  50.21 
 
 
239 aa  251  7e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  51.77 
 
 
233 aa  249  3e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  51.33 
 
 
233 aa  247  1e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  51.57 
 
 
233 aa  246  2e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  50.22 
 
 
233 aa  246  3e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  49.34 
 
 
233 aa  244  8e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  52.38 
 
 
236 aa  244  9e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  50 
 
 
235 aa  244  9.999999999999999e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  48.9 
 
 
233 aa  243  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  48.93 
 
 
234 aa  243  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  51.28 
 
 
236 aa  240  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  48.23 
 
 
234 aa  240  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  47.14 
 
 
233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  48.92 
 
 
234 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  50.88 
 
 
233 aa  236  3e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  52.91 
 
 
236 aa  235  4e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  48.92 
 
 
232 aa  234  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  48.02 
 
 
233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  48.67 
 
 
236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  49.78 
 
 
233 aa  230  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  49.78 
 
 
233 aa  230  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  50.88 
 
 
233 aa  229  3e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  50.45 
 
 
233 aa  228  6e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  46.02 
 
 
234 aa  224  7e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  46.05 
 
 
232 aa  223  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  47.35 
 
 
232 aa  224  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  44.02 
 
 
604 aa  221  9e-57  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 
345 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.02 
 
 
233 aa  214  8e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.86 
 
 
236 aa  214  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  48.86 
 
 
288 aa  212  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  46.19 
 
 
230 aa  211  5.999999999999999e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  50.68 
 
 
277 aa  208  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  46.26 
 
 
243 aa  207  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  47.81 
 
 
230 aa  205  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  45.45 
 
 
220 aa  205  6e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  45.74 
 
 
255 aa  204  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  48.37 
 
 
252 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  47.53 
 
 
247 aa  204  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  45.45 
 
 
234 aa  203  2e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0133  ABC Transporter  42.02 
 
 
300 aa  203  2e-51  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.36 
 
 
234 aa  202  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  44.68 
 
 
246 aa  202  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  43.64 
 
 
240 aa  202  5e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  45.16 
 
 
223 aa  201  7e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  45.45 
 
 
234 aa  201  7e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  48.88 
 
 
256 aa  201  9e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2221  ABC transporter related  49.77 
 
 
252 aa  201  9e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  46.19 
 
 
237 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  43.33 
 
 
247 aa  200  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  46.61 
 
 
230 aa  200  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  43.75 
 
 
242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  43.86 
 
 
286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  45.37 
 
 
256 aa  199  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  43.16 
 
 
252 aa  198  5e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2540  ABC transporter related  44.89 
 
 
241 aa  198  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.656818  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 
232 aa  198  6e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0277  ABC transporter related protein  46.46 
 
 
334 aa  198  6e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  44.64 
 
 
241 aa  198  6e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  43.72 
 
 
238 aa  198  7e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  44.49 
 
 
235 aa  198  7e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  46.85 
 
 
234 aa  198  7e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  46.54 
 
 
225 aa  198  7e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  44.75 
 
 
235 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>