More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0277 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0277  ABC transporter related protein  100 
 
 
334 aa  676    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0179  AbrB family transcriptional regulator  65.82 
 
 
328 aa  422  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4355  AbrB family transcriptional regulator  68.69 
 
 
329 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  51.52 
 
 
565 aa  304  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  50.64 
 
 
563 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0956  ABC transporter related protein  51.92 
 
 
346 aa  288  1e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.121187  hitchhiker  0.00122332 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1768  ABC transporter related  50.88 
 
 
315 aa  286  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4171  ABC transporter related  52.45 
 
 
339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2804  ABC transporter related protein  51.72 
 
 
366 aa  282  7.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.403241  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26110  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  49.12 
 
 
340 aa  267  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.157431  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1556  ABC transporter related  49.64 
 
 
317 aa  251  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.798364  normal  0.757355 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0791  ABC transporter related  41.55 
 
 
311 aa  222  9e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  49.55 
 
 
220 aa  220  3e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  50.45 
 
 
234 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  50.45 
 
 
234 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  46.7 
 
 
232 aa  212  7e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  45.42 
 
 
246 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  50 
 
 
230 aa  210  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  49.55 
 
 
252 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  47.09 
 
 
241 aa  208  8e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  49.32 
 
 
230 aa  209  8e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  45.05 
 
 
235 aa  208  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  48.18 
 
 
252 aa  206  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  47.22 
 
 
225 aa  206  4e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  45.81 
 
 
228 aa  206  5e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  45.22 
 
 
230 aa  206  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  45.85 
 
 
239 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  45.95 
 
 
237 aa  204  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  47.75 
 
 
239 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  47.95 
 
 
237 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  46.43 
 
 
237 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  46.61 
 
 
238 aa  204  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  45.81 
 
 
232 aa  204  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  49.09 
 
 
254 aa  203  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  47.11 
 
 
233 aa  203  4e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  45.18 
 
 
229 aa  203  4e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  43.23 
 
 
228 aa  202  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  48.23 
 
 
253 aa  202  8e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  44.83 
 
 
250 aa  202  8e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  45 
 
 
229 aa  202  9e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.42 
 
 
233 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  48.23 
 
 
253 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  43.23 
 
 
227 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.98 
 
 
233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.98 
 
 
233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.98 
 
 
233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  43.1 
 
 
236 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.98 
 
 
233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.98 
 
 
233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.89 
 
 
236 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  47.53 
 
 
248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  47.53 
 
 
248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  48.11 
 
 
231 aa  200  3.9999999999999996e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  41.42 
 
 
238 aa  199  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  42.98 
 
 
232 aa  199  5e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  45.13 
 
 
233 aa  199  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  45.7 
 
 
248 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  46.43 
 
 
240 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.98 
 
 
233 aa  198  9e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.98 
 
 
233 aa  198  9e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.98 
 
 
233 aa  198  9e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  41.92 
 
 
235 aa  198  9e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.98 
 
 
233 aa  198  9e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  42.98 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.98 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  46.43 
 
 
240 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  46.46 
 
 
235 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  44.84 
 
 
236 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  45.66 
 
 
226 aa  198  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  42.98 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  46.43 
 
 
240 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.5 
 
 
234 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  43.3 
 
 
225 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  44.05 
 
 
233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1061  ABC transporter related  47.37 
 
 
239 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.691054  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  46.05 
 
 
220 aa  197  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0955  ABC transporter related protein  47.51 
 
 
240 aa  197  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0487401  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.5 
 
 
234 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.5 
 
 
234 aa  197  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2730  ABC transporter related  47.11 
 
 
225 aa  197  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  42.73 
 
 
229 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.98 
 
 
233 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0678  ABC transporter, ATP-binding protein  49.34 
 
 
225 aa  196  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.586556  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2827  ABC transporter related  45.09 
 
 
243 aa  196  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.67 
 
 
258 aa  196  6e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  44 
 
 
226 aa  196  6e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2200  ABC transporter-related protein  44.26 
 
 
229 aa  196  6e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  45.54 
 
 
241 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  44.75 
 
 
223 aa  195  8.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  43.48 
 
 
247 aa  195  9e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  49.77 
 
 
236 aa  195  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  45.29 
 
 
287 aa  195  9e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  45.41 
 
 
236 aa  195  9e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  46.44 
 
 
259 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  43.69 
 
 
226 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  45.91 
 
 
239 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  44.89 
 
 
252 aa  195  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  45.09 
 
 
236 aa  195  1e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  43.86 
 
 
242 aa  195  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1473  ABC-transporter ATP binding protein  45.91 
 
 
233 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>