More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2874 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  100 
 
 
236 aa  481  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  66.53 
 
 
236 aa  325  3e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  54.89 
 
 
244 aa  282  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  55.6 
 
 
251 aa  280  9e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  55.08 
 
 
244 aa  279  2e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  59.19 
 
 
244 aa  276  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  59.19 
 
 
244 aa  276  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  55.13 
 
 
245 aa  273  1.0000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  58.74 
 
 
248 aa  273  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  56.89 
 
 
254 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  55.41 
 
 
253 aa  271  9e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  55.93 
 
 
239 aa  270  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  55.26 
 
 
236 aa  269  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  57.14 
 
 
235 aa  266  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  55.51 
 
 
236 aa  265  5.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  56.17 
 
 
244 aa  264  8e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  53.68 
 
 
234 aa  264  8.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  51.95 
 
 
234 aa  264  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  57.33 
 
 
238 aa  263  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  52.61 
 
 
234 aa  263  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  54.7 
 
 
240 aa  263  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  53.88 
 
 
248 aa  262  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  55.08 
 
 
236 aa  261  4.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  53.45 
 
 
232 aa  261  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  56.89 
 
 
236 aa  261  6.999999999999999e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  55.16 
 
 
233 aa  261  1e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  53.25 
 
 
240 aa  260  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  56.76 
 
 
234 aa  259  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  56.76 
 
 
234 aa  259  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  53.25 
 
 
243 aa  260  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.11 
 
 
233 aa  258  4e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  52.54 
 
 
236 aa  258  4e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  52.16 
 
 
238 aa  258  5.0000000000000005e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  53.68 
 
 
253 aa  258  7e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  57.78 
 
 
241 aa  255  4e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  51.52 
 
 
233 aa  254  6e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  56.89 
 
 
245 aa  254  6e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  53.78 
 
 
245 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  52.44 
 
 
233 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  52.44 
 
 
233 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  49.78 
 
 
233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  52.79 
 
 
234 aa  252  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  48.26 
 
 
233 aa  252  4.0000000000000004e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  53.12 
 
 
233 aa  251  5.000000000000001e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  52.38 
 
 
238 aa  251  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  53.25 
 
 
251 aa  250  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  55.5 
 
 
234 aa  250  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  53.04 
 
 
233 aa  249  2e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  51.3 
 
 
233 aa  249  3e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  53.28 
 
 
241 aa  248  6e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  50.87 
 
 
245 aa  247  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  51.72 
 
 
234 aa  246  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  52.38 
 
 
235 aa  244  9e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  50.87 
 
 
233 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  51.74 
 
 
233 aa  242  5e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  48.28 
 
 
232 aa  241  9e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  48.92 
 
 
233 aa  240  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  48.28 
 
 
232 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  53.45 
 
 
240 aa  239  4e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  52 
 
 
235 aa  234  8e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  53.78 
 
 
250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  48.71 
 
 
235 aa  232  4.0000000000000004e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.61 
 
 
236 aa  229  3e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  42.98 
 
 
604 aa  221  6e-57  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 
345 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.26 
 
 
233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  48.88 
 
 
243 aa  204  7e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  45.61 
 
 
231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  43.72 
 
 
242 aa  198  7e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  43.1 
 
 
235 aa  196  3e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  48.42 
 
 
234 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  48.42 
 
 
234 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  46.15 
 
 
247 aa  194  7e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  45.95 
 
 
239 aa  194  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4336  ABC transporter related  50.46 
 
 
268 aa  192  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  44.14 
 
 
229 aa  192  4e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  47.06 
 
 
225 aa  191  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  43.75 
 
 
229 aa  191  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  44.05 
 
 
230 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  42.31 
 
 
644 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  44.2 
 
 
230 aa  190  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  43.61 
 
 
237 aa  189  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 
229 aa  189  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  43.75 
 
 
237 aa  188  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0968  ABC transporter related  49.08 
 
 
254 aa  188  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0806647  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  46.45 
 
 
266 aa  188  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  46.79 
 
 
255 aa  188  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 
224 aa  188  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  44.44 
 
 
231 aa  188  7e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  43.17 
 
 
235 aa  188  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 
228 aa  187  9e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0437  ABC transporter related protein  45.7 
 
 
229 aa  187  9e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  42.15 
 
 
228 aa  187  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  43.64 
 
 
230 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  43.05 
 
 
225 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  40.51 
 
 
648 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  45.25 
 
 
230 aa  186  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  41.33 
 
 
235 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  40.99 
 
 
240 aa  186  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  41.28 
 
 
230 aa  186  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>