More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0968 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0968  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  498  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0806647  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4336  ABC transporter related  73.08 
 
 		 268 aa  330  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  44.07 
 
 		 233 aa  204  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  48.52 
 
 		 245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  44.09 
 
 		 225 aa  198  7e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  48.03 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  47.44 
 
 		 240 aa  195  6e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  43.38 
 
 		 234 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  46.64 
 
 		 244 aa  194  9e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  47.66 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  43.75 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  49.77 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.91 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0951  ABC transporter related  48.03 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  49.53 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  47.27 
 
 		 652 aa  193  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  48.86 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  44 
 
 		 654 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  43.38 
 
 		 234 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  42.73 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 253 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  43.56 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  44.02 
 
 		 234 aa  193  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  49.75 
 
 		 408 aa  192  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  43.64 
 
 		 233 aa  192  5e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  46.55 
 
 		 251 aa  192  5e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  44.14 
 
 		 227 aa  192  6e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  47.93 
 
 		 234 aa  192  6e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  47.93 
 
 		 234 aa  192  6e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  44.84 
 
 		 671 aa  191  7e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  43.05 
 
 		 653 aa  191  8e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  47.22 
 
 		 233 aa  191  9e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  47.22 
 
 		 253 aa  191  9e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  49.29 
 
 		 254 aa  191  9e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  44.39 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  45.21 
 
 		 231 aa  191  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  43.05 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  43.64 
 
 		 228 aa  191  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.16 
 
 		 245 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  46.54 
 
 		 244 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  38.98 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  43.62 
 
 		 650 aa  190  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  45.25 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  49.56 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  42.17 
 
 		 652 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  48.87 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.54 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  44.09 
 
 		 227 aa  189  5e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  41.88 
 
 		 233 aa  188  5.999999999999999e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  42.22 
 
 		 232 aa  188  5.999999999999999e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  49.08 
 
 		 236 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  50.24 
 
 		 240 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  44.91 
 
 		 234 aa  188  7e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  40.87 
 
 		 235 aa  188  9e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  49.15 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  41.74 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  51.18 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  43.93 
 
 		 661 aa  187  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  48.92 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  49.76 
 
 		 238 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  51.67 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  47 
 
 		 228 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  41.45 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  42.26 
 
 		 244 aa  186  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  46.3 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  49.76 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  41.03 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  41.56 
 
 		 345 aa  186  3e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  46.19 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  48.34 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  46.19 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 		 233 aa  186  4e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  48.18 
 
 		 651 aa  186  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  43.5 
 
 		 228 aa  186  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  46.36 
 
 		 253 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  44.09 
 
 		 644 aa  186  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  46.36 
 
 		 253 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  42.92 
 
 		 266 aa  185  6e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  44.21 
 
 		 288 aa  185  6e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  46.58 
 
 		 241 aa  185  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  44.21 
 
 		 248 aa  185  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  48.82 
 
 		 245 aa  185  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  48.03 
 
 		 243 aa  185  6e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  43.24 
 
 		 236 aa  185  7e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  49.3 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  44.93 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  46.26 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1657  ABC transporter related  46.29 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  41.36 
 
 		 643 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  42.79 
 
 		 225 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  41.95 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  43.72 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  50.72 
 
 		 244 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  43.75 
 
 		 652 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  46.3 
 
 		 217 aa  183  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  45.21 
 
 		 277 aa  183  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  43.64 
 
 		 234 aa  183  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  41.82 
 
 		 228 aa  183  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>