More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2540 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2540  ABC transporter related  100 
 
 
241 aa  490  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.656818  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1291  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  53.07 
 
 
235 aa  246  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.286185 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  51.12 
 
 
237 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  51.12 
 
 
237 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3939  ABC transporter, ATPase subunit  50.67 
 
 
236 aa  225  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.920707  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  50 
 
 
237 aa  221  9e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  48.64 
 
 
237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.46 
 
 
234 aa  219  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  47.77 
 
 
291 aa  215  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  51.15 
 
 
239 aa  215  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6690  ABC transporter, ATPase subunit  50.23 
 
 
234 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810231  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  49.33 
 
 
238 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2507  ABC transporter related  46.88 
 
 
231 aa  212  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  46.12 
 
 
240 aa  211  7e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  47.53 
 
 
230 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  47.53 
 
 
235 aa  210  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2375  ABC-type transport system, ATPase component  45.13 
 
 
229 aa  210  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797432  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  47.71 
 
 
235 aa  210  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  45.45 
 
 
231 aa  209  3e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  47.53 
 
 
227 aa  209  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  45.09 
 
 
238 aa  209  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3285  ABC transporter related  49.32 
 
 
249 aa  208  5e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29510  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  49.33 
 
 
250 aa  208  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  46.88 
 
 
230 aa  208  6e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  46.64 
 
 
232 aa  207  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  43.09 
 
 
247 aa  207  1e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4354  ABC transporter related  46.09 
 
 
230 aa  206  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  42.92 
 
 
240 aa  206  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  45.09 
 
 
225 aa  206  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  45.98 
 
 
228 aa  206  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  45.09 
 
 
238 aa  206  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.49 
 
 
242 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.49 
 
 
242 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0199  ABC transporter related  49.11 
 
 
291 aa  205  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.500002  normal  0.26855 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  44.26 
 
 
239 aa  205  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  44.84 
 
 
237 aa  205  5e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  45.05 
 
 
230 aa  205  6e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  47.98 
 
 
244 aa  205  6e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  45.29 
 
 
238 aa  205  6e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  43.57 
 
 
246 aa  204  7e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  43.78 
 
 
653 aa  204  7e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  48.39 
 
 
230 aa  204  8e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  46.64 
 
 
248 aa  204  9e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  45.26 
 
 
244 aa  204  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  44.59 
 
 
249 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  45.05 
 
 
225 aa  204  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  45.05 
 
 
240 aa  204  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  45.98 
 
 
239 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  45.05 
 
 
225 aa  204  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  43.05 
 
 
230 aa  204  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 
224 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2086  ABC transporter, ATP-binding protein  45.54 
 
 
233 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2377  ABC transporter, ATP-binding protein  45.54 
 
 
233 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  45.92 
 
 
246 aa  203  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  46.26 
 
 
235 aa  203  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0367  ABC transporter related  49.1 
 
 
244 aa  203  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 
224 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  45.78 
 
 
226 aa  203  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1113  ABC transporter, ATP-binding protein  45.54 
 
 
233 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1392  ABC transporter, ATP-binding protein  45.54 
 
 
233 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  44.24 
 
 
221 aa  202  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  45.74 
 
 
246 aa  202  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  44.14 
 
 
252 aa  202  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  45 
 
 
228 aa  202  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  43.69 
 
 
224 aa  201  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  43.69 
 
 
224 aa  201  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  44.39 
 
 
247 aa  201  6e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 
224 aa  201  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 
224 aa  201  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  44.59 
 
 
230 aa  201  7e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  45.5 
 
 
222 aa  201  7e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  42.73 
 
 
227 aa  201  8e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  43.69 
 
 
224 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2345  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 
233 aa  201  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3144  ABC transporter, ATP-binding protein  45.09 
 
 
233 aa  201  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1473  ABC-transporter ATP binding protein  45.09 
 
 
233 aa  201  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3258  ABC transporter, ATP-binding protein  45.09 
 
 
233 aa  201  9e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.219344  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2437  ABC transporter related  48.17 
 
 
231 aa  201  9e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  45.5 
 
 
234 aa  201  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  43.95 
 
 
236 aa  201  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5302  ABC transporter related  45.98 
 
 
234 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.155471  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  43.24 
 
 
224 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.59 
 
 
234 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.59 
 
 
234 aa  200  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1950  ABC transporter related  47.2 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458128  normal  0.0230529 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.59 
 
 
234 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  44.59 
 
 
260 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2019  ABC transporter related protein  43.11 
 
 
228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0275435  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  45.62 
 
 
228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  45.5 
 
 
653 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.63 
 
 
227 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  42.47 
 
 
232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3410  ABC transporter, ATPase subunit  44.87 
 
 
239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.072759  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  43.84 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  45.78 
 
 
715 aa  199  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1100  ABC transporter related  46.85 
 
 
236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  47.11 
 
 
668 aa  199  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  47.11 
 
 
668 aa  199  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0284  ABC transporter related  47.53 
 
 
232 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  hitchhiker  0.00000395766 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0060  ABC transporter related  46.61 
 
 
232 aa  199  3e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>